MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 1090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021236	AGGA	2	8	1396	1403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021236	TAAA	2	8	2756	2763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021236	ATTT	2	8	2802	2809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021236	ATTA	2	8	3214	3221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021236	TAAA	2	8	4256	4263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021236	TAAT	2	8	4345	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021236	AAAT	2	8	5126	5133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021236	ATCC	2	8	5593	5600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021236	TAAT	2	8	7037	7044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021236	AAAT	2	8	7080	7087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021236	ATTT	2	8	7549	7556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021236	ATTT	2	8	7708	7715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021236	TAAA	2	8	7874	7881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021236	TTGT	2	8	8218	8225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021236	AAAT	2	8	8237	8244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021236	TTTG	2	8	11213	11220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021236	ATTT	2	8	11287	11294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021236	GCAT	2	8	11395	11402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021236	GAGC	2	8	11618	11625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021236	TCGC	2	8	11683	11690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021236	ATTT	2	8	11702	11709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021236	GGTA	2	8	11753	11760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021236	TAAA	2	8	12608	12615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021236	TAAA	2	8	12847	12854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021236	ATTA	2	8	12941	12948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021236	AATA	3	12	14961	14972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021236	ATTA	2	8	15028	15035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021236	TTTC	2	8	15782	15789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021236	ATAA	2	8	15803	15810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021236	AATT	2	8	16086	16093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021236	TTTC	2	8	16149	16156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021236	ATCA	3	12	16557	16568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021236	TAAA	2	8	16700	16707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021236	AGGA	2	8	16936	16943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021236	TAAA	2	8	17470	17477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021236	TTGA	2	8	19075	19082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021236	AGGC	2	8	19090	19097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021236	TAAT	2	8	19235	19242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021236	ATGA	2	8	20349	20356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021236	AACA	2	8	20386	20393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021236	TAAT	2	8	20471	20478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021236	AGTC	2	8	20654	20661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021236	ATTT	2	8	20739	20746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021236	AAAT	2	8	25767	25774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021236	ATTT	2	8	31309	31316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021236	AAAC	2	8	31537	31544	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021236	CAAA	2	8	31635	31642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021236	TATC	2	8	32046	32053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021236	AAGA	2	8	32103	32110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021236	ATTT	2	8	32266	32273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021236	TGTT	2	8	32296	32303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021236	TAAT	2	8	34023	34030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021236	ACTA	2	8	34106	34113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021236	ATTA	2	8	34534	34541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021236	ATTA	2	8	34666	34673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021236	TGAC	2	8	39379	39386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021236	TGAT	2	8	39640	39647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021236	ACTA	2	8	39799	39806	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021236	TAAT	2	8	41838	41845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021236	CAAA	2	8	41846	41853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021236	AAAT	2	8	41935	41942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021236	TAAT	2	8	41950	41957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021236	GTGG	2	8	43397	43404	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021236	ATTT	2	8	43462	43469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021236	TAAT	2	8	43475	43482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021236	AAAG	2	8	43596	43603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021236	TTTC	2	8	43630	43637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021236	TAAT	2	8	43765	43772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021236	ATTA	2	8	44795	44802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021236	TAAA	2	8	44822	44829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021236	ATAA	2	8	45672	45679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021236	TAAT	2	8	46535	46542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021236	AAAT	2	8	47921	47928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021236	ATCA	2	8	50127	50134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021236	AGTC	2	8	50387	50394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021236	TAGT	2	8	52573	52580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021236	AGGA	2	8	52638	52645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021236	TTAA	2	8	57237	57244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021236	CATA	2	8	57810	57817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021236	GATT	2	8	62983	62990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021236	GTGG	2	8	63550	63557	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021236	ATTT	2	8	63617	63624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021236	TAAT	2	8	63630	63637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021236	TAAT	2	8	63819	63826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021236	ATAA	2	8	63840	63847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021236	ATTT	2	8	63884	63891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021236	AATT	2	8	64130	64137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021236	AAAT	2	8	64201	64208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021236	AATA	2	8	67597	67604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021236	TTTG	2	8	67833	67840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021236	AATA	2	8	67847	67854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021236	CATT	2	8	68333	68340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021236	TATT	2	8	68387	68394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021236	TAAT	2	8	69076	69083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021236	ATTT	3	12	69125	69136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021236	TTTG	2	8	69172	69179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021236	TTGT	2	8	69213	69220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021236	TGCT	2	8	71472	71479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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101	NC_021236	GAAA	2	8	72373	72380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021236	GAAA	2	8	72390	72397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021236	ATTA	2	8	72498	72505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021236	ATTA	2	8	72608	72615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021236	TGCT	2	8	76064	76071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021236	TGCT	2	8	76088	76095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021236	GACT	2	8	76202	76209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021236	TTTA	2	8	76393	76400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021236	ATAA	2	8	76536	76543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021236	ATGC	2	8	76574	76581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021236	GTTG	2	8	76804	76811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021236	AATT	2	8	79513	79520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021236	ATAA	2	8	79547	79554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021236	CAAA	2	8	79697	79704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021236	TAAA	2	8	80294	80301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021236	ATTT	2	8	80306	80313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021236	CTAA	2	8	82723	82730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021236	ATAA	2	8	82783	82790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021236	GAAA	2	8	83391	83398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021236	AAAG	2	8	84204	84211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021236	AAAT	2	8	88836	88843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021236	TTAA	2	8	88849	88856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021236	TTAT	2	8	89188	89195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021236	AATT	2	8	89570	89577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021236	AAAG	2	8	90930	90937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021236	AAAT	2	8	90987	90994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021236	ATAA	2	8	91177	91184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021236	TAAT	2	8	91637	91644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021236	CAAA	2	8	91676	91683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021236	ACCA	2	8	93641	93648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021236	TTTA	2	8	93810	93817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021236	AATT	2	8	94118	94125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021236	AAAG	2	8	95217	95224	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021236	TTTC	2	8	95251	95258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021236	AATT	2	8	95349	95356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021236	GTTG	2	8	95944	95951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021236	AATC	2	8	97969	97976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021236	ATTT	2	8	98866	98873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021236	TAAT	2	8	98901	98908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021236	TTCC	2	8	109411	109418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021236	ACTA	2	8	109477	109484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021236	GATT	2	8	109579	109586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021236	AAAT	2	8	109641	109648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021236	ATAA	2	8	112030	112037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021236	TAAT	2	8	112385	112392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021236	TAAT	2	8	113902	113909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021236	TAAT	2	8	114074	114081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021236	TATT	2	8	114919	114926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021236	TTTA	2	8	115003	115010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021236	TAAT	2	8	115125	115132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021236	AATT	2	8	115341	115348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021236	ATTA	2	8	117035	117042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021236	ATTA	2	8	117081	117088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021236	TTTA	2	8	117132	117139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021236	TAAA	2	8	117432	117439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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