MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021176	CGA	2	6	198562	198567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021176	TAT	2	6	198572	198577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021176	TTG	2	6	198604	198609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021176	T	6	6	202816	202821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021176	TG	3	6	202849	202854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021176	TCA	2	6	202859	202864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021176	GAAT	2	8	202893	202900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021176	GCG	2	6	202937	202942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021176	TTA	2	6	202943	202948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021176	ATT	2	6	204310	204315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021176	AT	3	6	204322	204327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021176	AAGT	2	8	204344	204351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021176	TCA	2	6	206102	206107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021176	ACT	2	6	206131	206136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021176	AGG	2	6	206146	206151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021176	GAC	2	6	206610	206615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021176	T	6	6	206637	206642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021176	AT	3	6	206656	206661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021176	TGA	2	6	209247	209252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021176	GCGCT	2	10	209265	209274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
521	NC_021176	ATA	2	6	210159	210164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021176	TGA	2	6	210166	210171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021176	TTGCG	2	10	210230	210239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
524	NC_021176	TAA	2	6	211451	211456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021176	ATC	2	6	212673	212678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021176	TTC	2	6	215835	215840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021176	TTC	2	6	215877	215882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021176	AGA	2	6	216657	216662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021176	TGAA	2	8	216693	216700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021176	AAT	2	6	216717	216722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021176	TTA	2	6	216793	216798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021176	TAA	2	6	217430	217435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021176	TAT	2	6	217511	217516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021176	TTA	2	6	217517	217522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021176	T	6	6	217530	217535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021176	TTA	2	6	217591	217596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021176	GT	3	6	217612	217617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021176	T	6	6	217642	217647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021176	AT	3	6	217663	217668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021176	TA	3	6	217684	217689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021176	ATT	2	6	217709	217714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021176	ATTTA	2	10	217727	217736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021176	TTG	2	6	217770	217775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021176	ATA	2	6	217781	217786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021176	CTC	2	6	219620	219625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_021176	TAA	2	6	219696	219701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021176	AG	3	6	219746	219751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021176	CAT	2	6	219773	219778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021176	CGC	2	6	219782	219787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_021176	AACG	2	8	220786	220793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_021176	ACGC	2	8	221387	221394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
552	NC_021176	TAA	2	6	221407	221412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021176	GA	3	6	225246	225251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021176	TCT	3	9	225254	225262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021176	GTC	2	6	225263	225268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021176	GAA	2	6	225274	225279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021176	TCC	2	6	227953	227958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_021176	ATAA	2	8	227959	227966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021176	TTA	2	6	227981	227986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021176	CCTT	2	8	227989	227996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_021176	GTT	2	6	228005	228010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021176	CGA	2	6	228056	228061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021176	TGC	2	6	228076	228081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021176	TAA	3	9	228087	228095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021176	TCA	2	6	228121	228126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021176	CTC	2	6	228167	228172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_021176	GTA	2	6	228192	228197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021176	TGTC	2	8	228217	228224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_021176	GGC	2	6	228233	228238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021176	AGA	2	6	228251	228256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021176	CGC	2	6	228320	228325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_021176	ACC	2	6	228342	228347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_021176	A	6	6	228367	228372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021176	GGT	2	6	228389	228394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021176	AGATGC	2	12	228406	228417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
576	NC_021176	CAGT	2	8	228426	228433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_021176	AAG	2	6	228436	228441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021176	ATCC	2	8	228603	228610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_021176	GTTGA	2	10	228623	228632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021176	ACT	2	6	228707	228712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021176	GAAA	2	8	228721	228728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021176	TTCAA	2	10	228729	228738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
583	NC_021176	GGAC	2	8	228744	228751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_021176	GC	3	6	228830	228835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_021176	AGC	2	6	228846	228851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021176	TGA	2	6	228907	228912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021176	GAAC	2	8	228946	228953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_021176	CTA	2	6	228964	228969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_021176	GGCT	2	8	228971	228978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_021176	ACA	2	6	229053	229058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021176	TGG	2	6	229080	229085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021176	A	6	6	229164	229169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021176	GCG	2	6	229190	229195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021176	ATGCGT	2	12	229328	229339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
595	NC_021176	GC	3	6	229365	229370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_021176	CGG	2	6	229417	229422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021176	AAAC	2	8	229451	229458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_021176	GGAAT	2	10	229483	229492	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021176	CGG	2	6	229510	229515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021176	AT	3	6	229579	229584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021176	ACC	2	6	229596	229601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_021176	GTT	3	9	229784	229792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021176	CCG	2	6	229833	229838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_021176	CCAA	2	8	229841	229848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_021176	AGC	2	6	229909	229914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021176	CGT	2	6	230025	230030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_021176	GCAGC	2	10	230142	230151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
608	NC_021176	GATG	2	8	230155	230162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021176	GTC	2	6	230165	230170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021176	TAA	2	6	230224	230229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021176	GCT	2	6	230256	230261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021176	GGC	2	6	234131	234136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021176	GTAAGC	2	12	234178	234189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
614	NC_021176	TCT	2	6	235653	235658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021176	CCA	2	6	242936	242941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_021176	CTT	2	6	242987	242992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021176	TGCTC	2	10	243048	243057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
618	NC_021176	AGG	2	6	243060	243065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021176	CGG	2	6	244232	244237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021176	CGCTT	2	10	244238	244247	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
621	NC_021176	AC	3	6	244308	244313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_021176	TCA	2	6	244715	244720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021176	AAT	2	6	244735	244740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021176	CCA	2	6	244762	244767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_021176	A	7	7	244776	244782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021176	AGA	2	6	244797	244802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021176	GCG	2	6	244830	244835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021176	GTG	2	6	244983	244988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021176	TAT	2	6	245032	245037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021176	GC	3	6	245050	245055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_021176	T	7	7	245071	245077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021176	G	6	6	246259	246264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021176	ATAA	2	8	247130	247137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021176	TGG	2	6	249841	249846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021176	AGT	2	6	249872	249877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021176	GAT	2	6	250743	250748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021176	AAT	2	6	250755	250760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021176	TCAG	2	8	250783	250790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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916	NC_021176	CGCTA	2	10	340843	340852	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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921	NC_021176	T	6	6	342492	342497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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923	NC_021176	T	6	6	344177	344182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
924	NC_021176	T	6	6	344190	344195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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942	NC_021176	CTG	2	6	350644	350649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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951	NC_021176	CGC	2	6	350974	350979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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953	NC_021176	GC	4	8	351059	351066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
954	NC_021176	GGC	2	6	351182	351187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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957	NC_021176	GGC	2	6	351283	351288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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963	NC_021176	TAA	2	6	354428	354433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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989	NC_021176	AAG	2	6	365517	365522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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