MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus iniae SF1

Total Repeats: 6469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021314	CTTTT	2	10	1664322	1664331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5002	NC_021314	TCT	2	6	1666133	1666138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_021314	TAA	2	6	1666160	1666165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021314	A	6	6	1666176	1666181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021314	A	7	7	1666200	1666206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021314	A	6	6	1667087	1667092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021314	AAC	2	6	1667128	1667133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021314	TAAGA	2	10	1669500	1669509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021314	A	7	7	1669509	1669515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021314	T	7	7	1671057	1671063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021314	ACGA	2	8	1671093	1671100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_021314	AT	4	8	1671104	1671111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021314	TAC	2	6	1671112	1671117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_021314	T	6	6	1671128	1671133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021314	AAATA	2	10	1671157	1671166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021314	T	7	7	1671186	1671192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021314	TTA	2	6	1671196	1671201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021314	TGAT	2	8	1672218	1672225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021314	AGG	2	6	1672385	1672390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021314	TCGTT	2	10	1673442	1673451	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5021	NC_021314	AAG	2	6	1675217	1675222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021314	T	7	7	1675247	1675253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021314	A	7	7	1675262	1675268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021314	ATA	2	6	1675277	1675282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021314	TAAAG	2	10	1675304	1675313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021314	TAA	2	6	1675700	1675705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021314	CTT	2	6	1675717	1675722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021314	T	6	6	1676775	1676780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021314	AAT	2	6	1676831	1676836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021314	T	6	6	1676879	1676884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021314	ATA	2	6	1676890	1676895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021314	TGGA	2	8	1677025	1677032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021314	CAG	2	6	1677050	1677055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_021314	A	7	7	1679144	1679150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5037	NC_021314	TCAT	2	8	1685983	1685990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_021314	CTCA	2	8	1685991	1685998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_021314	AAAG	2	8	1687021	1687028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021314	AAT	2	6	1687347	1687352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021314	T	7	7	1687364	1687370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021314	TCC	2	6	1688383	1688388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_021314	CCT	2	6	1688816	1688821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_021314	ATT	2	6	1688861	1688866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021314	AAT	2	6	1689721	1689726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021314	ATTT	2	8	1689748	1689755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021314	ACA	2	6	1689757	1689762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_021314	A	7	7	1689782	1689788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021314	A	7	7	1689799	1689805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021314	CA	3	6	1691077	1691082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_021314	TAA	2	6	1691124	1691129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021314	AAC	2	6	1691140	1691145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021314	TCA	2	6	1691255	1691260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_021314	TAAG	2	8	1691261	1691268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021314	T	6	6	1693161	1693166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021314	TGG	2	6	1693187	1693192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_021314	TTCG	2	8	1693284	1693291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_021314	TAG	2	6	1693335	1693340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021314	GTT	2	6	1693361	1693366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021314	ATTT	2	8	1693394	1693401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021314	AGTA	2	8	1693414	1693421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021314	TGA	2	6	1693457	1693462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021314	AAG	2	6	1694029	1694034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021314	CTTT	2	8	1694040	1694047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_021314	T	6	6	1694045	1694050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021314	A	7	7	1695198	1695204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021314	A	6	6	1695208	1695213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_021314	TAT	2	6	1697289	1697294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_021314	TGA	2	6	1699487	1699492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_021314	T	7	7	1703776	1703782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5086	NC_021314	TATAT	2	10	1708058	1708067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021314	T	7	7	1708070	1708076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021314	A	6	6	1708114	1708119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021314	ATT	2	6	1708122	1708127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021314	CT	3	6	1708141	1708146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_021314	C	7	7	1708168	1708174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5093	NC_021314	A	7	7	1708216	1708222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021314	CTTTT	2	10	1710200	1710209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5095	NC_021314	TATC	2	8	1710210	1710217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5099	NC_021314	ATA	2	6	1711615	1711620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021314	TAA	2	6	1711625	1711630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021314	T	6	6	1711651	1711656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021314	A	8	8	1711688	1711695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021314	ATC	2	6	1711720	1711725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_021314	TTC	2	6	1712616	1712621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_021314	TCAT	2	8	1712622	1712629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_021314	TGA	2	6	1712659	1712664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_021314	TAT	2	6	1713918	1713923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021314	ATCA	2	8	1713931	1713938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_021314	AGAA	2	8	1713943	1713950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021314	A	6	6	1713982	1713987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021314	A	7	7	1713997	1714003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021314	TCC	2	6	1714019	1714024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_021314	A	6	6	1714025	1714030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021314	TATAA	2	10	1714034	1714043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021314	AGG	2	6	1714081	1714086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021314	A	6	6	1714553	1714558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_021314	TTC	2	6	1716059	1716064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_021314	ATA	2	6	1716150	1716155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_021314	ATT	2	6	1716252	1716257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021314	TAA	2	6	1716258	1716263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021314	AAT	2	6	1716344	1716349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021314	TTA	2	6	1716351	1716356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021314	T	6	6	1716365	1716370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021314	TTA	2	6	1717308	1717313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021314	TTCT	2	8	1717364	1717371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_021314	GTA	2	6	1717392	1717397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021314	CTAA	2	8	1717437	1717444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_021314	AGA	2	6	1717456	1717461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_021314	TTA	2	6	1719412	1719417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_021314	CTT	2	6	1767112	1767117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_021314	T	6	6	1767116	1767121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_021314	TAT	2	6	1769480	1769485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5403	NC_021314	AT	3	6	1818579	1818584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_021314	AG	3	6	1818588	1818593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_021314	TTA	2	6	1818601	1818606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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