MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021176	GCG	2	6	4549881	4549886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15502	NC_021176	CCG	3	9	4549979	4549987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_021176	GCG	2	6	4550003	4550008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_021176	TGT	2	6	4550045	4550050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_021176	CTT	2	6	4550060	4550065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_021176	T	6	6	4550091	4550096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_021176	CCAGCG	2	12	4550111	4550122	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15508	NC_021176	CGC	2	6	4550123	4550128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15509	NC_021176	GGC	2	6	4550147	4550152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_021176	TCA	2	6	4550234	4550239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_021176	GTA	2	6	4550241	4550246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_021176	GGGC	2	8	4550308	4550315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15513	NC_021176	GCG	2	6	4550320	4550325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_021176	GCG	2	6	4550447	4550452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_021176	CG	3	6	4550522	4550527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15516	NC_021176	CCAGCG	2	12	4550585	4550596	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15517	NC_021176	CAT	2	6	4550634	4550639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_021176	TCC	2	6	4550794	4550799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15519	NC_021176	CGC	2	6	4550849	4550854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15520	NC_021176	AGC	2	6	4550872	4550877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_021176	CGG	2	6	4550921	4550926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_021176	TTC	2	6	4550985	4550990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_021176	GCT	2	6	4551035	4551040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_021176	GC	4	8	4551074	4551081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15525	NC_021176	TGG	2	6	4551170	4551175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_021176	GCT	2	6	4551182	4551187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_021176	ATCC	2	8	4551201	4551208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15528	NC_021176	TTG	2	6	4551216	4551221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_021176	CGA	2	6	4551263	4551268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_021176	CAG	2	6	4551300	4551305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_021176	GC	3	6	4551320	4551325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15532	NC_021176	GTT	2	6	4551444	4551449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_021176	TCG	2	6	4551475	4551480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_021176	GCG	2	6	4551556	4551561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_021176	GTC	2	6	4551566	4551571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_021176	GGC	2	6	4551590	4551595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_021176	CGT	2	6	4551599	4551604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_021176	GCTG	2	8	4551620	4551627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15539	NC_021176	GCTCCT	2	12	4551653	4551664	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15540	NC_021176	GCTG	2	8	4551692	4551699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15541	NC_021176	ATT	2	6	4551774	4551779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_021176	GC	3	6	4551787	4551792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15543	NC_021176	CG	3	6	4551843	4551848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15544	NC_021176	CGC	2	6	4551927	4551932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15545	NC_021176	TTTG	2	8	4551959	4551966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_021176	GCG	2	6	4551982	4551987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_021176	TC	3	6	4552049	4552054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15548	NC_021176	TTG	2	6	4553044	4553049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_021176	A	6	6	4553081	4553086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_021176	ACG	2	6	4553100	4553105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15551	NC_021176	T	8	8	4555614	4555621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_021176	TGT	2	6	4555648	4555653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_021176	T	7	7	4555670	4555676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_021176	ATTCTG	2	12	4555690	4555701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15555	NC_021176	GGCGT	2	10	4555710	4555719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15556	NC_021176	T	6	6	4555726	4555731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_021176	T	6	6	4555756	4555761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_021176	CAAA	2	8	4555789	4555796	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15559	NC_021176	A	6	6	4555804	4555809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_021176	ACG	2	6	4555863	4555868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15561	NC_021176	CAA	2	6	4555890	4555895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_021176	ACC	2	6	4556003	4556008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15563	NC_021176	GGC	2	6	4556035	4556040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_021176	AAGT	2	8	4556069	4556076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_021176	A	6	6	4556328	4556333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_021176	A	6	6	4556379	4556384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_021176	T	6	6	4556420	4556425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_021176	TTTTTA	2	12	4556446	4556457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_021176	AAT	2	6	4556471	4556476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_021176	TTA	2	6	4564184	4564189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_021176	GA	3	6	4565520	4565525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_021176	A	6	6	4565559	4565564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_021176	GCC	2	6	4565565	4565570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15574	NC_021176	GAT	2	6	4565591	4565596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_021176	CGG	2	6	4565605	4565610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_021176	ACC	2	6	4567994	4567999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15577	NC_021176	GGT	2	6	4568016	4568021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_021176	GATG	2	8	4569644	4569651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_021176	ACGCT	2	10	4569662	4569671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15580	NC_021176	ATG	2	6	4569682	4569687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_021176	TTG	2	6	4569697	4569702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_021176	CAT	2	6	4569721	4569726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15583	NC_021176	T	6	6	4569760	4569765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_021176	AAAT	2	8	4569779	4569786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_021176	AGC	2	6	4569788	4569793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15588	NC_021176	AGA	2	6	4572783	4572788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_021176	AAC	2	6	4572839	4572844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15590	NC_021176	T	6	6	4573598	4573603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_021176	A	6	6	4573607	4573612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_021176	CCAT	2	8	4573613	4573620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15593	NC_021176	T	9	9	4573631	4573639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_021176	TTTA	2	8	4573686	4573693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_021176	A	6	6	4573695	4573700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_021176	GAGATA	2	12	4573701	4573712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_021176	GGC	2	6	4574127	4574132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_021176	GCC	2	6	4574701	4574706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15599	NC_021176	CAA	2	6	4574821	4574826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_021176	GC	3	6	4574950	4574955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15601	NC_021176	TCG	2	6	4574970	4574975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_021176	TCTG	2	8	4575041	4575048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15603	NC_021176	AGG	2	6	4578043	4578048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_021176	GTA	2	6	4579690	4579695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_021176	TTA	2	6	4580010	4580015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_021176	TGTT	2	8	4580056	4580063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_021176	AATC	2	8	4580117	4580124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15608	NC_021176	ATT	2	6	4580574	4580579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_021176	GA	3	6	4580634	4580639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_021176	GAT	2	6	4582175	4582180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_021176	A	6	6	4582215	4582220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_021176	TGTT	2	8	4583328	4583335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_021176	AAG	2	6	4583388	4583393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_021176	T	6	6	4583405	4583410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_021176	GA	3	6	4583424	4583429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_021176	AGA	3	9	4583438	4583446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_021176	A	6	6	4583507	4583512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_021176	ATT	2	6	4583551	4583556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_021176	GC	3	6	4583558	4583563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15620	NC_021176	TTG	2	6	4583590	4583595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_021176	CCAAT	2	10	4585171	4585180	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15622	NC_021176	A	6	6	4588150	4588155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_021176	G	6	6	4588168	4588173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_021176	CCT	2	6	4588493	4588498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15625	NC_021176	CAG	2	6	4588499	4588504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15626	NC_021176	TAACCA	2	12	4588557	4588568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_021176	TGT	2	6	4588598	4588603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_021176	A	6	6	4588606	4588611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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