MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 6021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021213	TTA	2	6	107159	107164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021213	CGA	2	6	107168	107173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021213	CGT	2	6	107183	107188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021213	A	6	6	107305	107310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021213	TAAAC	2	10	107388	107397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
506	NC_021213	TA	3	6	107401	107406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021213	AGC	2	6	107415	107420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021213	GCT	2	6	107427	107432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021213	ATT	2	6	108411	108416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021213	TA	3	6	108436	108441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021213	TGT	2	6	108465	108470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021213	TTG	2	6	108508	108513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021213	AC	3	6	108527	108532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_021213	T	6	6	112909	112914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021213	A	6	6	114255	114260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021213	TTC	2	6	114261	114266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021213	TAT	2	6	114269	114274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021213	ATT	2	6	116789	116794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021213	GT	3	6	116799	116804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021213	GCA	2	6	116835	116840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021213	GCT	2	6	116872	116877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021213	TCA	2	6	116962	116967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021213	TA	3	6	116976	116981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021213	A	6	6	117118	117123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021213	CGT	2	6	117163	117168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021213	TTC	2	6	117182	117187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021213	CAA	2	6	117232	117237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021213	GTT	2	6	117276	117281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021213	TG	3	6	117320	117325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021213	CGT	2	6	117367	117372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021213	CGA	2	6	117391	117396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021213	CAA	2	6	117436	117441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021213	ATGG	2	8	121098	121105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021213	GCTA	2	8	121186	121193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_021213	CTG	2	6	121200	121205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021213	ATT	2	6	121206	121211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021213	AAGAA	2	10	121249	121258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021213	ATT	2	6	121263	121268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021213	TC	4	8	124932	124939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_021213	GAAA	2	8	124967	124974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021213	AT	4	8	124977	124984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021213	T	6	6	126433	126438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021213	ATT	2	6	126439	126444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021213	A	6	6	126450	126455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021213	GAG	2	6	126493	126498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021213	A	6	6	130211	130216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021213	A	6	6	130355	130360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021213	ATCAA	2	10	130365	130374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
549	NC_021213	CAG	2	6	130423	130428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021213	T	6	6	130459	130464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021213	AGTAT	2	10	130476	130485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021213	AT	3	6	130495	130500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021213	CTTAT	2	10	130529	130538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
554	NC_021213	ATT	2	6	130545	130550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021213	AC	3	6	130565	130570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_021213	T	6	6	130592	130597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021213	A	6	6	130644	130649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021213	TCT	2	6	130660	130665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021213	T	6	6	130676	130681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021213	TA	3	6	130701	130706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021213	T	6	6	130707	130712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021213	G	6	6	130771	130776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021213	ATT	3	9	130777	130785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021213	TGAAT	2	10	130852	130861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021213	ATG	2	6	130892	130897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021213	TAT	2	6	130938	130943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021213	TCT	2	6	130961	130966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_021213	ATTT	2	8	130969	130976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021213	T	7	7	131013	131019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021213	T	6	6	131047	131052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021213	A	6	6	131059	131064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021213	AATC	2	8	131104	131111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_021213	AT	3	6	131146	131151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021213	CAA	2	6	131195	131200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021213	AT	3	6	131243	131248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021213	ATC	2	6	133019	133024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021213	CTT	2	6	133070	133075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021213	CAAA	2	8	133099	133106	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_021213	AGG	2	6	133114	133119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021213	GAAT	2	8	133355	133362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021213	CCT	2	6	135139	135144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_021213	TCC	2	6	136272	136277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_021213	CAA	2	6	136297	136302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021213	TTC	2	6	136321	136326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021213	TTG	2	6	136330	136335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021213	TAG	2	6	136388	136393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021213	TGT	2	6	136573	136578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021213	CCT	2	6	136784	136789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_021213	GAT	2	6	136907	136912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021213	TGG	2	6	136968	136973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021213	CTG	2	6	137559	137564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021213	TGTT	2	8	137571	137578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021213	CTGT	2	8	137599	137606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_021213	CTTTT	2	10	137621	137630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
595	NC_021213	AAT	2	6	137636	137641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021213	T	6	6	137662	137667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021213	T	6	6	137675	137680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021213	CCT	2	6	137713	137718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_021213	TAT	2	6	137734	137739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021213	GAA	2	6	137749	137754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021213	AGT	2	6	137759	137764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021213	GGT	2	6	137767	137772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021213	CCT	2	6	138092	138097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_021213	A	6	6	138767	138772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021213	CCT	2	6	138987	138992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_021213	TGT	2	6	139047	139052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021213	TGG	2	6	139071	139076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021213	ATTTTT	2	12	139077	139088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021213	TGTT	2	8	139090	139097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021213	ATT	2	6	139914	139919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021213	AAT	2	6	139940	139945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021213	A	6	6	139947	139952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021213	AGG	2	6	139958	139963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021213	ATT	2	6	139965	139970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021213	TAA	3	9	139990	139998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021213	AAT	2	6	140013	140018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021213	AG	3	6	140040	140045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021213	AGAA	2	8	141980	141987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021213	GTT	2	6	142001	142006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021213	GTA	2	6	142009	142014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021213	TATG	2	8	142016	142023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021213	TAA	2	6	142051	142056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021213	AAG	2	6	142103	142108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021213	GTT	2	6	142188	142193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021213	T	6	6	142203	142208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021213	CTG	2	6	142253	142258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021213	A	6	6	143449	143454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021213	AGAA	2	8	143507	143514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021213	AT	3	6	145794	145799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021213	GT	3	6	145801	145806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021213	GGATG	2	10	145866	145875	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021213	AC	3	6	145984	145989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_021213	T	7	7	146000	146006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021213	T	6	6	146019	146024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021213	TGC	2	6	146608	146613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021213	AG	3	6	146620	146625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021213	ATTC	2	8	147973	147980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_021213	TA	3	6	147984	147989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021213	A	7	7	147991	147997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021213	CTTTT	2	10	148027	148036	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
641	NC_021213	TCC	2	6	149103	149108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_021213	TAC	2	6	149119	149124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_021213	TTG	2	6	149247	149252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_021213	CAA	2	6	149333	149338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_021213	TAT	2	6	149405	149410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_021213	AATA	2	8	152628	152635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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653	NC_021213	CTATA	2	10	153092	153101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
654	NC_021213	CGA	2	6	153140	153145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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656	NC_021213	CCA	2	6	153181	153186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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675	NC_021213	AT	3	6	159615	159620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_021213	GTTT	2	8	159678	159685	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_021213	TTG	2	6	161806	161811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
682	NC_021213	TG	3	6	161839	161844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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684	NC_021213	CTCTG	2	10	163043	163052	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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689	NC_021213	AGA	2	6	171278	171283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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717	NC_021213	TTA	2	6	178021	178026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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721	NC_021213	A	6	6	180024	180029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
722	NC_021213	GTCT	2	8	180045	180052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
723	NC_021213	GT	3	6	180232	180237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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923	NC_021213	GAGTGG	2	12	249746	249757	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
924	NC_021213	CAA	2	6	249789	249794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
925	NC_021213	GTT	2	6	249808	249813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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929	NC_021213	AGGGC	2	10	252919	252928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
930	NC_021213	AGCAG	2	10	252952	252961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
931	NC_021213	GA	3	6	252967	252972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
932	NC_021213	GTG	2	6	253044	253049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
933	NC_021213	CTA	2	6	253171	253176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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936	NC_021213	AGA	2	6	253234	253239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
937	NC_021213	TGG	2	6	253263	253268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
938	NC_021213	A	6	6	253278	253283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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945	NC_021213	T	9	9	253450	253458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
946	NC_021213	TAG	2	6	253471	253476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
947	NC_021213	GTG	2	6	253830	253835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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950	NC_021213	TAA	2	6	253909	253914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
951	NC_021213	AAG	2	6	255501	255506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
952	NC_021213	GAT	2	6	256523	256528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
953	NC_021213	ATA	2	6	256535	256540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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955	NC_021213	AT	4	8	256567	256574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_021213	AACG	2	8	257537	257544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
959	NC_021213	GGT	2	6	257589	257594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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972	NC_021213	TTA	2	6	267131	267136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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