MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1

Total Repeats: 11137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021313	GTGC	2	8	1139549	1139556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_021313	GC	3	6	1139555	1139560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_021313	GCG	2	6	1139572	1139577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021313	AG	3	6	1139665	1139670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021313	T	6	6	1139687	1139692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021313	TAC	2	6	1139804	1139809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021313	GGA	2	6	1139811	1139816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021313	CGT	2	6	1139824	1139829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_021313	AGGCG	2	10	1140617	1140626	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_021313	GTC	2	6	1143162	1143167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021313	CGCA	2	8	1143240	1143247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_021313	AACG	2	8	1143257	1143264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_021313	CGA	2	6	1143297	1143302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021313	CGA	2	6	1143324	1143329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021313	CGT	2	6	1143408	1143413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021313	CGT	2	6	1143450	1143455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021313	CTG	2	6	1143466	1143471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_021313	TCG	2	6	1143482	1143487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_021313	GGA	2	6	1143711	1143716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021313	TCCC	2	8	1143739	1143746	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3521	NC_021313	TCGA	2	8	1143774	1143781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_021313	GACG	2	8	1143833	1143840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_021313	GCG	2	6	1143843	1143848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021313	AACGC	2	10	1143888	1143897	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3525	NC_021313	CGT	2	6	1143902	1143907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021313	CGA	2	6	1143938	1143943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_021313	ACG	2	6	1144140	1144145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_021313	GC	3	6	1144179	1144184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_021313	CGC	2	6	1144801	1144806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_021313	TCG	2	6	1144981	1144986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021313	CGT	2	6	1144995	1145000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021313	CA	3	6	1145013	1145018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_021313	CGAA	2	8	1145029	1145036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_021313	CA	3	6	1147132	1147137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_021313	CGTC	2	8	1147183	1147190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_021313	ACG	2	6	1147197	1147202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021313	ACG	2	6	1147226	1147231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021313	TCGG	2	8	1147281	1147288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_021313	CGC	2	6	1147309	1147314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_021313	TGAG	2	8	1147351	1147358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021313	GCA	2	6	1147418	1147423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021313	CGG	2	6	1147450	1147455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021313	GTA	2	6	1148643	1148648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021313	CG	3	6	1148653	1148658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_021313	CTC	2	6	1148659	1148664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_021313	GGC	2	6	1148726	1148731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021313	TCGC	2	8	1148741	1148748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_021313	TCGT	2	8	1148751	1148758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_021313	GC	3	6	1148808	1148813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_021313	CGC	2	6	1148826	1148831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_021313	TC	3	6	1148841	1148846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_021313	GTCC	2	8	1148858	1148865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_021313	CGGG	2	8	1149274	1149281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_021313	GCG	2	6	1149305	1149310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021313	CGGC	2	8	1149345	1149352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_021313	AGCA	2	8	1149368	1149375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_021313	GGT	2	6	1150851	1150856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021313	GCC	2	6	1152232	1152237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_021313	CGATC	2	10	1152250	1152259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3560	NC_021313	CGGCGA	2	12	1152270	1152281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021313	CGT	2	6	1152288	1152293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021313	CAA	2	6	1152325	1152330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_021313	GTGC	2	8	1152364	1152371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_021313	TCGAA	2	10	1152869	1152878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3565	NC_021313	CGA	2	6	1152905	1152910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021313	CGC	2	6	1152912	1152917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_021313	GA	3	6	1153939	1153944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021313	CG	3	6	1153957	1153962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_021313	GA	3	6	1153979	1153984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021313	CAG	2	6	1154004	1154009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021313	TG	3	6	1154052	1154057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021313	GCT	2	6	1155887	1155892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021313	TCG	2	6	1155930	1155935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021313	CCG	2	6	1155950	1155955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_021313	CGCC	2	8	1155967	1155974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3576	NC_021313	ACG	2	6	1157346	1157351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_021313	CGGT	2	8	1157369	1157376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_021313	ACGG	2	8	1157393	1157400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_021313	ACT	2	6	1157487	1157492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_021313	CA	3	6	1157557	1157562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_021313	GGTCG	2	10	1157592	1157601	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_021313	CGAG	2	8	1157625	1157632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_021313	CCGG	2	8	1157731	1157738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_021313	TAC	2	6	1157746	1157751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021313	CGC	2	6	1158690	1158695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_021313	TGCG	2	8	1161687	1161694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_021313	TCCA	2	8	1161706	1161713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_021313	ACG	2	6	1161715	1161720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021313	CG	3	6	1161719	1161724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_021313	AGC	2	6	1161726	1161731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_021313	GACG	2	8	1161753	1161760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_021313	GC	3	6	1161767	1161772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_021313	GAC	2	6	1161807	1161812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_021313	AAG	2	6	1162109	1162114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021313	GGC	2	6	1162200	1162205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021313	GCC	2	6	1162309	1162314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_021313	GTA	2	6	1162375	1162380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021313	GAAC	2	8	1162419	1162426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_021313	TG	3	6	1162446	1162451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021313	TAT	2	6	1162526	1162531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021313	GAC	2	6	1162633	1162638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_021313	ATAG	2	8	1162715	1162722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021313	ACG	2	6	1162738	1162743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021313	CCT	2	6	1162763	1162768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_021313	AAC	2	6	1162779	1162784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021313	GAC	2	6	1162873	1162878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021313	TCA	2	6	1162906	1162911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021313	GTT	2	6	1162970	1162975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021313	ACC	2	6	1162993	1162998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_021313	GC	3	6	1163052	1163057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_021313	GCC	2	6	1163079	1163084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_021313	TCC	3	9	1163111	1163119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_021313	TG	3	6	1163158	1163163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021313	CCTA	2	8	1163203	1163210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_021313	TAC	2	6	1163388	1163393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_021313	CCG	2	6	1163421	1163426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_021313	TCC	2	6	1163442	1163447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_021313	TGT	2	6	1163524	1163529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021313	TAG	2	6	1163530	1163535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021313	CTT	2	6	1163589	1163594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021313	CGC	2	6	1163660	1163665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_021313	CGT	2	6	1163696	1163701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021313	GAC	2	6	1163848	1163853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021313	GCT	2	6	1163991	1163996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021313	GGT	2	6	1164110	1164115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021313	GCT	2	6	1164188	1164193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021313	CTGT	2	8	1164212	1164219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_021313	ACC	2	6	1164228	1164233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_021313	GCC	2	6	1164389	1164394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_021313	CGG	2	6	1164632	1164637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_021313	ACG	2	6	1164743	1164748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3762	NC_021313	GACC	2	8	1185597	1185604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3763	NC_021313	GC	3	6	1185633	1185638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3868	NC_021313	A	6	6	1221494	1221499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3869	NC_021313	A	7	7	1221508	1221514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3870	NC_021313	GCTC	2	8	1221522	1221529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3872	NC_021313	CGCT	2	8	1221574	1221581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3873	NC_021313	TCGC	2	8	1221590	1221597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3874	NC_021313	TCGT	2	8	1222996	1223003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3875	NC_021313	AAGA	2	8	1223017	1223024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3876	NC_021313	CGC	2	6	1223105	1223110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3881	NC_021313	GA	3	6	1225406	1225411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3882	NC_021313	GCG	2	6	1225435	1225440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3883	NC_021313	GCC	2	6	1225444	1225449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3884	NC_021313	CCG	2	6	1226612	1226617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3885	NC_021313	ACC	3	9	1226621	1226629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3886	NC_021313	ATG	2	6	1229018	1229023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3887	NC_021313	GTTGT	2	10	1229038	1229047	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3888	NC_021313	GT	3	6	1229046	1229051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3889	NC_021313	CAC	2	6	1229056	1229061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3890	NC_021313	AGA	2	6	1229118	1229123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3891	NC_021313	TG	3	6	1229150	1229155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3892	NC_021313	CGA	2	6	1229173	1229178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3893	NC_021313	TCCAT	2	10	1229196	1229205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3894	NC_021313	AT	3	6	1229246	1229251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3895	NC_021313	CGA	2	6	1229265	1229270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3896	NC_021313	GT	3	6	1230310	1230315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_021313	GAAAT	2	10	1230354	1230363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3898	NC_021313	GTC	2	6	1230427	1230432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3900	NC_021313	CGTC	2	8	1230850	1230857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3901	NC_021313	CGC	2	6	1230939	1230944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3902	NC_021313	GGC	2	6	1230947	1230952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3910	NC_021313	CTG	2	6	1233291	1233296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3912	NC_021313	TCG	2	6	1233317	1233322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3916	NC_021313	C	6	6	1233498	1233503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3919	NC_021313	CTCGT	2	10	1237948	1237957	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3923	NC_021313	TCG	2	6	1240971	1240976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3924	NC_021313	CGAT	2	8	1241053	1241060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3925	NC_021313	TCG	2	6	1241068	1241073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3927	NC_021313	GTCGC	2	10	1242343	1242352	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3928	NC_021313	CTG	2	6	1242365	1242370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3970	NC_021313	TCGC	2	8	1255030	1255037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3971	NC_021313	CTTC	2	8	1255071	1255078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3972	NC_021313	TTCG	2	8	1255086	1255093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3981	NC_021313	CGG	2	6	1255530	1255535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3982	NC_021313	TA	3	6	1255553	1255558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3983	NC_021313	CAAT	2	8	1255565	1255572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3984	NC_021313	CAG	2	6	1255592	1255597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3987	NC_021313	CGAAC	2	10	1257434	1257443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3988	NC_021313	GAG	2	6	1257444	1257449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_021313	CGAG	2	8	1257557	1257564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3990	NC_021313	GCGGG	2	10	1258513	1258522	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3991	NC_021313	CGC	2	6	1258532	1258537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3999	NC_021313	GC	3	6	1261939	1261944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4000	NC_021313	GCC	2	6	1261947	1261952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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