MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma syrphidicola EA-1

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021284	TATAA	2	10	17883	17892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021284	CTTTT	2	10	18857	18866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021284	ATCAA	2	10	58446	58455	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021284	TAAAA	2	10	72198	72207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021284	AAATT	2	10	82009	82018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021284	AAAGG	2	10	87113	87122	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021284	ATTTT	2	10	90941	90950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021284	ATTGT	2	10	90992	91001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021284	GGTTG	2	10	95692	95701	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021284	AATTA	2	10	110086	110095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021284	AGAAT	2	10	110384	110393	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021284	GAAAA	2	10	113072	113081	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021284	GTTAA	2	10	115876	115885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021284	ATTTA	2	10	130516	130525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021284	TAATT	2	10	139319	139328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021284	TTTTA	2	10	142722	142731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021284	TTAAG	2	10	146919	146928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021284	CTTTT	2	10	151632	151641	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021284	ATTTT	2	10	151705	151714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021284	ATATA	2	10	154294	154303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021284	CTAAT	2	10	156801	156810	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021284	TTATA	2	10	157542	157551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021284	TAAAA	2	10	164607	164616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021284	TTTTA	2	10	165922	165931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021284	TTAAT	2	10	172198	172207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021284	AAAAT	2	10	186137	186146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021284	AAATT	2	10	212559	212568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021284	TAAAA	2	10	213617	213626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021284	ATTTT	2	10	218682	218691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021284	ATTTT	2	10	225839	225848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021284	AATTA	2	10	230825	230834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021284	ATTTA	2	10	235545	235554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021284	TTTTA	2	10	235655	235664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021284	ATAAG	2	10	244117	244126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021284	ATTTT	2	10	278239	278248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021284	TATTT	2	10	278293	278302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021284	TAAAA	2	10	285642	285651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021284	ACTTT	2	10	285737	285746	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021284	ATATA	2	10	287052	287061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021284	GTTAT	2	10	288637	288646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021284	AAACA	2	10	290408	290417	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021284	TTTTA	2	10	294779	294788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021284	AATTA	2	10	296268	296277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021284	TTAGT	2	10	296342	296351	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021284	GATAA	2	10	306263	306272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021284	CTTAT	2	10	309159	309168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021284	ATATA	2	10	318681	318690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021284	ATATT	2	10	326650	326659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021284	ATTTT	2	10	335223	335232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021284	TATAA	2	10	335270	335279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021284	TAACA	2	10	343700	343709	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021284	TATAA	2	10	351756	351765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021284	TAGTA	2	10	359150	359159	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021284	AATAT	2	10	361193	361202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021284	ATTTT	2	10	362785	362794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021284	AAAAT	2	10	383857	383866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021284	ATTAT	2	10	383942	383951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021284	AATCT	2	10	392472	392481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021284	TAATG	2	10	394057	394066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021284	TTTTA	2	10	394115	394124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021284	GAGAA	2	10	398243	398252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021284	TTTTA	2	10	410827	410836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021284	AATTA	2	10	411453	411462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021284	TAAAA	2	10	419467	419476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021284	TACAA	2	10	425244	425253	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021284	TAATT	2	10	426907	426916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021284	ATTCA	2	10	432039	432048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021284	ATCTA	2	10	432353	432362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021284	GGGAG	2	10	434600	434609	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021284	TATAA	2	10	439178	439187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021284	TTTTC	2	10	444661	444670	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021284	ATATT	2	10	455024	455033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021284	AGGGT	2	10	455122	455131	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021284	GAATA	2	10	455141	455150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021284	TTAGT	2	10	458476	458485	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021284	ATTAA	2	10	459527	459536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021284	TATTT	2	10	464279	464288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021284	ATTTT	2	10	466069	466078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021284	ATATT	2	10	466097	466106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021284	GTTTA	2	10	471480	471489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021284	ATTTT	2	10	482171	482180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021284	TAATA	2	10	486300	486309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021284	AAAAG	2	10	500129	500138	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021284	TAAAT	2	10	506214	506223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021284	AAAAT	2	10	508040	508049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021284	AAGGA	2	10	512765	512774	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021284	TTAAA	2	10	515958	515967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021284	ATCAG	2	10	523650	523659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021284	TATTT	2	10	526280	526289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021284	TTTTA	2	10	526446	526455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021284	TAATA	2	10	537986	537995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021284	ATTTT	2	10	538008	538017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021284	ATATT	2	10	538114	538123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021284	CTTTT	2	10	538182	538191	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021284	TTTTC	2	10	538249	538258	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021284	TATTT	2	10	541692	541701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021284	ATTTT	2	10	544133	544142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021284	ACATA	2	10	547009	547018	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021284	AATTT	2	10	551074	551083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021284	TAAAT	2	10	552211	552220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021284	TAATT	2	10	555498	555507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021284	TTTTA	2	10	561261	561270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021284	TAATT	2	10	566170	566179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021284	TATTT	2	10	568810	568819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021284	ATAAA	2	10	574803	574812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021284	TTATC	2	10	576979	576988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021284	TTTAA	2	10	576995	577004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021284	TAATC	2	10	580134	580143	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021284	ATAAA	2	10	594396	594405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021284	TTAAT	2	10	603049	603058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021284	TAAAA	2	10	616695	616704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021284	TTATT	2	10	618928	618937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021284	AATAA	2	10	621850	621859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021284	TAAAA	2	10	621924	621933	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021284	CAATA	2	10	646912	646921	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021284	ATTAA	2	10	649011	649020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021284	GATAA	2	10	649057	649066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021284	ATTAT	2	10	649717	649726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021284	TTTTA	2	10	655010	655019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021284	ATTAT	2	10	656538	656547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021284	AAAGT	2	10	657212	657221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021284	TATAA	2	10	658849	658858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021284	AATAA	2	10	663658	663667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021284	ATTAA	2	10	680653	680662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021284	TCATT	2	10	683086	683095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021284	AAAAT	2	10	685417	685426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021284	AAATT	2	10	685671	685680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021284	GTATA	2	10	685789	685798	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021284	CATTT	2	10	691457	691466	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021284	TTAAT	2	10	694227	694236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021284	AATAA	2	10	694278	694287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021284	TTATT	2	10	698554	698563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021284	TAAAT	2	10	699935	699944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021284	AAATA	2	10	700825	700834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021284	TTTTA	2	10	705831	705840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021284	ACTAT	2	10	735769	735778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021284	TAAAA	2	10	739044	739053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021284	ATTTA	2	10	751734	751743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021284	TTTTA	2	10	751748	751757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021284	TAAAG	2	10	759849	759858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021284	TAATC	2	10	775081	775090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021284	ATTAT	2	10	775928	775937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021284	AAATT	2	10	777800	777809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021284	AAAAT	2	10	782002	782011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021284	TCTAT	2	10	788598	788607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021284	TTATT	2	10	789913	789922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021284	TAAAA	2	10	801764	801773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021284	TAAAA	2	10	802983	802992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_021284	AAAGA	2	10	1095616	1095625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.