MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus oligofermentans AS 1.3089

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021175	TATAT	2	10	3675	3684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021175	CCTTT	2	10	15733	15742	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021175	TCGTG	2	10	17076	17085	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021175	AGGGA	2	10	20531	20540	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021175	TTAGA	2	10	21392	21401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021175	TTTGA	2	10	29162	29171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021175	GTTTT	2	10	39513	39522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021175	TATTT	2	10	48109	48118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021175	ATAAA	2	10	57939	57948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021175	AAATT	2	10	59067	59076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021175	GCTAG	2	10	66166	66175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021175	TGAGT	2	10	68788	68797	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021175	TAGTT	2	10	91016	91025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021175	TTGAT	2	10	92588	92597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021175	AAGGA	2	10	103604	103613	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021175	AGGAA	2	10	112329	112338	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021175	TCGTG	2	10	115062	115071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_021175	AGGGA	2	10	118518	118527	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021175	CTTTT	2	10	119089	119098	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021175	AATTA	2	10	122722	122731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021175	TAAAG	2	10	126601	126610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021175	AGGAA	2	10	144674	144683	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021175	CTATA	2	10	152632	152641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021175	GTAAA	2	10	152645	152654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021175	TATAT	2	10	155098	155107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021175	TTTTA	2	10	158673	158682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021175	GCTCA	2	10	162914	162923	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_021175	CTTAG	2	10	163060	163069	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021175	TAAAA	2	10	170247	170256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021175	GAAAC	2	10	179655	179664	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021175	AGGAG	2	10	179704	179713	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021175	TGTTT	2	10	183538	183547	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021175	TCTTT	2	10	201734	201743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021175	TATAA	2	10	212770	212779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021175	GGGGC	2	10	213396	213405	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021175	TTTAT	2	10	219924	219933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021175	CTTAT	2	10	221819	221828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021175	GAAAA	2	10	228157	228166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021175	TAAAA	2	10	228806	228815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021175	AGAAA	2	10	229175	229184	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021175	TTGAG	2	10	229225	229234	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021175	TTAAA	2	10	230104	230113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021175	AATTA	2	10	230180	230189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021175	TAATT	2	10	230199	230208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021175	CTTTT	2	10	231899	231908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021175	TAGAA	2	10	263368	263377	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021175	TGAGA	2	10	267810	267819	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021175	TTTTG	2	10	275030	275039	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021175	TCGTC	2	10	275533	275542	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_021175	TTTAG	2	10	277773	277782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021175	GTATT	2	10	281707	281716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021175	TAAAA	2	10	282196	282205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021175	GGCTC	2	10	283499	283508	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021175	GCTAT	2	10	283699	283708	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021175	AGGAA	2	10	289550	289559	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021175	TTTTA	2	10	293405	293414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021175	AAAAT	2	10	295141	295150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021175	TATCA	2	10	296578	296587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021175	GATTT	2	10	296636	296645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021175	CCTTT	2	10	309976	309985	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021175	TCGTG	2	10	311321	311330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021175	AGGGA	2	10	314777	314786	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021175	TTAGA	2	10	315636	315645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021175	TTTTC	2	10	323014	323023	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021175	TTTTG	2	10	328344	328353	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021175	AGTAG	2	10	335254	335263	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021175	ATATA	2	10	355078	355087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021175	TATAG	2	10	356203	356212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021175	AAATG	2	10	356417	356426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021175	ATCCT	2	10	365445	365454	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_021175	TGAAA	2	10	365570	365579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021175	CAAAA	2	10	366846	366855	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021175	TTTAA	2	10	368633	368642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021175	ATTCT	2	10	369177	369186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021175	TATGA	2	10	389741	389750	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021175	TGGAA	2	10	389904	389913	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021175	GCAGA	2	10	390136	390145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021175	CCAAG	2	10	398323	398332	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021175	GGGCT	2	10	407749	407758	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021175	AGGGG	2	10	408848	408857	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021175	TTTAT	2	10	422578	422587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021175	ATCTT	2	10	430270	430279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021175	TTTTA	2	10	433534	433543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021175	TTTTG	2	10	443768	443777	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021175	TAAAA	2	10	455802	455811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021175	AGAAT	2	10	463615	463624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021175	TAAAA	2	10	463721	463730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021175	AGAAA	2	10	463758	463767	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021175	TTTAA	2	10	468853	468862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021175	AAAGG	2	10	495896	495905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021175	ACTAA	2	10	500822	500831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021175	AGAAA	2	10	512413	512422	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021175	TTTTA	2	10	512467	512476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021175	AAAGA	2	10	521100	521109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021175	TAAAA	2	10	545364	545373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021175	TCTAC	2	10	555242	555251	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021175	CTAAG	2	10	571925	571934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021175	AGCAG	2	10	571966	571975	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021175	CCGCA	2	10	572163	572172	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_021175	ACCAA	2	10	604678	604687	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_021175	AAGGC	2	10	604724	604733	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021175	GCTTG	2	10	605678	605687	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021175	GGAGA	2	10	606858	606867	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021175	ATTTT	2	10	620099	620108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021175	ATAGA	2	10	632717	632726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021175	TATTT	2	10	633364	633373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021175	TAAAA	2	10	640687	640696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021175	TTTCA	2	10	646776	646785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021175	CTAGC	2	10	648722	648731	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_021175	TTTTA	2	10	652533	652542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021175	TTTTG	2	10	659824	659833	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021175	TAAAT	2	10	662851	662860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021175	CAATA	2	10	664319	664328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021175	AAAAT	2	10	664439	664448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021175	GAAAG	2	10	667040	667049	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021175	CTTTT	2	10	677120	677129	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021175	CTTTT	2	10	690202	690211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021175	AGCAG	2	10	690220	690229	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021175	TAGAT	2	10	696414	696423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021175	AGTGT	2	10	698190	698199	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021175	ATGTC	2	10	698813	698822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021175	GGAAT	2	10	699093	699102	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021175	TTTAG	2	10	704257	704266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021175	TTACT	2	10	705452	705461	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021175	TTTTA	2	10	708312	708321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021175	AATAA	2	10	712554	712563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021175	TTAAC	2	10	727368	727377	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021175	TTTCC	2	10	728154	728163	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_021175	GGAAA	2	10	734521	734530	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021175	TTCTC	2	10	741490	741499	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021175	TATAA	2	10	758530	758539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021175	AAAAT	2	10	769972	769981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021175	AAAGA	2	10	775063	775072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021175	AAATC	2	10	777173	777182	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021175	AAATA	2	10	783834	783843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021175	ATTAC	2	10	783917	783926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021175	TTTTG	2	10	805444	805453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021175	TAAAA	2	10	805475	805484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021175	GGAAA	2	10	806507	806516	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021175	TTATT	2	10	830522	830531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021175	TAGAA	2	10	830623	830632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021175	TTATA	2	10	831514	831523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021175	CAAGA	2	10	840308	840317	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021175	AGATA	2	10	866365	866374	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021175	CTTTG	2	10	873755	873764	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021175	TTCAT	2	10	873920	873929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021175	TTAAT	2	10	878923	878932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021175	GATTG	2	10	885166	885175	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021175	GTTTT	2	10	885989	885998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021175	ATGAT	2	10	886073	886082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021175	TTTCC	2	10	887097	887106	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_021175	TTTAT	2	10	891462	891471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021175	CTTTC	2	10	892814	892823	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
154	NC_021175	AGCTA	2	10	893110	893119	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_021175	AGATA	2	10	894099	894108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021175	TTTGT	2	10	907772	907781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021175	AGTTT	2	10	914105	914114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021175	TCCTT	2	10	971774	971783	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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168	NC_021175	TAATA	2	10	971879	971888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021175	TTATA	2	10	972535	972544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021175	TTATA	2	10	973199	973208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021175	TTCCT	2	10	973854	973863	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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186	NC_021175	ATTTC	2	10	1049428	1049437	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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290	NC_021175	AAAAT	2	10	1781932	1781941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021175	ATTCA	2	10	1788468	1788477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_021175	CAGAG	2	10	1790079	1790088	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
293	NC_021175	AAAAG	2	10	1794853	1794862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_021175	ACTTT	2	10	2068356	2068365	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_021175	AAGTC	2	10	2072424	2072433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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335	NC_021175	ATTAT	2	10	2081709	2081718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_021175	TTATG	2	10	2091570	2091579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
337	NC_021175	AAAAC	2	10	2095394	2095403	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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339	NC_021175	TTCTA	2	10	2099599	2099608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
340	NC_021175	ATTTT	2	10	2101615	2101624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_021175	CTTTT	2	10	2107153	2107162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
342	NC_021175	TAGTA	2	10	2109304	2109313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
343	NC_021175	CTTAT	2	10	2115807	2115816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
344	NC_021175	GTGCT	2	10	2117468	2117477	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
345	NC_021175	ATAGT	2	10	2136436	2136445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
346	NC_021175	CTTTT	2	10	2138409	2138418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
347	NC_021175	AGTAA	2	10	2138556	2138565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.