MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 6469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021314	ACG	2	6	413468	413473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021314	GTAA	2	8	413491	413498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021314	GAAG	2	8	413573	413580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021314	TAG	2	6	413639	413644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021314	GCGA	2	8	413647	413654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_021314	AGG	2	6	413661	413666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021314	GAG	2	6	413674	413679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021314	CTC	2	6	413684	413689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_021314	AGA	2	6	413726	413731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021314	AG	3	6	413754	413759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021314	TCG	2	6	413829	413834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021314	GGA	2	6	413842	413847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021314	CT	3	6	413868	413873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_021314	GGGAG	2	10	413923	413932	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021314	ACA	2	6	413960	413965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_021314	ATG	2	6	414027	414032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021314	TGT	2	6	414097	414102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021314	GGA	2	6	414160	414165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021314	TC	3	6	414246	414251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_021314	ACC	2	6	414425	414430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_021314	AAT	2	6	414445	414450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021314	AGC	2	6	414505	414510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021314	ATTC	2	8	414512	414519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_021314	GAA	2	6	414641	414646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021314	GAG	2	6	414657	414662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021314	GA	3	6	414787	414792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021314	TA	3	6	414841	414846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021314	CTAA	2	8	414868	414875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_021314	GAC	2	6	414880	414885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021314	GA	3	6	415082	415087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021314	CT	3	6	415199	415204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_021314	GAT	2	6	415217	415222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021314	CGG	2	6	415308	415313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021314	GA	3	6	415406	415411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021314	TAGG	2	8	415524	415531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021314	TAC	2	6	415578	415583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_021314	CCT	2	6	415666	415671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_021314	TTGG	2	8	415707	415714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021314	AATC	2	8	415716	415723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_021314	GGT	2	6	415802	415807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021314	TCG	2	6	415917	415922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_021314	CGT	2	6	415997	416002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021314	AGGGA	2	10	416135	416144	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021314	C	6	6	416173	416178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1545	NC_021314	GA	3	6	416221	416226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021314	AAGTGT	2	12	416247	416258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021314	ACTAAT	2	12	416276	416287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1548	NC_021314	AGT	2	6	416424	416429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021314	AGT	2	6	416449	416454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021314	GCTTA	2	10	416486	416495	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_021314	AAAT	2	8	416833	416840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021314	TCA	2	6	416919	416924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021314	GGT	2	6	417143	417148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021314	GGT	2	6	417178	417183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021314	TAT	2	6	417207	417212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021314	CGG	2	6	417250	417255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021314	TAA	2	6	417285	417290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021314	CT	3	6	417292	417297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_021314	T	7	7	417306	417312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021314	TAA	2	6	417322	417327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021314	A	6	6	417354	417359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021314	ATG	2	6	417415	417420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021314	GTC	2	6	417445	417450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021314	CCT	2	6	417788	417793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_021314	AAAT	2	8	417799	417806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021314	CA	3	6	418404	418409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_021314	TAAAA	2	10	418426	418435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021314	AAT	2	6	419249	419254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021314	TAT	2	6	420689	420694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021314	GGT	2	6	420698	420703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021314	T	7	7	420714	420720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021314	ATT	2	6	420724	420729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021314	GTG	2	6	420766	420771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021314	AG	3	6	420779	420784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021314	T	7	7	425359	425365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021314	A	6	6	425366	425371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021314	A	6	6	426602	426607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021314	AG	3	6	426643	426648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021314	ATT	2	6	426681	426686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021314	T	7	7	426688	426694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021314	TTTG	2	8	426697	426704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021314	GTATA	2	10	426724	426733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021314	TGA	2	6	426788	426793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021314	T	6	6	426811	426816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021314	TAT	2	6	426831	426836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021314	TAA	2	6	426858	426863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021314	AAT	2	6	426866	426871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021314	AAT	2	6	426900	426905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021314	CATTG	2	10	426969	426978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_021314	T	7	7	426979	426985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021314	A	6	6	427046	427051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021314	A	6	6	427056	427061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021314	AT	3	6	427063	427068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021314	GA	4	8	427070	427077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021314	AT	3	6	427079	427084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021314	GA	4	8	427086	427093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_021314	CTTT	2	8	431094	431101	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1601	NC_021314	A	6	6	431106	431111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021314	T	6	6	431201	431206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021314	TTTTGG	2	12	431248	431259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021314	TGAGA	2	10	431319	431328	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021314	T	6	6	431352	431357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_021314	TAA	2	6	431389	431394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021314	T	6	6	431436	431441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021314	ATG	2	6	431456	431461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021314	ATT	2	6	431467	431472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021314	GA	4	8	431477	431484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021314	TAT	2	6	436744	436749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_021314	GTT	2	6	438514	438519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021314	TTA	2	6	438526	438531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_021314	ATG	2	6	438627	438632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021314	TAAG	2	8	438645	438652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021314	ATTC	2	8	443662	443669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_021314	ATA	2	6	448853	448858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021314	A	6	6	449045	449050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021314	CT	4	8	449988	449995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_021314	TTC	2	6	450004	450009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021314	TA	3	6	450018	450023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021314	AAAAT	2	10	450053	450062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_021314	TAA	2	6	450099	450104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021314	A	7	7	450103	450109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021314	A	8	8	450115	450122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021314	ATG	2	6	450126	450131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021314	AAAG	2	8	450148	450155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021314	ATTG	2	8	450191	450198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021314	TG	3	6	450197	450202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021314	TAA	2	6	450333	450338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021314	ATT	2	6	450341	450346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021314	TTA	2	6	450363	450368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1918	NC_021314	AATGAA	2	12	580929	580940	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1920	NC_021314	ATA	2	6	581636	581641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1923	NC_021314	ATAG	2	8	582517	582524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1933	NC_021314	T	6	6	585257	585262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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