MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma chrysopicola DF-1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021280	TTTTTA	2	12	17828	17839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021280	AGAAAT	2	12	109268	109279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021280	GAAAAA	2	12	120469	120480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021280	TTAGTA	2	12	124163	124174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021280	TATTTT	2	12	152538	152549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021280	ATGAAT	2	12	172132	172143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021280	TTTTTA	2	12	267068	267079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021280	ATTTTT	2	12	272483	272494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021280	ATATTA	2	12	272535	272546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021280	AATTAT	2	12	276087	276098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021280	GAGGAA	2	12	298109	298120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021280	TTAGAT	2	12	366279	366290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021280	TTTTTC	2	12	378961	378972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021280	ACAAAG	2	12	383215	383226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021280	AAAATA	2	12	383487	383498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021280	AAAATA	2	12	385959	385970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021280	TTAAAA	2	12	428586	428597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021280	TTCGGG	2	12	428910	428921	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021280	TCCCTC	2	12	428930	428941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021280	GAAAGC	2	12	434832	434843	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021280	TGTTTT	2	12	458848	458859	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021280	TTATTT	2	12	466117	466128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021280	AAAATA	2	12	475372	475383	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021280	TAAAAA	2	12	479722	479733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021280	ATACAA	2	12	484958	484969	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021280	TAAAAC	2	12	485317	485328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021280	AAATTT	2	12	487008	487019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021280	TTTACG	2	12	505132	505143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021280	ATAAAT	2	12	505268	505279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021280	GTAAAA	2	12	517185	517196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021280	TTCAGA	2	12	525272	525283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021280	TACTGT	2	12	529012	529023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021280	TTTTAA	2	12	541573	541584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021280	TATATT	2	12	543472	543483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021280	TTATTT	2	12	545274	545285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021280	AACAAA	2	12	549249	549260	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021280	TAAAAA	2	12	556406	556417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021280	ACTATA	2	12	629855	629866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021280	TATATT	2	12	637805	637816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021280	TGATTT	2	12	645196	645207	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021280	AAATTA	2	12	669312	669323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021280	ATTTAA	2	12	669378	669389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021280	ATTTTT	2	12	673143	673154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021280	AAACAT	2	12	677141	677152	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021280	TTAAAA	2	12	687028	687039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021280	TAAAAA	2	12	747800	747811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021280	ATATTT	2	12	794776	794787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021280	AAAAAG	2	12	811987	811998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021280	ATATTA	2	12	812028	812039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021280	GTAAAT	2	12	820130	820141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021280	ATATAG	2	12	864584	864595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021280	TCCTTT	2	12	868571	868582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021280	ATTTTT	2	12	875630	875641	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021280	ATAAAA	2	12	880043	880054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021280	AAAATA	2	12	882621	882632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021280	ACATTA	2	12	883002	883013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021280	ATTTAT	2	12	883579	883590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021280	TAAAAA	2	12	897972	897983	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021280	TGCTCT	2	12	899326	899337	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021280	TTTAAA	2	12	948870	948881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021280	TTTATT	2	12	963733	963744	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021280	TAAAAA	2	12	977288	977299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021280	ATTTTT	2	12	999391	999402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021280	AGTTTT	2	12	1031515	1031526	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021280	ATTTTT	2	12	1047035	1047046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021280	TTATAA	2	12	1081227	1081238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021280	ATTTGT	2	12	1085072	1085083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021280	TTAAAT	2	12	1104697	1104708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.