MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021151	CAGG	2	8	1418376	1418383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_021151	AAGG	2	8	1421670	1421677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021151	G	6	6	1421676	1421681	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021151	CGC	2	6	1425873	1425878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_021151	GAC	2	6	1425879	1425884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_021151	CTT	2	6	1425905	1425910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_021151	ATT	2	6	1427317	1427322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021151	TCC	3	9	1427364	1427372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_021151	ATG	2	6	1427423	1427428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021151	TCA	2	6	1427436	1427441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021151	CTG	2	6	1427498	1427503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021151	TGCCG	2	10	1427525	1427534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4013	NC_021151	AAT	2	6	1427616	1427621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021151	TCC	2	6	1427641	1427646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_021151	TCCCT	2	10	1427654	1427663	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4016	NC_021151	ATT	2	6	1438703	1438708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021151	ATAACA	2	12	1438712	1438723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4018	NC_021151	AC	3	6	1438770	1438775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_021151	ACG	2	6	1438814	1438819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_021151	ATT	2	6	1438840	1438845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021151	AGT	2	6	1438879	1438884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021151	T	6	6	1438884	1438889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021151	ACATAA	2	12	1438930	1438941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4024	NC_021151	GGT	2	6	1443010	1443015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021151	GCCC	2	8	1443044	1443051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4026	NC_021151	CTC	2	6	1443066	1443071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_021151	GCC	2	6	1443074	1443079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_021151	TCA	2	6	1443080	1443085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021151	TCA	2	6	1443106	1443111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_021151	T	6	6	1444500	1444505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021151	TAT	2	6	1444559	1444564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021151	ACC	2	6	1444611	1444616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_021151	T	6	6	1444652	1444657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021151	A	6	6	1444671	1444676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021151	GCCA	2	8	1444762	1444769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_021151	TCC	2	6	1444781	1444786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_021151	ACT	2	6	1444856	1444861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021151	TTA	2	6	1444892	1444897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021151	AAT	2	6	1444972	1444977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021151	TCA	2	6	1445051	1445056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_021151	GATT	2	8	1445077	1445084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021151	TA	3	6	1446465	1446470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021151	TCG	2	6	1446512	1446517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_021151	CAT	2	6	1446620	1446625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021151	C	6	6	1446633	1446638	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4046	NC_021151	GTA	2	6	1446672	1446677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021151	CAC	2	6	1446685	1446690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_021151	AGG	2	6	1446845	1446850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021151	TGTTTA	2	12	1446916	1446927	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021151	CAT	2	6	1446981	1446986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_021151	AT	3	6	1447005	1447010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021151	TAA	2	6	1447097	1447102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021151	TC	3	6	1447276	1447281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_021151	CAG	2	6	1447326	1447331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_021151	GAA	2	6	1447332	1447337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021151	TTG	2	6	1447425	1447430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021151	TTC	2	6	1448393	1448398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_021151	GACC	2	8	1449544	1449551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_021151	T	6	6	1449573	1449578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_021151	CTG	2	6	1449588	1449593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_021151	TAT	2	6	1449658	1449663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_021151	TACCT	2	10	1449684	1449693	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4063	NC_021151	GAC	2	6	1453678	1453683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_021151	GAA	2	6	1455307	1455312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021151	GGT	2	6	1455361	1455366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021151	AAG	2	6	1455390	1455395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021151	GTC	2	6	1455406	1455411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_021151	CTGT	2	8	1455452	1455459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_021151	GCG	2	6	1455485	1455490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_021151	TGC	2	6	1455563	1455568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021151	ACG	2	6	1455569	1455574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021151	CCA	2	6	1455637	1455642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_021151	AC	3	6	1455654	1455659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_021151	T	6	6	1456055	1456060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021151	T	6	6	1456097	1456102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021151	TTA	2	6	1456204	1456209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021151	TTCA	2	8	1456227	1456234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_021151	AT	3	6	1456246	1456251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021151	A	6	6	1460503	1460508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_021151	CGA	2	6	1460513	1460518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_021151	CGC	2	6	1460520	1460525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_021151	TTA	2	6	1461108	1461113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021151	TTG	2	6	1461171	1461176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021151	CAA	2	6	1461210	1461215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_021151	ATT	2	6	1461232	1461237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021151	TTA	2	6	1461246	1461251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021151	ACA	2	6	1461284	1461289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_021151	A	6	6	1461293	1461298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021151	TAA	2	6	1461338	1461343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021151	TGA	2	6	1461678	1461683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021151	A	6	6	1461719	1461724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021151	AAT	2	6	1461755	1461760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021151	ATT	2	6	1461771	1461776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021151	CTGT	2	8	1461789	1461796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_021151	TAT	2	6	1461824	1461829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021151	TTA	2	6	1461831	1461836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021151	AT	4	8	1461854	1461861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021151	AGG	2	6	1461899	1461904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021151	ATT	2	6	1463080	1463085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021151	T	6	6	1463150	1463155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021151	ACA	2	6	1463156	1463161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_021151	GAA	2	6	1463162	1463167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021151	CAA	2	6	1465215	1465220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_021151	T	6	6	1465239	1465244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021151	TAA	2	6	1465300	1465305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021151	TC	3	6	1465365	1465370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_021151	AATT	2	8	1465397	1465404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021151	ATT	2	6	1465412	1465417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021151	TA	3	6	1465434	1465439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021151	GGCA	2	8	1465915	1465922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_021151	GCT	2	6	1465959	1465964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021151	TCTTT	2	10	1465974	1465983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4113	NC_021151	A	6	6	1465994	1465999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021151	TAA	2	6	1466617	1466622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021151	ACAT	2	8	1469620	1469627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_021151	CTTT	2	8	1469641	1469648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_021151	CGC	2	6	1469694	1469699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_021151	A	6	6	1469732	1469737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021151	TTA	2	6	1470578	1470583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021151	A	6	6	1474477	1474482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021151	GGCA	2	8	1474538	1474545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_021151	G	6	6	1474552	1474557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021151	GCT	2	6	1474585	1474590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_021151	TC	3	6	1476918	1476923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_021151	TTTATC	2	12	1476924	1476935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4126	NC_021151	CGA	2	6	1476937	1476942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_021151	GAG	2	6	1476993	1476998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021151	GGC	2	6	1477068	1477073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021151	ACC	2	6	1477082	1477087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_021151	CAC	2	6	1477160	1477165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_021151	CGG	2	6	1478933	1478938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_021151	TGCC	2	8	1478944	1478951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_021151	GCG	2	6	1478958	1478963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_021151	CG	3	6	1479938	1479943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_021151	CAT	2	6	1479992	1479997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_021151	AG	3	6	1483735	1483740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_021151	T	6	6	1483760	1483765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_021151	CAT	2	6	1483783	1483788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4155	NC_021151	A	7	7	1485119	1485125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_021151	TCA	2	6	1491345	1491350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4166	NC_021151	CGG	2	6	1493595	1493600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4202	NC_021151	A	6	6	1512230	1512235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4203	NC_021151	AGA	2	6	1512256	1512261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4246	NC_021151	A	6	6	1526878	1526883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_021151	TCGC	2	8	1526894	1526901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4248	NC_021151	CAA	2	6	1526910	1526915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_021151	ATT	2	6	1526952	1526957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_021151	TCA	2	6	1527036	1527041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_021151	ACAA	2	8	1527091	1527098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4252	NC_021151	TCA	2	6	1527676	1527681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_021151	TGA	2	6	1527705	1527710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_021151	GAC	2	6	1527711	1527716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4258	NC_021151	ACA	2	6	1527807	1527812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_021151	TTA	2	6	1529598	1529603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_021151	TTAC	2	8	1535568	1535575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_021151	CAT	2	6	1535589	1535594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_021151	TC	3	6	1535630	1535635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4263	NC_021151	GCG	2	6	1535691	1535696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_021151	ATG	2	6	1535745	1535750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4285	NC_021151	CAT	2	6	1540799	1540804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4294	NC_021151	AAT	2	6	1544345	1544350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4333	NC_021151	ATC	2	6	1556916	1556921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4384	NC_021151	TA	3	6	1573303	1573308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4385	NC_021151	TA	3	6	1573367	1573372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_021151	TAA	2	6	1573390	1573395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_021151	ATA	2	6	1573428	1573433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_021151	TGT	2	6	1573448	1573453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4391	NC_021151	A	6	6	1574099	1574104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4393	NC_021151	ATA	2	6	1575864	1575869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_021151	TAAC	2	8	1575883	1575890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4402	NC_021151	AAT	2	6	1580124	1580129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4464	NC_021151	TGG	2	6	1616016	1616021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4480	NC_021151	TACAG	2	10	1635102	1635111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4483	NC_021151	AT	3	6	1637169	1637174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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