MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 11958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021554	ATG	2	6	2732174	2732179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_021554	AAT	2	6	2732195	2732200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_021554	AATA	2	8	2732238	2732245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_021554	CAAT	2	8	2732272	2732279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_021554	CAT	2	6	2732309	2732314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_021554	TTA	2	6	2732315	2732320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_021554	ATT	2	6	2733960	2733965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_021554	TAA	2	6	2734002	2734007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_021554	TAA	3	9	2734044	2734052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021554	ATT	2	6	2734083	2734088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_021554	TA	3	6	2734096	2734101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_021554	ATA	2	6	2734111	2734116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_021554	AAC	2	6	2734139	2734144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_021554	TTA	2	6	2734212	2734217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_021554	CTTC	2	8	2734259	2734266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_021554	T	6	6	2734296	2734301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_021554	A	6	6	2734302	2734307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_021554	AT	3	6	2734364	2734369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_021554	TTA	2	6	2734388	2734393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_021554	AAG	2	6	2734420	2734425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_021554	CTT	2	6	2736855	2736860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_021554	TA	3	6	2736863	2736868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_021554	TA	4	8	2736896	2736903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_021554	TTA	2	6	2736918	2736923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_021554	TTA	2	6	2736949	2736954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_021554	ATT	2	6	2736984	2736989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_021554	CGTC	2	8	2737019	2737026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_021554	ATT	2	6	2737048	2737053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_021554	ATT	2	6	2737071	2737076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_021554	ATT	2	6	2738463	2738468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_021554	ATA	2	6	2738521	2738526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021554	T	6	6	2738537	2738542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_021554	T	6	6	2738576	2738581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_021554	TCCTG	2	10	2738648	2738657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11535	NC_021554	TAT	2	6	2738682	2738687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11538	NC_021554	ATT	2	6	2738851	2738856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_021554	GCC	2	6	2738871	2738876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_021554	GTTAAA	2	12	2738902	2738913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_021554	AAG	2	6	2738916	2738921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_021554	TA	3	6	2739569	2739574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_021554	CAT	2	6	2739581	2739586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11545	NC_021554	T	6	6	2741537	2741542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_021554	T	6	6	2741560	2741565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11548	NC_021554	TTA	2	6	2741697	2741702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_021554	ATAC	2	8	2741703	2741710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11550	NC_021554	GTT	2	6	2741722	2741727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_021554	T	6	6	2741729	2741734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_021554	TATT	2	8	2741741	2741748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021554	CCT	2	6	2741810	2741815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_021554	CAT	2	6	2741834	2741839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_021554	T	6	6	2742403	2742408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_021554	AC	3	6	2742468	2742473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_021554	TA	3	6	2742476	2742481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_021554	AC	3	6	2742500	2742505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11559	NC_021554	ATAA	2	8	2742507	2742514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_021554	TGT	2	6	2742527	2742532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_021554	T	6	6	2742558	2742563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_021554	TTA	2	6	2742577	2742582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_021554	AAT	2	6	2742584	2742589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11565	NC_021554	CATA	2	8	2742724	2742731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11566	NC_021554	TTA	2	6	2742833	2742838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11569	NC_021554	AC	3	6	2742891	2742896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11574	NC_021554	ATT	2	6	2743002	2743007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_021554	ATT	2	6	2743010	2743015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11577	NC_021554	T	6	6	2743058	2743063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_021554	AAT	2	6	2743215	2743220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_021554	AT	3	6	2743237	2743242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_021554	AT	3	6	2743422	2743427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_021554	GTA	2	6	2743434	2743439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11583	NC_021554	GTAT	2	8	2743487	2743494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_021554	TCA	2	6	2743537	2743542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11588	NC_021554	TA	3	6	2743634	2743639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_021554	TA	3	6	2743647	2743652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_021554	AAC	2	6	2743692	2743697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11592	NC_021554	TAATA	2	10	2743766	2743775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_021554	TGAT	2	8	2743794	2743801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_021554	A	7	7	2746615	2746621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11599	NC_021554	TTCTA	2	10	2748515	2748524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11600	NC_021554	AT	4	8	2748547	2748554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_021554	AGG	2	6	2748657	2748662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_021554	A	7	7	2750100	2750106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_021554	ACA	2	6	2750119	2750124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11609	NC_021554	TAT	2	6	2750313	2750318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_021554	T	6	6	2750334	2750339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_021554	TAA	2	6	2750867	2750872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_021554	ATG	2	6	2750896	2750901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_021554	T	6	6	2750940	2750945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11616	NC_021554	A	7	7	2751909	2751915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_021554	A	6	6	2751939	2751944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_021554	ATA	2	6	2754944	2754949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_021554	A	7	7	2754970	2754976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_021554	TTC	2	6	2754993	2754998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_021554	TA	3	6	2755004	2755009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_021554	TAAC	2	8	2755026	2755033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11625	NC_021554	TAAC	2	8	2755144	2755151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11626	NC_021554	TCA	2	6	2755164	2755169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11631	NC_021554	TTA	2	6	2759560	2759565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11632	NC_021554	TCC	2	6	2760811	2760816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11639	NC_021554	ATGA	2	8	2761033	2761040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11654	NC_021554	TA	3	6	2761957	2761962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11655	NC_021554	CCA	2	6	2762549	2762554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11662	NC_021554	TTCTT	2	10	2763620	2763629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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11883	NC_021554	AATC	2	8	2832902	2832909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11895	NC_021554	TA	4	8	2834973	2834980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11896	NC_021554	A	6	6	2834985	2834990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11897	NC_021554	TA	3	6	2835017	2835022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11898	NC_021554	AAT	2	6	2835026	2835031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11899	NC_021554	AT	3	6	2835121	2835126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11900	NC_021554	ATC	2	6	2836161	2836166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11901	NC_021554	TAT	2	6	2836171	2836176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11902	NC_021554	CT	3	6	2836219	2836224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11903	NC_021554	TCTA	2	8	2836279	2836286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11905	NC_021554	ACTT	2	8	2837204	2837211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11906	NC_021554	T	6	6	2837229	2837234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11908	NC_021554	A	6	6	2837356	2837361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11912	NC_021554	CTT	2	6	2838013	2838018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11913	NC_021554	TAT	2	6	2838039	2838044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11914	NC_021554	AAT	2	6	2838132	2838137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11916	NC_021554	GCT	2	6	2838222	2838227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11917	NC_021554	ATT	3	9	2838234	2838242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11921	NC_021554	ATTT	2	8	2841276	2841283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11922	NC_021554	AGC	2	6	2841305	2841310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11925	NC_021554	AT	3	6	2842097	2842102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11926	NC_021554	T	6	6	2842174	2842179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11927	NC_021554	ATTT	2	8	2842181	2842188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11928	NC_021554	A	6	6	2842191	2842196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11934	NC_021554	ATA	2	6	2842640	2842645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11939	NC_021554	AAT	2	6	2843914	2843919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11942	NC_021554	TAAT	2	8	2844339	2844346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11955	NC_021554	TATT	2	8	2850128	2850135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11956	NC_021554	A	8	8	2850149	2850156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.