MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021176	GGT	2	6	1055178	1055183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021176	ATG	2	6	1055198	1055203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021176	GCG	2	6	1055207	1055212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021176	CCG	2	6	1055228	1055233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_021176	TTTC	2	8	1055346	1055353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_021176	CCGTT	2	10	1055424	1055433	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3507	NC_021176	ACC	2	6	1055534	1055539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_021176	CT	3	6	1055549	1055554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_021176	TGT	2	6	1055589	1055594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021176	TGA	2	6	1055595	1055600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021176	CCA	2	6	1055604	1055609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_021176	T	6	6	1055692	1055697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021176	AGC	2	6	1055729	1055734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021176	ACA	2	6	1055790	1055795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021176	CAT	2	6	1055818	1055823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021176	T	7	7	1055898	1055904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021176	GC	3	6	1055949	1055954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_021176	GGT	2	6	1055962	1055967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021176	GCG	2	6	1055970	1055975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_021176	TAA	2	6	1055976	1055981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021176	GCA	2	6	1056084	1056089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021176	GCA	2	6	1056200	1056205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_021176	GGA	2	6	1056284	1056289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021176	CAG	2	6	1056298	1056303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021176	CCT	2	6	1056336	1056341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_021176	GTA	2	6	1056373	1056378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021176	CCG	2	6	1056411	1056416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_021176	T	6	6	1056436	1056441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021176	TGAAA	2	10	1056555	1056564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021176	GC	3	6	1056648	1056653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_021176	TCG	2	6	1056671	1056676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021176	GA	3	6	1056680	1056685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021176	CAA	2	6	1056687	1056692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021176	AGC	2	6	1056710	1056715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021176	GTTAC	2	10	1056764	1056773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3536	NC_021176	ATG	2	6	1056803	1056808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021176	CG	3	6	1056810	1056815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_021176	GTG	2	6	1056860	1056865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021176	TAG	2	6	1056866	1056871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021176	TACCTG	2	12	1057003	1057014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021176	CCG	2	6	1057021	1057026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_021176	TC	3	6	1057075	1057080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_021176	TGA	2	6	1057168	1057173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021176	ACG	2	6	1057179	1057184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021176	GC	4	8	1059021	1059028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_021176	CAA	2	6	1059051	1059056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021176	AATCA	2	10	1059086	1059095	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3548	NC_021176	GGTT	2	8	1059098	1059105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021176	AAG	2	6	1059144	1059149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021176	T	7	7	1060570	1060576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021176	GCA	2	6	1060596	1060601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021176	GCC	2	6	1060608	1060613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_021176	CTAC	2	8	1060635	1060642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_021176	TGC	2	6	1060656	1060661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021176	GCC	2	6	1060665	1060670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_021176	TGC	2	6	1060672	1060677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021176	GCG	2	6	1064376	1064381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021176	CAGT	2	8	1064438	1064445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_021176	GCC	2	6	1064538	1064543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_021176	T	6	6	1064544	1064549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021176	TCG	2	6	1064584	1064589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021176	GGCA	2	8	1064597	1064604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_021176	CAT	2	6	1066430	1066435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_021176	CGG	2	6	1066449	1066454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021176	TCA	2	6	1066471	1066476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021176	GCG	2	6	1066481	1066486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_021176	CAA	2	6	1066499	1066504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021176	GC	3	6	1066971	1066976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_021176	T	7	7	1066977	1066983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021176	TGC	2	6	1067740	1067745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021176	CGG	2	6	1067753	1067758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021176	ATT	2	6	1068907	1068912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021176	AAAT	2	8	1068915	1068922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021176	TATT	2	8	1068929	1068936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021176	TTG	2	6	1069013	1069018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021176	GGA	2	6	1069044	1069049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021176	GGT	2	6	1069055	1069060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021176	CT	3	6	1069078	1069083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_021176	TTA	2	6	1069819	1069824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_021176	G	6	6	1069849	1069854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021176	ATT	2	6	1069914	1069919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021176	CGT	2	6	1070030	1070035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_021176	T	7	7	1070106	1070112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021176	TCA	2	6	1071806	1071811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_021176	AGCGC	2	10	1071839	1071848	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3587	NC_021176	AC	3	6	1071858	1071863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_021176	GAT	2	6	1073466	1073471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021176	TG	3	6	1075790	1075795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021176	TGTTT	2	10	1075801	1075810	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021176	TG	3	6	1075811	1075816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021176	CAG	2	6	1075859	1075864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021176	AG	3	6	1076865	1076870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021176	TGA	2	6	1076899	1076904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021176	AAC	2	6	1078384	1078389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021176	ATG	2	6	1079391	1079396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021176	GGC	2	6	1079433	1079438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_021176	A	6	6	1079461	1079466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021176	T	8	8	1079474	1079481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021176	TG	3	6	1079518	1079523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021176	TTA	2	6	1079538	1079543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021176	TAA	2	6	1079640	1079645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021176	GAG	2	6	1079687	1079692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021176	CACT	2	8	1081181	1081188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_021176	GGT	2	6	1081193	1081198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021176	T	7	7	1081280	1081286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021176	CAT	2	6	1081327	1081332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021176	TGA	2	6	1081355	1081360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021176	AC	3	6	1083225	1083230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_021176	GA	3	6	1083243	1083248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021176	GC	3	6	1085200	1085205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_021176	TA	3	6	1085208	1085213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021176	GCC	2	6	1085257	1085262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_021176	TA	3	6	1085276	1085281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021176	CTT	2	6	1086034	1086039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3617	NC_021176	CAT	2	6	1086804	1086809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3619	NC_021176	TCAT	2	8	1086849	1086856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_021176	GCG	2	6	1086868	1086873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021176	AT	3	6	1086950	1086955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021176	A	6	6	1086976	1086981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021176	CG	4	8	1089039	1089046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_021176	ATTC	2	8	1089774	1089781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_021176	GTC	2	6	1090522	1090527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_021176	TA	3	6	1090550	1090555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021176	T	6	6	1090801	1090806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021176	GCC	2	6	1090810	1090815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_021176	ATG	2	6	1090854	1090859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021176	ATTG	2	8	1090871	1090878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_021176	A	6	6	1092561	1092566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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