MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021176	TGTC	2	8	1739051	1739058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_021176	CGG	2	6	1739088	1739093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_021176	T	6	6	1739175	1739180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021176	T	6	6	1739187	1739192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021176	GAA	2	6	1739208	1739213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021176	TTA	2	6	1743976	1743981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_021176	GAG	2	6	1743990	1743995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021176	GAAA	2	8	1744072	1744079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021176	A	7	7	1744077	1744083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_021176	A	6	6	1744107	1744112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021176	A	7	7	1744118	1744124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021176	CTT	2	6	1744147	1744152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_021176	ATAA	2	8	1745297	1745304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021176	TCC	2	6	1745308	1745313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_021176	CT	3	6	1745350	1745355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_021176	TTG	2	6	1745888	1745893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_021176	TAA	2	6	1745946	1745951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021176	GTTTTT	2	12	1746037	1746048	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021176	CTG	2	6	1747378	1747383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_021176	T	6	6	1747403	1747408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021176	TAC	2	6	1747436	1747441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_021176	GCC	2	6	1747452	1747457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_021176	ATT	2	6	1747471	1747476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_021176	CGC	2	6	1748969	1748974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6027	NC_021176	TATTT	2	10	1750166	1750175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021176	TG	3	6	1752212	1752217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6030	NC_021176	TTA	2	6	1752262	1752267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6034	NC_021176	TTA	2	6	1758310	1758315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6040	NC_021176	ACA	2	6	1760631	1760636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_021176	CTT	2	6	1760652	1760657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_021176	GAC	2	6	1761860	1761865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6044	NC_021176	CGGAT	2	10	1761959	1761968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6045	NC_021176	T	7	7	1761991	1761997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021176	TGT	2	6	1762016	1762021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6050	NC_021176	GAGAA	2	10	1762097	1762106	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021176	A	6	6	1762105	1762110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021176	AAG	2	6	1762153	1762158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021176	AACGT	2	10	1764053	1764062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6054	NC_021176	AAC	2	6	1764924	1764929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_021176	T	7	7	1764933	1764939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6058	NC_021176	CGG	2	6	1769174	1769179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_021176	TAA	2	6	1769191	1769196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6061	NC_021176	GC	3	6	1769274	1769279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_021176	AGC	2	6	1769292	1769297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_021176	GCG	2	6	1769319	1769324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_021176	ATA	2	6	1772925	1772930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_021176	TTA	2	6	1772940	1772945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_021176	TTAAC	2	10	1774132	1774141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6070	NC_021176	TA	3	6	1774205	1774210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_021176	ATTT	2	8	1774248	1774255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_021176	GTTT	2	8	1774285	1774292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6080	NC_021176	TTA	2	6	1777106	1777111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_021176	TGCC	2	8	1781545	1781552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6094	NC_021176	GGT	2	6	1781927	1781932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021176	TGA	2	6	1781950	1781955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_021176	A	6	6	1782247	1782252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_021176	GCA	2	6	1782304	1782309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_021176	CG	4	8	1782324	1782331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_021176	ATAA	2	8	1782369	1782376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021176	TTC	2	6	1782378	1782383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6108	NC_021176	CTGG	2	8	1782551	1782558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_021176	ATG	2	6	1782637	1782642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6113	NC_021176	GCC	2	6	1783085	1783090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_021176	CAC	2	6	1783092	1783097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_021176	CGG	3	9	1783386	1783394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_021176	ACG	2	6	1783429	1783434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_021176	CAA	2	6	1783533	1783538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_021176	GC	3	6	1783589	1783594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_021176	A	6	6	1783667	1783672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021176	CAT	2	6	1783705	1783710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_021176	G	6	6	1785205	1785210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_021176	GGACA	2	10	1785224	1785233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6123	NC_021176	TATT	2	8	1785248	1785255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_021176	AAAT	2	8	1785266	1785273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_021176	TTTG	2	8	1785283	1785290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021176	GCTC	2	8	1785369	1785376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_021176	TTA	2	6	1785415	1785420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_021176	A	7	7	1785433	1785439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_021176	A	6	6	1789785	1789790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_021176	TGTC	2	8	1789818	1789825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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