MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021314	AC	3	6	12082	12087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021314	CT	3	6	17499	17504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021314	CT	3	6	17934	17939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021314	AT	3	6	24477	24482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021314	CT	3	6	24508	24513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021314	AC	3	6	24998	25003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021314	AC	3	6	25167	25172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021314	AG	3	6	26126	26131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021314	CT	3	6	26240	26245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021314	TC	3	6	26618	26623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021314	GA	3	6	27159	27164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021314	TA	3	6	27213	27218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021314	GA	3	6	27454	27459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021314	CT	3	6	27571	27576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021314	GA	3	6	27778	27783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021314	GA	3	6	28593	28598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021314	AT	4	8	31884	31891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021314	CT	3	6	33182	33187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021314	AT	3	6	33343	33348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021314	AT	3	6	41710	41715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021314	AT	4	8	44139	44146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021314	TG	3	6	49401	49406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021314	AT	3	6	56022	56027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021314	CA	3	6	71148	71153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021314	TA	3	6	74849	74854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021314	AT	3	6	79588	79593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021314	GA	3	6	79621	79626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021314	GA	3	6	79920	79925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021314	AG	3	6	80244	80249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021314	TC	3	6	80261	80266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021314	CT	3	6	81584	81589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021314	AG	3	6	83446	83451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021314	AT	3	6	83470	83475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021314	TA	3	6	85235	85240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021314	GA	3	6	85716	85721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021314	TA	3	6	85741	85746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021314	AT	3	6	86112	86117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021314	AG	3	6	92528	92533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021314	GT	3	6	93132	93137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021314	AC	4	8	94692	94699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021314	GA	3	6	95512	95517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021314	AG	3	6	98579	98584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021314	AG	3	6	127407	127412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021314	AG	3	6	128722	128727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021314	AG	3	6	141260	141265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021314	GA	4	8	141284	141291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021314	AG	3	6	146570	146575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021314	AT	3	6	150432	150437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021314	AC	3	6	152118	152123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021314	TC	3	6	153458	153463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021314	AG	3	6	156036	156041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021314	AT	3	6	173746	173751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021314	TG	3	6	177794	177799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021314	GA	3	6	186327	186332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021314	CT	3	6	186336	186341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021314	TA	3	6	188067	188072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021314	GA	3	6	218175	218180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021314	CT	3	6	218228	218233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021314	GA	3	6	218979	218984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021314	CT	3	6	219032	219037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021314	AT	3	6	227681	227686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021314	AT	3	6	247433	247438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021314	TA	3	6	258004	258009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021314	TA	3	6	283010	283015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021314	GT	3	6	284583	284588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021314	AG	3	6	284830	284835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021314	AC	3	6	286870	286875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021314	CA	3	6	293601	293606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021314	AG	3	6	294227	294232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021314	GA	3	6	294316	294321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021314	AT	3	6	294431	294436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021314	CA	3	6	295116	295121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021314	TG	3	6	295162	295167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021314	GA	3	6	297423	297428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021314	GA	3	6	297816	297821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021314	AT	4	8	298455	298462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021314	CT	3	6	298588	298593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021314	TA	3	6	307808	307813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021314	TC	3	6	316810	316815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021314	GA	3	6	316821	316826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021314	CA	3	6	318241	318246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021314	TA	3	6	322033	322038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021314	AT	3	6	322628	322633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021314	TA	3	6	339981	339986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021314	AT	3	6	341943	341948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021314	AG	3	6	341962	341967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021314	AC	3	6	354798	354803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021314	AT	3	6	360142	360147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021314	CT	3	6	360173	360178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021314	AC	3	6	360663	360668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021314	AC	3	6	360832	360837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021314	AG	3	6	361791	361796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021314	CT	3	6	361905	361910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021314	TC	3	6	362283	362288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021314	GA	3	6	362824	362829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021314	TA	3	6	362878	362883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021314	GA	3	6	363119	363124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021314	CT	3	6	363236	363241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021314	GA	3	6	363443	363448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021314	GA	3	6	364258	364263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021314	AG	3	6	371638	371643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021314	CT	3	6	381015	381020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021314	TC	3	6	386370	386375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021314	GA	3	6	389140	389145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021314	TA	3	6	390206	390211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021314	TC	3	6	410113	410118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021314	TC	3	6	410278	410283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021314	GA	3	6	411029	411034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021314	AT	3	6	412105	412110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021314	CT	3	6	412136	412141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021314	AC	3	6	412626	412631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021314	AC	3	6	412795	412800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021314	AG	3	6	413754	413759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021314	CT	3	6	413868	413873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021314	TC	3	6	414246	414251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021314	GA	3	6	414787	414792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021314	TA	3	6	414841	414846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021314	GA	3	6	415082	415087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021314	CT	3	6	415199	415204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021314	GA	3	6	415406	415411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021314	GA	3	6	416221	416226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021314	CT	3	6	417292	417297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021314	CA	3	6	418404	418409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021314	AG	3	6	420779	420784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021314	AG	3	6	426643	426648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021314	AT	3	6	427063	427068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021314	GA	4	8	427070	427077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021314	AT	3	6	427079	427084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021314	GA	4	8	427086	427093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021314	GA	4	8	431477	431484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021314	CT	4	8	449988	449995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021314	TA	3	6	450018	450023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021314	TG	3	6	450197	450202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021314	TA	3	6	454799	454804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021314	GA	3	6	467167	467172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021314	AG	3	6	478138	478143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021314	AT	3	6	482897	482902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021314	GA	3	6	488184	488189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021314	TA	3	6	489152	489157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021314	AT	3	6	490713	490718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021314	AT	3	6	493934	493939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021314	TG	3	6	494969	494974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021314	AG	3	6	501508	501513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021314	AG	3	6	502516	502521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021314	TA	3	6	503635	503640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021314	TA	3	6	505770	505775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021314	TA	3	6	507693	507698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021314	TA	3	6	508855	508860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021314	TC	3	6	514995	515000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021314	AT	3	6	517317	517322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021314	GA	3	6	523098	523103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021314	TC	3	6	526782	526787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021314	GA	3	6	526793	526798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021314	TA	3	6	532789	532794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_021314	CA	3	6	2115673	2115678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_021314	TG	3	6	2119929	2119934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_021314	TA	3	6	2126117	2126122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_021314	AT	3	6	2126874	2126879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_021314	TA	3	6	2136446	2136451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.