MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 3087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021213	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021213	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021213	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021213	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021213	CTG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021213	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021213	TTG	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021213	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021213	GAA	2	6	4214	4219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021213	TCT	2	6	4275	4280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021213	ATT	2	6	4302	4307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021213	ACA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021213	TTC	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021213	GTT	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021213	GAT	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021213	AAT	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021213	AGG	2	6	10523	10528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021213	AAC	2	6	13083	13088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021213	CTA	2	6	13644	13649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021213	CAA	2	6	15940	15945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021213	AGA	2	6	16528	16533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021213	GAT	2	6	16614	16619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021213	AGA	2	6	16700	16705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021213	AAT	2	6	16712	16717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021213	AGA	2	6	16862	16867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021213	GGC	2	6	17007	17012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021213	ATA	2	6	17117	17122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021213	GCA	2	6	17325	17330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021213	CGC	2	6	17372	17377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021213	TGT	2	6	17411	17416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021213	AGA	2	6	17420	17425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021213	AGA	2	6	17432	17437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021213	CAG	2	6	17494	17499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021213	GGA	2	6	17684	17689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021213	GAA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021213	GGT	2	6	18022	18027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021213	GTC	2	6	18036	18041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021213	CAT	2	6	18104	18109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021213	TAA	2	6	18139	18144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021213	GGA	2	6	18148	18153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021213	ATC	2	6	18172	18177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021213	CGC	2	6	18338	18343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021213	CAC	2	6	18383	18388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021213	GAT	2	6	18454	18459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021213	GGC	2	6	18496	18501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021213	CCT	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021213	TCT	2	6	18544	18549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021213	AGG	2	6	18610	18615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021213	AAC	2	6	18645	18650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021213	GTT	2	6	18655	18660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021213	TAA	2	6	18803	18808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021213	ACG	2	6	18873	18878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021213	TAG	2	6	19044	19049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021213	AGG	2	6	19066	19071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021213	AGA	2	6	19131	19136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021213	TCG	2	6	19234	19239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021213	GGA	2	6	19247	19252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021213	ACA	2	6	19365	19370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021213	ATG	2	6	19432	19437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021213	TAT	2	6	19497	19502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021213	GGA	2	6	19565	19570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021213	ACC	2	6	19831	19836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021213	AAT	2	6	19851	19856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021213	AGC	2	6	19911	19916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021213	AAG	2	6	20048	20053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021213	GAG	2	6	20063	20068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021213	ACA	2	6	20219	20224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021213	GAT	2	6	20623	20628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021213	AGG	2	6	20668	20673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021213	CGG	2	6	20714	20719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021213	TAC	2	6	20984	20989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021213	CCT	2	6	21072	21077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021213	GGT	2	6	21208	21213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021213	TCG	2	6	21323	21328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021213	CGT	2	6	21403	21408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021213	AGT	2	6	21794	21799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021213	CAG	2	6	21845	21850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021213	AGT	2	6	21871	21876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021213	ACC	2	6	22394	22399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021213	CGT	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021213	CGC	2	6	22824	22829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021213	GGA	2	6	22928	22933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021213	TCC	2	6	23011	23016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021213	CTA	2	6	23021	23026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021213	AGC	2	6	23038	23043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021213	TCG	2	6	23052	23057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021213	CGG	2	6	23164	23169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021213	TAT	2	6	23212	23217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021213	GGT	2	6	23270	23275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021213	TAA	2	6	24801	24806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021213	GAG	2	6	24862	24867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021213	AGG	2	6	26228	26233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021213	CTT	2	6	27230	27235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021213	TAT	2	6	27258	27263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021213	TGT	2	6	30531	30536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021213	AGG	2	6	39768	39773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021213	GAA	2	6	43656	43661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021213	GAA	2	6	43675	43680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021213	ATT	2	6	43708	43713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021213	GAC	2	6	43756	43761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021213	AAT	2	6	43795	43800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021213	TGA	2	6	43808	43813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021213	ATG	2	6	43846	43851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021213	ATT	3	9	44054	44062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021213	AAT	2	6	44103	44108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021213	ATA	2	6	44194	44199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021213	TTG	2	6	44246	44251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021213	GAG	2	6	44678	44683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021213	AAT	2	6	44713	44718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021213	CAA	2	6	44771	44776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021213	GTT	2	6	44814	44819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021213	GAT	2	6	46138	46143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021213	AGT	2	6	47772	47777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021213	ACT	2	6	47807	47812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021213	TTA	2	6	47995	48000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021213	GAA	2	6	48220	48225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021213	GAT	2	6	48227	48232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021213	TGG	2	6	48261	48266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021213	ATT	2	6	49926	49931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021213	AGA	2	6	52602	52607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021213	TCG	2	6	52609	52614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021213	GTT	2	6	52619	52624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021213	ATT	2	6	52822	52827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021213	GTA	2	6	52843	52848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021213	CAA	2	6	52866	52871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021213	TTG	2	6	52887	52892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021213	TAA	3	9	54344	54352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021213	TGA	2	6	54363	54368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021213	GTG	2	6	56573	56578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021213	GAA	2	6	57539	57544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021213	GTC	2	6	57620	57625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021213	TGG	2	6	57627	57632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021213	GAA	2	6	57652	57657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021213	AGG	2	6	57714	57719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021213	ATA	2	6	59104	59109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021213	GAA	2	6	59129	59134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021213	AGG	2	6	63410	63415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021213	ATG	2	6	63466	63471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021213	AGG	2	6	64376	64381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021213	TAA	2	6	65597	65602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021213	GTT	2	6	66832	66837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021213	TAA	2	6	66880	66885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021213	ATA	2	6	66957	66962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021213	TAA	2	6	66977	66982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021213	ACT	2	6	77222	77227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_021213	GAG	2	6	87469	87474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_021213	TTG	2	6	108508	108513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021213	ATT	2	6	116789	116794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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