MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 6469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021314	TCT	2	6	94950	94955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021314	TCAT	2	8	95120	95127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021314	CTTT	2	8	95221	95228	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_021314	AAT	2	6	95244	95249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021314	AAG	2	6	95254	95259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021314	CTT	2	6	95348	95353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021314	T	7	7	95381	95387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021314	CTT	2	6	95406	95411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021314	T	7	7	95487	95493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021314	GA	3	6	95512	95517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021314	TTAT	2	8	95588	95595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021314	A	6	6	95608	95613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021314	A	6	6	95631	95636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021314	T	7	7	95643	95649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021314	AGTT	2	8	95696	95703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021314	GGA	2	6	95707	95712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021314	AGG	2	6	97011	97016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021314	AAAG	2	8	98188	98195	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021314	CAA	2	6	98234	98239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021314	CTA	2	6	98266	98271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021314	GAT	2	6	98302	98307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021314	A	6	6	98395	98400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021314	TTTG	2	8	98421	98428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021314	TGTT	2	8	98448	98455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021314	A	7	7	98480	98486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021314	AAAT	2	8	98491	98498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021314	TAATGT	2	12	98561	98572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021314	AG	3	6	98579	98584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021314	TTAT	2	8	100764	100771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021314	TAT	3	9	100776	100784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021314	TCT	2	6	106742	106747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021314	TTA	2	6	106786	106791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021314	TTCTA	2	10	107851	107860	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
534	NC_021314	ATT	2	6	107888	107893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021314	TAA	2	6	107940	107945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021314	ATTT	2	8	107951	107958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021314	A	7	7	108003	108009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021314	AGT	2	6	108879	108884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021314	TGAT	2	8	108885	108892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021314	AAG	2	6	108922	108927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021314	CTC	2	6	112257	112262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_021314	A	6	6	114619	114624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021314	ATA	2	6	114631	114636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021314	GTC	2	6	114650	114655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021314	CAG	2	6	114690	114695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021314	GCT	2	6	114724	114729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021314	A	6	6	114829	114834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021314	A	6	6	114843	114848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021314	TAA	2	6	118438	118443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021314	ATT	2	6	118477	118482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021314	AGG	2	6	118488	118493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021314	GAA	2	6	118511	118516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021314	T	7	7	122195	122201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021314	AGA	2	6	122264	122269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021314	T	8	8	122672	122679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021314	AAT	2	6	122682	122687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021314	AGG	2	6	122694	122699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021314	TGATA	2	10	126392	126401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021314	T	6	6	127366	127371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021314	ATA	2	6	127375	127380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021314	AG	3	6	127407	127412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021314	T	7	7	128660	128666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021314	T	6	6	128696	128701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021314	AG	3	6	128722	128727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021314	A	7	7	130076	130082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021314	TCTAT	2	10	132020	132029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
567	NC_021314	ATG	2	6	132051	132056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021314	CCT	2	6	132065	132070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_021314	T	6	6	132076	132081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021314	GAAA	2	8	132710	132717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021314	TAT	2	6	133824	133829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021314	T	7	7	133837	133843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021314	AAT	2	6	133846	133851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021314	AGG	2	6	133857	133862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021314	T	6	6	134274	134279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021314	ATTG	2	8	134284	134291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021314	TTA	2	6	134494	134499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021314	CTT	2	6	134506	134511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021314	GTT	2	6	134596	134601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021314	ATAG	2	8	134609	134616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021314	TAGTG	2	10	134656	134665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021314	TAGA	2	8	134684	134691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021314	GAAAA	2	10	134718	134727	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021314	TAT	3	9	140946	140954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021314	ACG	2	6	141011	141016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021314	AATT	2	8	141035	141042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021314	A	7	7	141069	141075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021314	A	6	6	141080	141085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021314	CAA	2	6	141114	141119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_021314	GTT	2	6	141137	141142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021314	ATC	2	6	141165	141170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021314	AAT	2	6	141233	141238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021314	AG	3	6	141260	141265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021314	AGT	2	6	141274	141279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021314	GA	4	8	141284	141291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021314	ACT	2	6	146489	146494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_021314	TGC	2	6	146584	146589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021314	ACTC	2	8	146612	146619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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601	NC_021314	ATT	2	6	148191	148196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021314	ATA	2	6	148275	148280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021314	T	7	7	148290	148296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021314	TTTA	2	8	148330	148337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021314	GAA	2	6	148343	148348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021314	TTG	2	6	148377	148382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021314	ATC	2	6	148390	148395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021314	TTG	2	6	148414	148419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021314	GAT	2	6	148435	148440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021314	ATT	2	6	148459	148464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021314	TAA	2	6	148467	148472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021314	GAA	2	6	148761	148766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021314	CCT	2	6	150273	150278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_021314	T	6	6	150286	150291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021314	GAA	2	6	150306	150311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021314	TAT	2	6	150357	150362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021314	TAA	2	6	150369	150374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021314	A	6	6	150400	150405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021314	AT	3	6	150432	150437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021314	AGC	2	6	150474	150479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021314	ATA	2	6	150492	150497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021314	GAA	2	6	150502	150507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021314	AC	3	6	152118	152123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_021314	TC	3	6	153458	153463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_021314	TCTT	2	8	154311	154318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_021314	A	6	6	154368	154373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021314	G	6	6	154406	154411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021314	CAG	2	6	154588	154593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021314	GCCTCT	2	12	154630	154641	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
630	NC_021314	AG	3	6	156036	156041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021314	CAT	2	6	157235	157240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021314	ATA	2	6	160651	160656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021314	CTT	2	6	161373	161378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021314	AGG	2	6	161422	161427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021314	T	6	6	161497	161502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021314	A	6	6	161531	161536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021314	A	6	6	161947	161952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021314	ATC	2	6	161959	161964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021314	TTA	2	6	161996	162001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021314	AAG	2	6	162023	162028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_021314	TAT	2	6	162105	162110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021314	GTG	2	6	162111	162116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
643	NC_021314	ATTT	2	8	162142	162149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_021314	T	6	6	162147	162152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_021314	T	6	6	163273	163278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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789	NC_021314	T	6	6	224227	224232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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792	NC_021314	TTA	2	6	224267	224272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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794	NC_021314	AAT	2	6	224298	224303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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801	NC_021314	T	7	7	225705	225711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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821	NC_021314	ATTA	2	8	227673	227680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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