MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021176	ATTG	2	8	40	47	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021176	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021176	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021176	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021176	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021176	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021176	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021176	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021176	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021176	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021176	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021176	A	7	7	5924	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021176	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021176	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021176	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021176	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021176	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021176	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021176	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021176	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021176	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021176	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021176	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021176	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021176	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021176	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021176	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021176	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021176	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021176	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021176	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021176	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021176	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021176	A	6	6	11424	11429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021176	T	6	6	11430	11435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021176	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021176	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021176	A	8	8	11499	11506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021176	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021176	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021176	GTAT	2	8	14770	14777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021176	T	7	7	14786	14792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021176	TTG	2	6	14841	14846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021176	CAG	2	6	14883	14888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021176	A	9	9	14908	14916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021176	TGA	2	6	14924	14929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021176	T	6	6	14943	14948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021176	TAT	2	6	14976	14981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021176	T	7	7	14991	14997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021176	ATG	2	6	16007	16012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021176	ATT	2	6	16061	16066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021176	T	6	6	16484	16489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021176	TATTG	2	10	17582	17591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021176	ATT	2	6	17618	17623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021176	GTT	2	6	17710	17715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021176	GTT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021176	ATC	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021176	T	6	6	17797	17802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021176	CCA	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021176	GC	3	6	21187	21192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021176	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021176	TCTTAA	2	12	23209	23220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021176	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021176	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021176	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021176	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021176	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021176	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021176	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021176	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021176	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021176	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021176	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021176	T	6	6	24369	24374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021176	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021176	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021176	A	6	6	24429	24434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021176	T	7	7	25029	25035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021176	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021176	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021176	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021176	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021176	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021176	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021176	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021176	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021176	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021176	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021176	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021176	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021176	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021176	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021176	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021176	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021176	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021176	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021176	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021176	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021176	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021176	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021176	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021176	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021176	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021176	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021176	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021176	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021176	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021176	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021176	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021176	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021176	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021176	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021176	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021176	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021176	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021176	ACGGTG	2	12	28237	28248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021176	TTG	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021176	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021176	ATC	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021176	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021176	TCC	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021176	AT	3	6	30536	30541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021176	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021176	GGT	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021176	GT	3	6	33045	33050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021176	ATA	2	6	33138	33143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021176	T	6	6	33150	33155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021176	T	6	6	33158	33163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021176	T	6	6	33190	33195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021176	CAT	2	6	33205	33210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021176	TTTTA	2	10	33215	33224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021176	TAA	2	6	33259	33264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021176	GTG	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021176	ATG	2	6	33331	33336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021176	CCAG	2	8	33350	33357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021176	TAAA	2	8	34389	34396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021176	A	6	6	34425	34430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021176	TA	3	6	34437	34442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021176	CTT	2	6	34451	34456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021176	T	7	7	34455	34461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021176	AGA	2	6	34464	34469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021176	ATA	2	6	34495	34500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021176	ATA	3	9	34849	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021176	T	6	6	34903	34908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021176	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021176	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021176	T	6	6	34944	34949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021176	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021176	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_021176	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021176	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021176	A	6	6	35093	35098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021176	ATTTT	2	10	35222	35231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021176	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021176	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021176	TTG	2	6	35291	35296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021176	TAA	2	6	35323	35328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021176	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021176	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021176	GTT	2	6	44210	44215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021176	A	6	6	46086	46091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021176	A	6	6	94456	94461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021176	CT	3	6	94528	94533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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284	NC_021176	TGA	2	6	94887	94892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_021176	ACTC	2	8	95089	95096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_021176	GCC	2	6	95101	95106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_021176	ATT	2	6	95121	95126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021176	TAA	2	6	95132	95137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021176	TGT	3	9	95209	95217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021176	AAT	2	6	95226	95231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021176	ATA	2	6	95268	95273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021176	TAT	2	6	95281	95286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021176	TTTC	2	8	95436	95443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
296	NC_021176	TAA	2	6	95525	95530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021176	T	7	7	95535	95541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021176	TAAAA	2	10	95569	95578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021176	AAT	2	6	95598	95603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021176	TTAT	2	8	95621	95628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_021176	TAA	2	6	95719	95724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_021176	CCG	2	6	158287	158292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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424	NC_021176	T	10	10	159327	159336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_021176	CGCGG	2	10	160070	160079	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
428	NC_021176	GGTC	2	8	162849	162856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
429	NC_021176	ATT	2	6	162866	162871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_021176	T	6	6	162939	162944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_021176	GGCA	2	8	164406	164413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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433	NC_021176	A	7	7	167085	167091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_021176	ACG	2	6	171446	171451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_021176	TGC	2	6	173933	173938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_021176	AAT	2	6	178044	178049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_021176	CCT	2	6	178125	178130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_021176	ATT	2	6	178168	178173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_021176	CCT	2	6	178252	178257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_021176	CCT	2	6	178329	178334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_021176	TTA	2	6	179300	179305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_021176	TGT	2	6	184036	184041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_021176	TGCC	2	8	188648	188655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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492	NC_021176	TTA	2	6	192272	192277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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