MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus CA-347

Total Repeats: 11958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021554	TA	4	8	1138131	1138138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021554	ATG	2	6	1138141	1138146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021554	CAC	2	6	1138171	1138176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_021554	TGT	2	6	1138183	1138188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021554	TCGT	2	8	1138248	1138255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_021554	TA	4	8	1138272	1138279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021554	T	6	6	1138303	1138308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021554	TCC	2	6	1138554	1138559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_021554	CTT	2	6	1138606	1138611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_021554	ATT	2	6	1138648	1138653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021554	TTA	2	6	1138669	1138674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021554	TCT	2	6	1138684	1138689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021554	AAT	2	6	1138720	1138725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021554	AT	3	6	1138733	1138738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021554	TTAA	2	8	1138783	1138790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021554	ACA	2	6	1138799	1138804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021554	AT	3	6	1138863	1138868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021554	ATA	2	6	1138879	1138884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021554	CAT	2	6	1138942	1138947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021554	ATT	2	6	1138968	1138973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021554	T	6	6	1139977	1139982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021554	AAT	2	6	1140001	1140006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021554	AAT	2	6	1140023	1140028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021554	ATC	2	6	1140053	1140058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021554	TGA	3	9	1140103	1140111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021554	TAAT	2	8	1140143	1140150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021554	TGAA	2	8	1140192	1140199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021554	TATT	2	8	1140261	1140268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021554	AATT	2	8	1140326	1140333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021554	TAAA	2	8	1140340	1140347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021554	TAAT	2	8	1140371	1140378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021554	A	6	6	1140394	1140399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021554	AATT	2	8	1140424	1140431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021554	GTGTA	2	10	1140471	1140480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021554	TTTG	2	8	1140796	1140803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021554	AGA	2	6	1140889	1140894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021554	TA	3	6	1140921	1140926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021554	TTA	2	6	1140928	1140933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021554	TCA	2	6	1140953	1140958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021554	ATTAA	2	10	1140966	1140975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021554	TA	3	6	1141019	1141024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021554	GACA	2	8	1141025	1141032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_021554	CAAA	2	8	1141038	1141045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_021554	AACA	2	8	1141057	1141064	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_021554	AAT	2	6	1141119	1141124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021554	GGGGC	2	10	1141134	1141143	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5047	NC_021554	T	6	6	1141211	1141216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021554	TA	3	6	1141223	1141228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021554	TTG	2	6	1141229	1141234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021554	TCA	2	6	1142044	1142049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021554	TA	3	6	1142881	1142886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021554	AAT	2	6	1142892	1142897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021554	AG	3	6	1142910	1142915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021554	AATG	2	8	1142953	1142960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021554	TA	3	6	1143722	1143727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021554	TAAA	2	8	1143750	1143757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021554	TAAA	2	8	1143772	1143779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021554	TAG	2	6	1143790	1143795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021554	TAA	2	6	1143847	1143852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021554	TA	3	6	1143866	1143871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021554	ATT	2	6	1143891	1143896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021554	ACT	2	6	1143940	1143945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021554	GTA	2	6	1143969	1143974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021554	TAA	2	6	1143982	1143987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021554	CTA	2	6	1143992	1143997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021554	TAA	2	6	1144012	1144017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021554	ATT	2	6	1144030	1144035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021554	TAG	2	6	1144058	1144063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021554	TAAAA	2	10	1144104	1144113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021554	GTT	2	6	1144117	1144122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021554	TAT	2	6	1146131	1146136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021554	AAT	2	6	1146154	1146159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021554	ATTTAT	2	12	1146192	1146203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021554	TAT	2	6	1147823	1147828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021554	A	6	6	1147829	1147834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021554	ACTAA	2	10	1147875	1147884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_021554	ATT	2	6	1147894	1147899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021554	AAT	2	6	1147915	1147920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021554	ACA	2	6	1147931	1147936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_021554	AGTA	2	8	1147939	1147946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021554	TAA	2	6	1147966	1147971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021554	TAATG	2	10	1147994	1148003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021554	TATAT	2	10	1148016	1148025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021554	AT	3	6	1148098	1148103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021554	TAAAA	2	10	1148394	1148403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021554	ATTA	2	8	1148410	1148417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021554	TGC	2	6	1148445	1148450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021554	TA	3	6	1148452	1148457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021554	TAAA	2	8	1148463	1148470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021554	TAC	2	6	1148515	1148520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_021554	TTG	2	6	1148542	1148547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021554	CATA	2	8	1148550	1148557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_021554	GAT	2	6	1148559	1148564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021554	T	6	6	1148619	1148624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021554	TTA	2	6	1148627	1148632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021554	TTC	2	6	1149635	1149640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021554	TAA	2	6	1149671	1149676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021554	GT	3	6	1149682	1149687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021554	GTAT	2	8	1149705	1149712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021554	ATT	2	6	1149809	1149814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021554	AAT	2	6	1149822	1149827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021554	AAT	2	6	1150048	1150053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021554	AAT	2	6	1150064	1150069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021554	TA	3	6	1150110	1150115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021554	AAT	2	6	1150178	1150183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021554	ATA	3	9	1150184	1150192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021554	GTGA	2	8	1150215	1150222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021554	TTAA	2	8	1150290	1150297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021554	TG	3	6	1150331	1150336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021554	A	7	7	1150339	1150345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021554	CAT	2	6	1150418	1150423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_021554	CAAAA	2	10	1150441	1150450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5113	NC_021554	GGGA	2	8	1150514	1150521	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021554	CCGA	2	8	1150531	1150538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_021554	AAC	2	6	1150588	1150593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_021554	ATT	2	6	1150600	1150605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021554	TAAA	2	8	1150639	1150646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021554	A	7	7	1150644	1150650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021554	TAT	2	6	1150666	1150671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021554	TGT	2	6	1150803	1150808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021554	AAAC	2	8	1150815	1150822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_021554	ATTT	2	8	1150835	1150842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021554	AAC	3	9	1150849	1150857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021554	AAATTT	2	12	1150918	1150929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021554	GTAA	2	8	1151094	1151101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021554	TAT	2	6	1151106	1151111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021554	GA	3	6	1151125	1151130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021554	ATT	2	6	1151275	1151280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021554	TTTAT	2	10	1151332	1151341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021554	AGG	2	6	1151389	1151394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021554	AAT	2	6	1152094	1152099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021554	A	6	6	1152140	1152145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_021554	TAC	2	6	1152660	1152665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5268	NC_021554	TGA	2	6	1195611	1195616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5271	NC_021554	TCA	2	6	1202286	1202291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5398	NC_021554	TAA	2	6	1246266	1246271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_021554	GTAT	2	8	1246294	1246301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5401	NC_021554	AATGAT	2	12	1246389	1246400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5409	NC_021554	GAAA	2	8	1251271	1251278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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