MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 6021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021213	TGT	2	6	1869895	1869900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_021213	TTAC	2	8	1869911	1869918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_021213	AT	4	8	1869931	1869938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_021213	TA	3	6	1869950	1869955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021213	AT	3	6	1869982	1869987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021213	T	6	6	1870012	1870017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021213	CAAA	2	8	1870023	1870030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_021213	CTA	2	6	1871141	1871146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_021213	CT	3	6	1875195	1875200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_021213	ACC	2	6	1875202	1875207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_021213	AGC	2	6	1875211	1875216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_021213	CTG	2	6	1875232	1875237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_021213	CAA	2	6	1875288	1875293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_021213	ATT	2	6	1876298	1876303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021213	TTTCT	2	10	1876314	1876323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5516	NC_021213	CGA	2	6	1876338	1876343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_021213	ATC	2	6	1876366	1876371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_021213	CCG	2	6	1876394	1876399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_021213	TCAA	2	8	1877183	1877190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_021213	TTC	2	6	1877293	1877298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_021213	AAG	2	6	1877314	1877319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_021213	TAA	2	6	1878755	1878760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021213	TCC	2	6	1878761	1878766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_021213	TC	3	6	1878771	1878776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_021213	A	6	6	1879334	1879339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_021213	CA	3	6	1879389	1879394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_021213	GCT	2	6	1879411	1879416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_021213	TCC	2	6	1879421	1879426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_021213	CACG	2	8	1879439	1879446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_021213	TTA	3	9	1879460	1879468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021213	AGC	2	6	1879552	1879557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_021213	A	6	6	1879583	1879588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021213	TTTC	2	8	1880126	1880133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_021213	TGC	2	6	1880138	1880143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_021213	CCT	2	6	1880173	1880178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_021213	AT	3	6	1880224	1880229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021213	A	7	7	1880262	1880268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021213	AGT	2	6	1882411	1882416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021213	CTC	2	6	1882457	1882462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_021213	AG	3	6	1882477	1882482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021213	TCT	2	6	1882523	1882528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_021213	AAG	2	6	1882529	1882534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021213	ATC	2	6	1882537	1882542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_021213	GTGG	2	8	1882551	1882558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021213	TAA	2	6	1883735	1883740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021213	GTT	2	6	1883767	1883772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021213	TAA	2	6	1885441	1885446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021213	TTA	2	6	1885447	1885452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021213	ATT	2	6	1885464	1885469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021213	TTAG	2	8	1885496	1885503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_021213	TAA	2	6	1885520	1885525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021213	TATC	2	8	1885559	1885566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_021213	TAG	2	6	1886233	1886238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021213	ATG	2	6	1886275	1886280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021213	TTTTG	2	10	1889179	1889188	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021213	GTC	2	6	1889197	1889202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_021213	ACCA	2	8	1889218	1889225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_021213	AAG	2	6	1889577	1889582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021213	TCC	2	6	1891086	1891091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_021213	TCT	2	6	1891112	1891117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021213	AATA	2	8	1891126	1891133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021213	A	6	6	1891149	1891154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021213	AGA	2	6	1891157	1891162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021213	A	6	6	1891168	1891173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021213	AGA	2	6	1891180	1891185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021213	GGTT	2	8	1891186	1891193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_021213	AACC	2	8	1891197	1891204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_021213	TCT	2	6	1891205	1891210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_021213	AGT	2	6	1891265	1891270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021213	ATT	3	9	1891291	1891299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021213	T	6	6	1891307	1891312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_021213	TTC	2	6	1891315	1891320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_021213	GCA	2	6	1891326	1891331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5575	NC_021213	GATA	2	8	1897734	1897741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021213	TAT	2	6	1897770	1897775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_021213	TAA	2	6	1897828	1897833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021213	ATA	2	6	1897848	1897853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021213	AAT	2	6	1898340	1898345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021213	AT	3	6	1901263	1901268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_021213	TC	3	6	1902250	1902255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_021213	TCAT	2	8	1902261	1902268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_021213	TAA	2	6	1902335	1902340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021213	CAA	2	6	1902344	1902349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_021213	AAT	2	6	1903857	1903862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021213	CCT	2	6	1903870	1903875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_021213	A	7	7	1903896	1903902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_021213	TATT	2	8	1903907	1903914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021213	A	6	6	1903925	1903930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_021213	TCT	2	6	1903935	1903940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_021213	TAT	2	6	1903968	1903973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_021213	ATA	2	6	1903990	1903995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021213	ATC	2	6	1904012	1904017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_021213	A	6	6	1904046	1904051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_021213	GCT	2	6	1904120	1904125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_021213	ATT	2	6	1904131	1904136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_021213	T	6	6	1904135	1904140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_021213	CTT	2	6	1904152	1904157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021213	T	8	8	1904197	1904204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021213	TAT	2	6	1904209	1904214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021213	GCAAT	2	10	1904235	1904244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5603	NC_021213	ATGCA	2	10	1904245	1904254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5604	NC_021213	TAAAAA	2	12	1904281	1904292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_021213	A	6	6	1904297	1904302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021213	AAATC	2	10	1904319	1904328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_021213	GAA	2	6	1904376	1904381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021213	ATT	2	6	1904593	1904598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021213	ATG	2	6	1904662	1904667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_021213	A	6	6	1904725	1904730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021213	A	6	6	1904751	1904756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_021213	ATT	2	6	1904817	1904822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_021213	AT	3	6	1904846	1904851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021213	CTG	2	6	1904852	1904857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_021213	TA	3	6	1904870	1904875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021213	TTG	2	6	1904881	1904886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021213	T	6	6	1904892	1904897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021213	AGA	2	6	1904919	1904924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021213	TGA	2	6	1904934	1904939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5621	NC_021213	ACA	2	6	1905065	1905070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_021213	A	6	6	1905107	1905112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_021213	AAT	2	6	1905119	1905124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_021213	A	6	6	1907603	1907608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021213	GAA	2	6	1907614	1907619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021213	TG	3	6	1907640	1907645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_021213	TGT	3	9	1907658	1907666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_021213	ACT	2	6	1907720	1907725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_021213	TA	3	6	1908883	1908888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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