MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11

Total Repeats: 8931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021236	TAA	2	6	420726	420731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021236	TCGC	2	8	420788	420795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_021236	TACGG	2	10	420834	420843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3504	NC_021236	ATCA	2	8	420888	420895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_021236	TCT	2	6	420944	420949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021236	GGA	2	6	421096	421101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021236	TTAC	2	8	421161	421168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_021236	CCA	2	6	421194	421199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_021236	ATG	2	6	421286	421291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021236	GCT	2	6	421362	421367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021236	CCT	2	6	421378	421383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_021236	GTT	2	6	421385	421390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021236	CTG	2	6	421495	421500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021236	TTGA	2	8	421525	421532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021236	TCC	2	6	421707	421712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_021236	CA	3	6	421887	421892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_021236	CA	3	6	421918	421923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_021236	AGT	2	6	422002	422007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021236	TCC	2	6	422027	422032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_021236	TTG	2	6	422068	422073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021236	CTT	2	6	422112	422117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021236	CTT	2	6	422123	422128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_021236	GTG	2	6	422165	422170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021236	ACT	2	6	422199	422204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021236	TTA	2	6	422215	422220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021236	CTTT	2	8	422221	422228	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_021236	TCCT	2	8	422265	422272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_021236	GAT	2	6	422281	422286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021236	T	7	7	422431	422437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021236	TGT	2	6	422444	422449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021236	T	7	7	422470	422476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021236	TATTT	2	10	422488	422497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021236	ACC	2	6	422519	422524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_021236	A	6	6	422582	422587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021236	T	6	6	422596	422601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021236	TC	3	6	422605	422610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_021236	GAT	2	6	422620	422625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021236	T	7	7	422629	422635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021236	AGG	2	6	422644	422649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021236	ATCC	2	8	422652	422659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_021236	CTT	2	6	422729	422734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021236	GT	3	6	422789	422794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021236	ATG	2	6	422824	422829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021236	T	6	6	422898	422903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021236	ATG	2	6	422984	422989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021236	CGT	2	6	422996	423001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021236	TCC	2	6	423010	423015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_021236	ATG	2	6	423054	423059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021236	AAC	2	6	423066	423071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021236	CACGA	2	10	423109	423118	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3551	NC_021236	GAC	2	6	423122	423127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021236	CAC	2	6	423135	423140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_021236	ACA	2	6	423230	423235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021236	CGTA	2	8	423287	423294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_021236	GCC	2	6	423443	423448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_021236	TCC	2	6	423463	423468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_021236	AT	3	6	423469	423474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021236	AAT	2	6	423612	423617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021236	GCT	2	6	423652	423657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021236	CCA	2	6	423709	423714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_021236	TAA	2	6	423727	423732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021236	TCC	2	6	423790	423795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_021236	CTG	2	6	423814	423819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_021236	CAT	2	6	423887	423892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021236	AACT	2	8	423918	423925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_021236	CTT	2	6	423989	423994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_021236	CGC	2	6	424129	424134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_021236	T	7	7	424169	424175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021236	A	7	7	424211	424217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021236	A	7	7	424229	424235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021236	ATC	2	6	424248	424253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021236	ACC	2	6	424306	424311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_021236	CTG	2	6	424337	424342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021236	AATTT	2	10	424382	424391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021236	A	7	7	424421	424427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021236	T	8	8	424431	424438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021236	A	8	8	424439	424446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021236	A	8	8	424448	424455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021236	A	7	7	424469	424475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021236	A	9	9	426318	426326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021236	ATA	2	6	426351	426356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021236	A	6	6	426404	426409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021236	A	6	6	426566	426571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021236	TATT	2	8	426580	426587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021236	T	8	8	426596	426603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021236	A	10	10	426620	426629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021236	A	6	6	426645	426650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021236	A	7	7	426663	426669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021236	TA	3	6	428111	428116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021236	A	6	6	428130	428135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021236	TTA	2	6	428149	428154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021236	A	8	8	428188	428195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021236	A	6	6	428205	428210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021236	AAT	2	6	428223	428228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021236	AAAAAT	2	12	428409	428420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021236	A	6	6	428448	428453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021236	TAAA	2	8	428458	428465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021236	A	7	7	428463	428469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021236	AAAATA	2	12	428499	428510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021236	GAT	2	6	428538	428543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021236	A	8	8	428589	428596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021236	A	6	6	429877	429882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021236	A	6	6	429915	429920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021236	CCT	2	6	430076	430081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_021236	TAA	2	6	430082	430087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021236	A	6	6	431045	431050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021236	TAA	2	6	431399	431404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021236	CTTTC	2	10	431704	431713	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3609	NC_021236	ATT	2	6	431728	431733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021236	A	11	11	431742	431752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021236	GCAA	2	8	431755	431762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_021236	A	6	6	431767	431772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021236	T	7	7	431781	431787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021236	A	8	8	432803	432810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021236	A	7	7	432823	432829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021236	A	7	7	432831	432837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021236	T	7	7	432841	432847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021236	ACTTT	2	10	432870	432879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3619	NC_021236	T	7	7	432896	432902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021236	TTGAT	2	10	432916	432925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021236	T	7	7	432936	432942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021236	ATT	2	6	432960	432965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021236	T	7	7	432977	432983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021236	AATT	2	8	432984	432991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021236	GAA	3	9	433002	433010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021236	T	7	7	433018	433024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021236	T	6	6	433027	433032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021236	TTA	2	6	433075	433080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021236	TAT	2	6	433102	433107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021236	TTA	2	6	433141	433146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021236	TTAA	2	8	433153	433160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021236	T	7	7	433181	433187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021236	A	8	8	433198	433205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_021236	TA	3	6	433210	433215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_021236	A	7	7	433215	433221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_021236	ATA	2	6	433230	433235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_021236	TTAA	2	8	433248	433255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3638	NC_021236	T	6	6	433261	433266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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