MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 16409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021176	GCC	2	6	1604828	1604833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_021176	CAC	2	6	1604941	1604946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_021176	AGCC	2	8	1605000	1605007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_021176	GC	3	6	1605049	1605054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_021176	TGC	2	6	1605150	1605155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_021176	ATA	2	6	1605174	1605179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021176	CGG	2	6	1605262	1605267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_021176	CG	3	6	1605325	1605330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_021176	CCCTGC	2	12	1605453	1605464	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_021176	CCA	2	6	1605566	1605571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_021176	CCCG	2	8	1605633	1605640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5512	NC_021176	GGC	2	6	1605705	1605710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_021176	GC	3	6	1605757	1605762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_021176	GC	3	6	1605936	1605941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_021176	GGCCA	2	10	1606010	1606019	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5516	NC_021176	GAA	2	6	1606027	1606032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021176	CGC	2	6	1606090	1606095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_021176	GCG	2	6	1606096	1606101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_021176	CGCC	2	8	1606111	1606118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5520	NC_021176	TCA	2	6	1606134	1606139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_021176	ATCA	2	8	1606151	1606158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_021176	CCGGC	2	10	1606408	1606417	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5523	NC_021176	CCA	2	6	1606609	1606614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_021176	GCG	2	6	1606734	1606739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_021176	CTG	2	6	1606817	1606822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_021176	GCA	2	6	1606912	1606917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_021176	CGCGG	2	10	1606941	1606950	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5528	NC_021176	CAAC	2	8	1607021	1607028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_021176	TCA	2	6	1607206	1607211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_021176	CAG	2	6	1607234	1607239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_021176	GGC	2	6	1607255	1607260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_021176	GCC	2	6	1607402	1607407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_021176	CGT	2	6	1607424	1607429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_021176	ATT	2	6	1607448	1607453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021176	CAT	2	6	1607454	1607459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_021176	ATT	2	6	1607474	1607479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021176	T	6	6	1607485	1607490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021176	TG	3	6	1607513	1607518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021176	CGC	2	6	1609091	1609096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_021176	TC	3	6	1609367	1609372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_021176	ATA	2	6	1609408	1609413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021176	GCA	2	6	1609415	1609420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_021176	GC	3	6	1609445	1609450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_021176	T	6	6	1609482	1609487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021176	TCC	2	6	1609516	1609521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_021176	TAAAA	2	10	1609565	1609574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021176	T	6	6	1609615	1609620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021176	ATA	2	6	1613192	1613197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021176	TCC	2	6	1613202	1613207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_021176	CT	3	6	1613244	1613249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_021176	TTG	2	6	1613782	1613787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021176	TAA	2	6	1613840	1613845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021176	A	7	7	1613905	1613911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021176	ATT	2	6	1614110	1614115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021176	ATTA	2	8	1614118	1614125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021176	ATT	2	6	1614201	1614206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021176	TCC	2	6	1614235	1614240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_021176	C	6	6	1614253	1614258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5559	NC_021176	AGC	2	6	1614271	1614276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_021176	AGG	2	6	1614348	1614353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_021176	AG	3	6	1614810	1614815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021176	CAT	3	9	1614833	1614841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_021176	GTG	2	6	1615214	1615219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021176	TTAA	2	8	1615225	1615232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021176	TGC	2	6	1615302	1615307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_021176	ACTT	2	8	1615331	1615338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_021176	TCGC	2	8	1615357	1615364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_021176	GCC	2	6	1615367	1615372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_021176	AATT	2	8	1615386	1615393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021176	GA	3	6	1615421	1615426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021176	AAC	2	6	1615428	1615433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021176	TGCC	2	8	1615473	1615480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_021176	GT	3	6	1615535	1615540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_021176	T	6	6	1615540	1615545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_021176	ATA	2	6	1615609	1615614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_021176	CTG	2	6	1615627	1615632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_021176	GGT	2	6	1615656	1615661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_021176	TTC	2	6	1615676	1615681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_021176	CAG	2	6	1615709	1615714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_021176	CCAG	2	8	1617298	1617305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_021176	CAT	2	6	1617318	1617323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_021176	AAT	2	6	1617358	1617363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021176	ACC	2	6	1617410	1617415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_021176	AC	3	6	1617477	1617482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_021176	TTA	2	6	1617492	1617497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021176	ATA	2	6	1617499	1617504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021176	CAT	2	6	1617612	1617617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_021176	CTT	2	6	1617657	1617662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_021176	ATG	2	6	1617678	1617683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_021176	TCG	2	6	1617736	1617741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_021176	CTG	2	6	1617775	1617780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_021176	GCCA	2	8	1617815	1617822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_021176	TGA	2	6	1617874	1617879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021176	ACG	2	6	1617885	1617890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_021176	TGC	2	6	1620232	1620237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_021176	GCG	2	6	1620293	1620298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_021176	CAG	2	6	1620360	1620365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_021176	TTC	2	6	1620413	1620418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_021176	CGG	3	9	1620422	1620430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021176	ATA	2	6	1620517	1620522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021176	A	8	8	1620600	1620607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021176	CGT	2	6	1620627	1620632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_021176	A	6	6	1620661	1620666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_021176	AACGC	2	10	1620685	1620694	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5605	NC_021176	GA	4	8	1620722	1620729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021176	T	6	6	1620782	1620787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_021176	TC	3	6	1621860	1621865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_021176	A	6	6	1621904	1621909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_021176	GAATA	2	10	1623059	1623068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_021176	TTTTAT	2	12	1623134	1623145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_021176	ATC	2	6	1623237	1623242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_021176	CATC	2	8	1623266	1623273	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_021176	TTA	2	6	1623380	1623385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_021176	TCC	2	6	1624081	1624086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_021176	GA	3	6	1624322	1624327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_021176	CAA	2	6	1624896	1624901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_021176	TCA	2	6	1624935	1624940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_021176	ATT	2	6	1624954	1624959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021176	TCT	2	6	1625820	1625825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_021176	TTCA	2	8	1625880	1625887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5621	NC_021176	CAA	2	6	1627240	1627245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_021176	TCT	2	6	1627339	1627344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_021176	GAT	2	6	1627356	1627361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_021176	AGGA	2	8	1627420	1627427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_021176	GTT	2	6	1628533	1628538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_021176	CCTT	2	8	1628543	1628550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_021176	CA	3	6	1630286	1630291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_021176	GCG	2	6	1630343	1630348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_021176	TAT	2	6	1630905	1630910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_021176	ATA	2	6	1630918	1630923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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