MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 422

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	AG	3	6	2870	2875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021236	AT	3	6	2982	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021236	AG	3	6	3047	3052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021236	GA	3	6	3107	3112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021236	TA	3	6	4206	4211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021236	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021236	TA	3	6	4701	4706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021236	CA	3	6	5411	5416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021236	TA	3	6	7252	7257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021236	TA	4	8	7347	7354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021236	CT	3	6	7787	7792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021236	AT	3	6	11816	11821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021236	AT	3	6	12044	12049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021236	AT	3	6	12272	12277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021236	AT	3	6	12593	12598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021236	TA	3	6	13061	13066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021236	AT	3	6	15004	15009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021236	TG	3	6	16166	16171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021236	TA	3	6	16713	16718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021236	TC	4	8	16891	16898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021236	TC	3	6	18925	18930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021236	AT	4	8	18953	18960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021236	AT	3	6	19399	19404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021236	AT	3	6	20003	20008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021236	AT	3	6	20297	20302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021236	AC	3	6	31530	31535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021236	TA	3	6	34344	34349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021236	AT	3	6	36711	36716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021236	AT	4	8	43577	43584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021236	AT	3	6	43590	43595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021236	AT	3	6	46546	46551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021236	CT	3	6	46589	46594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021236	AT	3	6	53537	53542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021236	AT	4	8	63731	63738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021236	TA	3	6	64743	64748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021236	TC	3	6	71733	71738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021236	AT	3	6	82794	82799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021236	AG	3	6	83356	83361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021236	AT	3	6	91450	91455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021236	AT	3	6	91838	91843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021236	TA	6	12	93967	93978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021236	AT	3	6	95163	95168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021236	AT	3	6	95180	95185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021236	TA	3	6	95261	95266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021236	AT	4	8	95273	95280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021236	TA	5	10	95455	95464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021236	AT	3	6	95983	95988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021236	TA	3	6	96464	96469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021236	TC	4	8	98543	98550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021236	TA	3	6	108529	108534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021236	TA	3	6	117522	117527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021236	TA	3	6	117530	117535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021236	TA	3	6	117746	117751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021236	AT	3	6	122448	122453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021236	TA	3	6	122506	122511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021236	AT	3	6	123429	123434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021236	AG	3	6	131964	131969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021236	TA	3	6	137955	137960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021236	TC	3	6	146699	146704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021236	AG	3	6	149107	149112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021236	AT	3	6	153800	153805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021236	AT	3	6	154673	154678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021236	TA	3	6	158340	158345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021236	TA	3	6	158521	158526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021236	TA	3	6	158623	158628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021236	TA	3	6	158841	158846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021236	AT	4	8	158853	158860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021236	TA	3	6	158872	158877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021236	AT	3	6	158890	158895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021236	AT	3	6	171132	171137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021236	TA	3	6	171195	171200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021236	AT	4	8	171207	171214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021236	GA	3	6	179783	179788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021236	AT	3	6	184594	184599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021236	TA	3	6	185203	185208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021236	AT	3	6	187121	187126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021236	TA	4	8	188964	188971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021236	AT	3	6	206279	206284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021236	AT	6	12	207446	207457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021236	GA	3	6	211413	211418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021236	AT	3	6	212215	212220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021236	TA	3	6	212307	212312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021236	TA	4	8	214680	214687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021236	AT	3	6	216075	216080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021236	AT	3	6	218516	218521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021236	AT	3	6	218712	218717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021236	CA	3	6	219332	219337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021236	TG	4	8	219346	219353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021236	CT	3	6	221169	221174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021236	AT	3	6	224431	224436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021236	AT	3	6	224595	224600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021236	AT	3	6	238790	238795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021236	CA	3	6	252687	252692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021236	TG	3	6	259169	259174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021236	TA	3	6	259225	259230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021236	TA	4	8	266023	266030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021236	TA	3	6	266221	266226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021236	TA	4	8	267747	267754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021236	TA	3	6	269893	269898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021236	AT	3	6	273820	273825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021236	CA	3	6	273982	273987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021236	TA	3	6	274541	274546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021236	TA	3	6	274620	274625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021236	TA	3	6	274786	274791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021236	AT	3	6	279268	279273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021236	AT	3	6	279547	279552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021236	AT	3	6	285606	285611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021236	TG	3	6	291542	291547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021236	AT	3	6	291868	291873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021236	AT	3	6	293124	293129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021236	AT	3	6	293142	293147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021236	TA	4	8	294322	294329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021236	TA	3	6	294685	294690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021236	AT	3	6	299395	299400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021236	AT	3	6	305469	305474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021236	TA	3	6	306074	306079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021236	AT	3	6	312296	312301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021236	TC	3	6	324431	324436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021236	AT	3	6	327859	327864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021236	TA	4	8	328017	328024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021236	AT	3	6	332498	332503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021236	TA	3	6	332518	332523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021236	AT	3	6	332657	332662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021236	AT	3	6	332683	332688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021236	TA	3	6	332743	332748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021236	TA	3	6	332772	332777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021236	TA	3	6	336573	336578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021236	TC	3	6	340348	340353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021236	TA	3	6	341068	341073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021236	AT	3	6	348003	348008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021236	TA	3	6	350052	350057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021236	TA	3	6	360541	360546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021236	CT	3	6	369338	369343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021236	TA	3	6	371163	371168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021236	TA	3	6	374229	374234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021236	AT	3	6	378451	378456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021236	TA	4	8	378480	378487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021236	TA	3	6	379347	379352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021236	TA	3	6	384165	384170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021236	TA	3	6	384172	384177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021236	AT	3	6	385760	385765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021236	TA	3	6	389513	389518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021236	AG	3	6	389539	389544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021236	GC	4	8	390776	390783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021236	AT	3	6	391967	391972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021236	TA	3	6	392061	392066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021236	TA	3	6	395388	395393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021236	AT	3	6	395406	395411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021236	AT	3	6	395430	395435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021236	TA	5	10	396603	396612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021236	TA	3	6	396915	396920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021236	AT	3	6	396935	396940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021236	TA	3	6	397288	397293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021236	AT	3	6	398638	398643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021236	TA	3	6	410084	410089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.