MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 6469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021314	CCA	2	6	1341124	1341129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_021314	GAA	2	6	1341159	1341164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021314	TC	3	6	1341166	1341171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_021314	CCA	2	6	1341299	1341304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_021314	CTT	2	6	1341390	1341395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_021314	AGG	2	6	1341412	1341417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021314	T	7	7	1341435	1341441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021314	TAGG	2	8	1341456	1341463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021314	GAA	2	6	1341515	1341520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021314	GTTG	2	8	1341535	1341542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021314	CGT	2	6	1341626	1341631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021314	GAT	2	6	1341641	1341646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021314	CAA	2	6	1341653	1341658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_021314	TAA	2	6	1341898	1341903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021314	CCA	2	6	1343124	1343129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_021314	ACTT	2	8	1343176	1343183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_021314	T	6	6	1343217	1343222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021314	A	6	6	1343223	1343228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021314	T	7	7	1343243	1343249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021314	T	7	7	1343600	1343606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021314	A	7	7	1346296	1346302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021314	GAA	2	6	1346322	1346327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021314	TCTA	2	8	1346645	1346652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_021314	TAT	2	6	1346657	1346662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021314	ATG	2	6	1346665	1346670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021314	A	8	8	1346678	1346685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021314	TAT	2	6	1349257	1349262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021314	ACTA	2	8	1349314	1349321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_021314	A	6	6	1349321	1349326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021314	GAT	2	6	1349382	1349387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021314	TAA	2	6	1349394	1349399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021314	CTTT	2	8	1349886	1349893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_021314	T	6	6	1349941	1349946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021314	TCTTT	2	10	1349960	1349969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_021314	T	6	6	1349967	1349972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021314	TAT	2	6	1350012	1350017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021314	AAC	2	6	1350051	1350056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021314	A	6	6	1350057	1350062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021314	T	7	7	1353802	1353808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021314	A	7	7	1353890	1353896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021314	A	6	6	1356006	1356011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021314	TCAA	2	8	1356030	1356037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_021314	A	6	6	1356036	1356041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021314	ATT	2	6	1356449	1356454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021314	AAC	2	6	1356509	1356514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_021314	TGA	2	6	1356533	1356538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021314	CTA	2	6	1356614	1356619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_021314	TA	3	6	1356618	1356623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021314	A	7	7	1358507	1358513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021314	T	7	7	1358543	1358549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021314	CTT	2	6	1359211	1359216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_021314	CAT	2	6	1359270	1359275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021314	TCT	2	6	1359277	1359282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021314	AACC	2	8	1359300	1359307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_021314	T	6	6	1360864	1360869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021314	CTT	2	6	1360984	1360989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_021314	AGGA	2	8	1361045	1361052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021314	T	6	6	1361104	1361109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021314	TGA	2	6	1361111	1361116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021314	TCT	2	6	1362254	1362259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_021314	CTC	2	6	1364264	1364269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_021314	T	6	6	1364270	1364275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021314	CTT	2	6	1366874	1366879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_021314	ATT	2	6	1366886	1366891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021314	TTA	2	6	1366899	1366904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021314	TA	3	6	1366903	1366908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021314	TAA	2	6	1366935	1366940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021314	A	7	7	1367030	1367036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021314	T	7	7	1367119	1367125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021314	TCT	2	6	1370617	1370622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021314	ATT	2	6	1370650	1370655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021314	ACT	2	6	1370674	1370679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021314	A	6	6	1370691	1370696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_021314	CTA	2	6	1373370	1373375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021314	T	6	6	1373391	1373396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021314	ACCT	2	8	1375137	1375144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_021314	CAT	2	6	1375236	1375241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_021314	T	6	6	1375248	1375253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021314	AAT	2	6	1375327	1375332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021314	AAT	2	6	1375342	1375347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021314	CAT	2	6	1375395	1375400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_021314	AAT	2	6	1375411	1375416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021314	TTA	2	6	1375497	1375502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021314	T	6	6	1375510	1375515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021314	ATT	2	6	1375558	1375563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021314	ATA	2	6	1375569	1375574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021314	GTC	2	6	1375649	1375654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_021314	ACTAT	2	10	1375725	1375734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4089	NC_021314	ATT	2	6	1375756	1375761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021314	A	6	6	1375812	1375817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021314	ATT	2	6	1375826	1375831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021314	TTA	2	6	1375852	1375857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021314	TCAT	2	8	1375895	1375902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_021314	TAAC	2	8	1375905	1375912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_021314	AGA	2	6	1375966	1375971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021314	A	6	6	1375975	1375980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021314	AAAC	2	8	1376023	1376030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_021314	AAT	2	6	1376040	1376045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021314	TAC	2	6	1376085	1376090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_021314	TCT	2	6	1376109	1376114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_021314	T	6	6	1380372	1380377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021314	A	6	6	1380409	1380414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021314	GCTT	2	8	1380426	1380433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_021314	T	6	6	1380441	1380446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021314	T	6	6	1380461	1380466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021314	ATT	2	6	1380588	1380593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021314	T	7	7	1380620	1380626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021314	TCAA	2	8	1380763	1380770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_021314	CAG	2	6	1380881	1380886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021314	CGT	2	6	1380887	1380892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_021314	TCA	2	6	1380932	1380937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021314	ATCA	2	8	1380999	1381006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_021314	TAAT	2	8	1381097	1381104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021314	T	6	6	1381158	1381163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021314	AAT	2	6	1381185	1381190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021314	TTC	2	6	1381191	1381196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_021314	CTT	2	6	1381264	1381269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_021314	T	7	7	1383358	1383364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021314	ATCA	2	8	1383389	1383396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_021314	A	6	6	1383475	1383480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021314	ACA	2	6	1383514	1383519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_021314	ATAAAA	2	12	1383573	1383584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021314	AAC	2	6	1386599	1386604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_021314	TTG	2	6	1386610	1386615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021314	AAC	2	6	1386616	1386621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_021314	CTC	2	6	1387650	1387655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_021314	A	9	9	1387686	1387694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021314	A	7	7	1387699	1387705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021314	TCT	2	6	1388448	1388453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_021314	TCC	2	6	1389410	1389415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_021314	TCC	2	6	1390413	1390418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_021314	AAT	2	6	1392137	1392142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021314	AAT	2	6	1392148	1392153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021314	ATA	2	6	1392154	1392159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_021314	AAT	2	6	1392261	1392266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_021314	TTA	2	6	1392285	1392290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_021314	TA	3	6	1392297	1392302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_021314	ATA	2	6	1392342	1392347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_021314	GGAA	2	8	1392356	1392363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_021314	CTA	2	6	1392368	1392373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_021314	CTA	2	6	1392422	1392427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_021314	AAT	2	6	1392466	1392471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_021314	T	7	7	1392486	1392492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_021314	TAA	2	6	1392495	1392500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_021314	A	7	7	1392514	1392520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_021314	AATT	2	8	1392529	1392536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_021314	ATCT	2	8	1392550	1392557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4148	NC_021314	AGAT	2	8	1392599	1392606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_021314	AT	3	6	1392605	1392610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_021314	GAT	2	6	1392630	1392635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_021314	TG	3	6	1393869	1393874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_021314	ATT	3	9	1393880	1393888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_021314	GTT	3	9	1393889	1393897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4156	NC_021314	AGAGT	2	10	1393991	1394000	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_021314	CTA	2	6	1395221	1395226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4159	NC_021314	TTAT	2	8	1395697	1395704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_021314	CTT	2	6	1395726	1395731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4161	NC_021314	CTAAA	2	10	1395744	1395753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4162	NC_021314	ATT	2	6	1395770	1395775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_021314	TA	4	8	1395802	1395809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_021314	ATT	2	6	1395832	1395837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_021314	AGCA	2	8	1395870	1395877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4166	NC_021314	GCTT	2	8	1395883	1395890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4167	NC_021314	ATAG	2	8	1395900	1395907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_021314	TAA	2	6	1395931	1395936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4173	NC_021314	ATT	2	6	1398712	1398717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4214	NC_021314	T	6	6	1409452	1409457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4215	NC_021314	AT	3	6	1409480	1409485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4216	NC_021314	AAT	2	6	1410265	1410270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4241	NC_021314	ATT	2	6	1411133	1411138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_021314	ATA	2	6	1411174	1411179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_021314	AAT	2	6	1411220	1411225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_021314	AGAGT	2	10	1411240	1411249	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_021314	CTA	2	6	1412470	1412475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_021314	A	6	6	1413308	1413313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_021314	T	7	7	1413346	1413352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_021314	T	6	6	1416874	1416879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_021314	A	7	7	1416916	1416922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_021314	TCC	2	6	1417197	1417202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4252	NC_021314	AAC	2	6	1417407	1417412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_021314	CTT	2	6	1417425	1417430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_021314	AC	3	6	1417446	1417451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4255	NC_021314	A	6	6	1417471	1417476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_021314	TAA	2	6	1417508	1417513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_021314	TA	3	6	1417536	1417541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_021314	ATC	2	6	1417551	1417556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_021314	ATT	2	6	1419148	1419153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_021314	TTCT	2	8	1421386	1421393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_021314	TAT	2	6	1421406	1421411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_021314	TAA	2	6	1421432	1421437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_021314	CAA	2	6	1421441	1421446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_021314	CAA	2	6	1422307	1422312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4265	NC_021314	TAT	2	6	1422333	1422338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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