MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021176	TCGG	2	8	2666390	2666397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_021176	CGC	2	6	2666412	2666417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_021176	CACCG	2	10	2666455	2666464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9004	NC_021176	TCT	2	6	2666588	2666593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_021176	GGTT	2	8	2666616	2666623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_021176	AGT	2	6	2666889	2666894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_021176	CGC	2	6	2666922	2666927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_021176	TCG	2	6	2667059	2667064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_021176	AAT	2	6	2667181	2667186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_021176	GCC	2	6	2667281	2667286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_021176	CCG	2	6	2668359	2668364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9012	NC_021176	CAC	2	6	2668396	2668401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_021176	AAT	2	6	2671098	2671103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_021176	AT	3	6	2671120	2671125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_021176	TTA	2	6	2671136	2671141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_021176	AAACA	2	10	2671162	2671171	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9017	NC_021176	AAT	2	6	2671217	2671222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_021176	AAC	2	6	2671228	2671233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_021176	ATA	2	6	2671267	2671272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_021176	A	6	6	2671277	2671282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_021176	ACA	2	6	2671296	2671301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_021176	ACG	2	6	2671310	2671315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_021176	ATA	2	6	2671319	2671324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_021176	TCA	2	6	2671334	2671339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_021176	ATT	2	6	2671368	2671373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_021176	TCC	2	6	2671399	2671404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9027	NC_021176	AAAT	2	8	2671409	2671416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_021176	ATT	2	6	2673646	2673651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_021176	AAC	2	6	2676573	2676578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_021176	CTG	3	9	2676614	2676622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_021176	GCCGC	2	10	2676627	2676636	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9032	NC_021176	C	6	6	2676636	2676641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9033	NC_021176	GC	3	6	2676713	2676718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9034	NC_021176	CTG	3	9	2676758	2676766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_021176	CAG	2	6	2676779	2676784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_021176	CA	3	6	2676814	2676819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9037	NC_021176	TCCA	2	8	2676855	2676862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_021176	GCT	2	6	2676865	2676870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_021176	GCG	2	6	2676908	2676913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_021176	GC	3	6	2676917	2676922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_021176	GGC	2	6	2676934	2676939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_021176	GC	3	6	2676938	2676943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_021176	GCC	2	6	2676997	2677002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9044	NC_021176	GC	3	6	2677029	2677034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9045	NC_021176	TCCG	2	8	2677075	2677082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9046	NC_021176	GCG	2	6	2677126	2677131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_021176	GTT	2	6	2677224	2677229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9049	NC_021176	CGCCAG	3	18	2677280	2677297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_021176	GCC	2	6	2677350	2677355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9051	NC_021176	TATC	2	8	2677376	2677383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9052	NC_021176	CA	3	6	2677385	2677390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_021176	ATG	2	6	2677421	2677426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_021176	TCG	2	6	2677449	2677454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_021176	CAG	2	6	2677476	2677481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_021176	TGG	2	6	2677517	2677522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_021176	TGA	2	6	2677591	2677596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_021176	AAG	2	6	2677745	2677750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_021176	CTT	2	6	2677821	2677826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_021176	A	8	8	2677834	2677841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_021176	T	7	7	2677867	2677873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_021176	ACGG	2	8	2677920	2677927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9063	NC_021176	CAGG	2	8	2677955	2677962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9064	NC_021176	TGC	2	6	2678072	2678077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_021176	GAT	2	6	2678093	2678098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_021176	ATT	2	6	2680120	2680125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_021176	GTC	2	6	2680936	2680941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_021176	AC	4	8	2680958	2680965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_021176	GCAC	2	8	2681046	2681053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9070	NC_021176	CGA	2	6	2682341	2682346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9073	NC_021176	CACT	2	8	2684110	2684117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9074	NC_021176	GTTT	2	8	2684135	2684142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_021176	AAT	2	6	2684163	2684168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9078	NC_021176	AAT	2	6	2687293	2687298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_021176	TAA	2	6	2687345	2687350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_021176	ACGG	2	8	2687359	2687366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9081	NC_021176	CAGG	2	8	2687394	2687401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9082	NC_021176	ACC	2	6	2687576	2687581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_021176	GCC	2	6	2687590	2687595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_021176	TC	3	6	2687669	2687674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9085	NC_021176	AC	3	6	2687756	2687761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9086	NC_021176	CGT	3	9	2687774	2687782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9088	NC_021176	C	6	6	2687960	2687965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9089	NC_021176	ACG	2	6	2688009	2688014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9092	NC_021176	ACC	2	6	2688204	2688209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9093	NC_021176	CCT	2	6	2688286	2688291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9094	NC_021176	CTC	2	6	2688323	2688328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9095	NC_021176	AGG	2	6	2688340	2688345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_021176	CCA	2	6	2688367	2688372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9097	NC_021176	GGT	2	6	2688427	2688432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_021176	CAT	2	6	2688622	2688627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_021176	GCC	2	6	2688697	2688702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9100	NC_021176	TAA	2	6	2688822	2688827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_021176	CAGC	2	8	2688835	2688842	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9102	NC_021176	TC	3	6	2688951	2688956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_021176	ACC	2	6	2688981	2688986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_021176	TTG	2	6	2689053	2689058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_021176	TCG	2	6	2689077	2689082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_021176	C	6	6	2689181	2689186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9107	NC_021176	CAA	2	6	2689422	2689427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_021176	CTTT	2	8	2689515	2689522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9109	NC_021176	ATG	2	6	2689525	2689530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_021176	GCT	2	6	2689531	2689536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_021176	GTT	2	6	2689621	2689626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_021176	ACG	2	6	2689636	2689641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_021176	GT	3	6	2689658	2689663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_021176	TCGGT	2	10	2689867	2689876	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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9116	NC_021176	CTT	2	6	2690075	2690080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_021176	CAC	2	6	2690146	2690151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9118	NC_021176	GTG	2	6	2690159	2690164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_021176	GTAC	2	8	2690180	2690187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9120	NC_021176	GTCA	2	8	2690263	2690270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9121	NC_021176	GGA	2	6	2690286	2690291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_021176	C	6	6	2690296	2690301	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9123	NC_021176	CG	3	6	2690388	2690393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9124	NC_021176	AC	3	6	2690415	2690420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_021176	CTC	2	6	2690441	2690446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9126	NC_021176	TCGC	2	8	2690452	2690459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_021176	TTTC	2	8	2690723	2690730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9128	NC_021176	TCA	2	6	2690734	2690739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_021176	GA	3	6	2690757	2690762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9131	NC_021176	GTT	2	6	2690779	2690784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9253	NC_021176	T	7	7	2718500	2718506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9259	NC_021176	CGT	2	6	2718670	2718675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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