MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021176	GCG	2	6	943723	943728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021176	TGTCC	2	10	943739	943748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3004	NC_021176	GTT	2	6	943776	943781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021176	GTG	2	6	943829	943834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021176	TGT	2	6	943857	943862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021176	CGG	2	6	943885	943890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021176	GAC	2	6	943894	943899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_021176	TGCCG	2	10	943970	943979	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_021176	GCGTT	2	10	944061	944070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_021176	TGT	2	6	944101	944106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021176	CA	3	6	944131	944136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_021176	TTA	2	6	944162	944167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021176	ATT	2	6	948802	948807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021176	ACA	2	6	949904	949909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021176	A	6	6	949923	949928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021176	AAGG	2	8	949958	949965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021176	TAG	2	6	950947	950952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021176	GCC	2	6	950996	951001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_021176	T	6	6	951080	951085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3022	NC_021176	CCG	2	6	951173	951178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_021176	GCG	2	6	951224	951229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_021176	TCA	2	6	951285	951290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_021176	TTG	2	6	951293	951298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021176	T	6	6	951311	951316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3028	NC_021176	ATC	2	6	952838	952843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3030	NC_021176	T	7	7	952893	952899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021176	CGG	2	6	952984	952989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_021176	A	6	6	953077	953082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021176	T	6	6	953127	953132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021176	CA	3	6	953287	953292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_021176	TGG	2	6	953313	953318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021176	GATT	2	8	953387	953394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021176	AGA	2	6	953467	953472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021176	CTG	2	6	953514	953519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3041	NC_021176	CAT	2	6	953663	953668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021176	TTG	2	6	953798	953803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3044	NC_021176	GAT	2	6	954288	954293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021176	TCTTT	2	10	954313	954322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3049	NC_021176	CTG	2	6	955906	955911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3053	NC_021176	TTA	2	6	956433	956438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021176	CAT	2	6	956482	956487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3059	NC_021176	ATG	2	6	956613	956618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3061	NC_021176	TAAA	2	8	956642	956649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021176	CTC	2	6	956721	956726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3070	NC_021176	TCAT	2	8	959135	959142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3081	NC_021176	T	6	6	960600	960605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021176	T	7	7	960628	960634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021176	ATT	2	6	960639	960644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_021176	AAATTT	2	12	960898	960909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021176	AAT	2	6	960936	960941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_021176	TAT	2	6	961085	961090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021176	AAT	2	6	961118	961123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021176	ATA	2	6	961127	961132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021176	TTA	2	6	961143	961148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021176	TTA	2	6	961836	961841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_021176	CA	3	6	963573	963578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_021176	ATA	2	6	963673	963678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021176	AG	3	6	963766	963771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021176	TCCC	2	8	963798	963805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3113	NC_021176	T	7	7	963856	963862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021176	A	7	7	963863	963869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021176	AG	3	6	963938	963943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_021176	ATAAA	2	10	964114	964123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021176	T	6	6	964151	964156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_021176	AT	3	6	964163	964168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021176	T	6	6	964185	964190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021176	TAA	2	6	964196	964201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3125	NC_021176	TAAA	2	8	964241	964248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021176	A	7	7	964259	964265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021176	A	6	6	964297	964302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3130	NC_021176	AAATCT	2	12	964394	964405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3131	NC_021176	CAT	2	6	964504	964509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_021176	G	6	6	964558	964563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021176	CCA	2	6	964574	964579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_021176	GTA	2	6	964612	964617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021176	ATG	2	6	964658	964663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3400	NC_021176	TA	3	6	1027479	1027484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3401	NC_021176	TTAA	2	8	1027512	1027519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3407	NC_021176	TTG	2	6	1029311	1029316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3408	NC_021176	CTGG	2	8	1029324	1029331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3409	NC_021176	CTG	2	6	1029564	1029569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3410	NC_021176	T	6	6	1029602	1029607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3411	NC_021176	CGG	2	6	1029651	1029656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3412	NC_021176	TC	3	6	1029697	1029702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3413	NC_021176	TG	3	6	1029708	1029713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_021176	TCC	2	6	1029750	1029755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3415	NC_021176	TCC	2	6	1029778	1029783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3416	NC_021176	CTGC	2	8	1029825	1029832	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3417	NC_021176	A	7	7	1029833	1029839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3429	NC_021176	TG	3	6	1033615	1033620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3430	NC_021176	TGTAG	2	10	1033631	1033640	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3431	NC_021176	GCT	2	6	1033709	1033714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3435	NC_021176	ATCG	2	8	1034423	1034430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3436	NC_021176	T	7	7	1034488	1034494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3439	NC_021176	T	6	6	1034580	1034585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_021176	AATAA	2	10	1034644	1034653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3441	NC_021176	GCTG	2	8	1035409	1035416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3442	NC_021176	TGA	2	6	1035456	1035461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3443	NC_021176	AATG	2	8	1035520	1035527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3444	NC_021176	TCT	2	6	1035550	1035555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3447	NC_021176	AAGCG	2	10	1035831	1035840	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3448	NC_021176	TGA	2	6	1035848	1035853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3452	NC_021176	GCG	2	6	1038223	1038228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3457	NC_021176	TTTA	2	8	1038830	1038837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_021176	AGCTT	2	10	1053851	1053860	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3500	NC_021176	TG	3	6	1055150	1055155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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