MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021176	TCA	2	6	367888	367893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021176	TTTAA	2	10	375211	375220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021176	ATT	2	6	375239	375244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021176	CATA	2	8	375252	375259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_021176	CGC	2	6	375385	375390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_021176	GC	4	8	375457	375464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_021176	GCA	2	6	375512	375517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021176	ATC	2	6	375668	375673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021176	CCG	2	6	375830	375835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_021176	CGG	2	6	375840	375845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021176	CTG	2	6	375877	375882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021176	CGG	2	6	375891	375896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021176	GCC	2	6	375967	375972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_021176	AGA	2	6	376073	376078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021176	TCG	2	6	376135	376140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021176	GCT	2	6	376161	376166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021176	CAC	2	6	376170	376175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_021176	GAT	2	6	376197	376202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021176	TCA	3	9	376208	376216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021176	GC	3	6	376246	376251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_021176	TGG	2	6	376310	376315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021176	GGGGC	2	10	376449	376458	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_021176	GCG	2	6	376474	376479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_021176	CG	4	8	376487	376494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_021176	CGG	2	6	376559	376564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021176	TGA	2	6	376633	376638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_021176	GGA	2	6	376796	376801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021176	CTG	2	6	376872	376877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_021176	CT	3	6	376944	376949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_021176	GGC	2	6	377009	377014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021176	GAAT	2	8	377030	377037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021176	GC	3	6	377164	377169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_021176	ATC	2	6	377209	377214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1037	NC_021176	GCA	2	6	377270	377275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1039	NC_021176	GGAAA	2	10	377368	377377	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021176	A	6	6	377375	377380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021176	GCA	3	9	377426	377434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021176	CG	3	6	377467	377472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_021176	CGG	2	6	377530	377535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021176	CGC	2	6	377542	377547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_021176	ATT	2	6	377550	377555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021176	TGG	2	6	377586	377591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021176	GGC	2	6	377619	377624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021176	TGG	2	6	377692	377697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021176	TTG	2	6	380009	380014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021176	ATTTT	2	10	380024	380033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021176	A	7	7	380034	380040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021176	AAC	2	6	380098	380103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021176	ATT	2	6	380612	380617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021176	T	6	6	380711	380716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021176	TAA	2	6	380741	380746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021176	CATT	2	8	381950	381957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_021176	AAT	2	6	381981	381986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021176	AAT	2	6	382011	382016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021176	CAA	2	6	382059	382064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021176	TAAC	2	8	382136	382143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_021176	GGGC	2	8	382161	382168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_021176	TCG	2	6	382177	382182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021176	CTGTAG	2	12	382209	382220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1064	NC_021176	GCG	2	6	384358	384363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021176	GTTC	2	8	384400	384407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_021176	A	6	6	387572	387577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021176	AAC	2	6	387612	387617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021176	CG	3	6	387631	387636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_021176	TGA	2	6	387642	387647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021176	T	6	6	387648	387653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021176	AGCGC	2	10	389173	389182	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1072	NC_021176	GAG	2	6	389219	389224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021176	GCAGA	2	10	389474	389483	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_021176	CGG	2	6	389558	389563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021176	TTATT	2	10	389564	389573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021176	ATT	2	6	389605	389610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_021176	TATT	2	8	389651	389658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021176	CTTTT	2	10	389691	389700	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_021176	AT	3	6	389706	389711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021176	GTTA	2	8	389720	389727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021176	ATC	2	6	389741	389746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_021176	CTC	2	6	389899	389904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_021176	CCTG	2	8	389905	389912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_021176	A	6	6	389933	389938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_021176	ACT	2	6	389985	389990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021176	TTA	2	6	389991	389996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021176	TCA	2	6	390080	390085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1095	NC_021176	ATT	2	6	390183	390188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_021176	GGC	2	6	390314	390319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021176	CG	3	6	390345	390350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_021176	GAA	2	6	390464	390469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021176	CG	4	8	390475	390482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_021176	GCTG	2	8	390504	390511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_021176	TAC	2	6	390554	390559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021176	GGTT	2	8	390655	390662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021176	ATA	2	6	390687	390692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1108	NC_021176	GGC	2	6	390742	390747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021176	TCA	2	6	390825	390830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021176	CCA	2	6	390888	390893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_021176	CAT	2	6	390983	390988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021176	ATT	2	6	390995	391000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021176	CGC	2	6	391027	391032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_021176	GGT	2	6	391051	391056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021176	CAA	2	6	391081	391086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021176	CCTG	2	8	391109	391116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_021176	GCGCA	2	10	391136	391145	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_021176	GTG	2	6	391214	391219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021176	CAG	2	6	391232	391237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021176	TCG	2	6	391257	391262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021176	ACA	2	6	391263	391268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021176	GC	3	6	391308	391313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_021176	GTG	2	6	391334	391339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021176	TGG	2	6	391398	391403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021176	A	6	6	391442	391447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_021176	GC	3	6	391632	391637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_021176	GCC	2	6	391664	391669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1402	NC_021176	TACC	2	8	411285	411292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1406	NC_021176	GAC	2	6	411421	411426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1433	NC_021176	CGAG	2	8	417367	417374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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