MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021151	GCT	2	6	1215675	1215680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_021151	A	7	7	1215702	1215708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021151	AGCA	2	8	1215741	1215748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_021151	ATG	2	6	1215763	1215768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021151	CTT	2	6	1217128	1217133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021151	CAAC	2	8	1217171	1217178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_021151	TTTGA	2	10	1217180	1217189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021151	ATT	2	6	1217217	1217222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021151	CGCGC	2	10	1217243	1217252	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3510	NC_021151	GC	4	8	1217249	1217256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_021151	CGT	2	6	1219093	1219098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021151	CAT	2	6	1219102	1219107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021151	AG	3	6	1219196	1219201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021151	GGC	2	6	1219249	1219254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021151	CAGGTA	2	12	1219263	1219274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3516	NC_021151	TGC	2	6	1222371	1222376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021151	CCG	2	6	1222388	1222393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_021151	AAGCT	2	10	1222417	1222426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3519	NC_021151	ACCT	2	8	1222493	1222500	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_021151	TATT	2	8	1222525	1222532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021151	AG	3	6	1222538	1222543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021151	AAAG	2	8	1222562	1222569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021151	GCA	2	6	1226191	1226196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021151	AG	3	6	1226216	1226221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021151	ATG	2	6	1226223	1226228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021151	A	6	6	1226266	1226271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021151	CCGG	2	8	1226327	1226334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_021151	AGCGC	2	10	1226357	1226366	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3529	NC_021151	A	6	6	1226376	1226381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021151	TAC	2	6	1227433	1227438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021151	CTT	2	6	1229364	1229369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021151	GC	3	6	1229392	1229397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_021151	T	6	6	1229431	1229436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021151	CGG	2	6	1229469	1229474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021151	ACTTT	2	10	1231226	1231235	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3536	NC_021151	GAC	2	6	1231264	1231269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021151	GCG	2	6	1231291	1231296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021151	ATT	2	6	1231914	1231919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021151	CTCA	2	8	1231925	1231932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_021151	GGC	2	6	1231937	1231942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021151	GTT	2	6	1231957	1231962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021151	CAA	2	6	1231993	1231998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021151	CAT	2	6	1235772	1235777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021151	AAGGC	2	10	1235826	1235835	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3545	NC_021151	A	8	8	1235836	1235843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021151	GCT	2	6	1235863	1235868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021151	AAG	2	6	1236895	1236900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021151	AGC	2	6	1236919	1236924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_021151	TAAT	2	8	1237160	1237167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021151	CTG	2	6	1237197	1237202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021151	T	6	6	1237229	1237234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021151	TC	3	6	1237238	1237243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_021151	ATA	2	6	1237262	1237267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021151	TAT	2	6	1237278	1237283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021151	TTTTA	2	10	1237301	1237310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021151	TTA	2	6	1237343	1237348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021151	GTG	2	6	1237448	1237453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021151	AAT	2	6	1237491	1237496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021151	ATTA	2	8	1237502	1237509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021151	TAAAGC	2	12	1237566	1237577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3561	NC_021151	CGC	2	6	1238042	1238047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_021151	TCC	2	6	1240265	1240270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_021151	ATC	2	6	1240273	1240278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_021151	GCT	2	6	1240332	1240337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021151	TCA	2	6	1240417	1240422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021151	CGCTT	2	10	1240430	1240439	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3567	NC_021151	TGT	2	6	1240465	1240470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021151	CCA	2	6	1240566	1240571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_021151	GCC	2	6	1240591	1240596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_021151	C	7	7	1240607	1240613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3571	NC_021151	AC	3	6	1240618	1240623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_021151	T	6	6	1240677	1240682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021151	AGA	2	6	1240714	1240719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021151	TCAT	2	8	1240741	1240748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_021151	TCA	2	6	1240808	1240813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_021151	CAGC	2	8	1240853	1240860	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_021151	GACT	2	8	1241603	1241610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_021151	TTTAT	2	10	1241615	1241624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021151	TA	3	6	1241689	1241694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021151	CGAT	2	8	1241840	1241847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_021151	TTC	2	6	1241889	1241894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_021151	TATT	2	8	1241904	1241911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021151	TTA	2	6	1242533	1242538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021151	AGC	2	6	1242556	1242561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021151	GGT	2	6	1242599	1242604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021151	TAT	2	6	1242622	1242627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021151	CAT	2	6	1242633	1242638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_021151	TGTCT	2	10	1242665	1242674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3589	NC_021151	AC	3	6	1243391	1243396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_021151	TAA	2	6	1243406	1243411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021151	CA	3	6	1243441	1243446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_021151	GGC	2	6	1243910	1243915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021151	GGA	2	6	1243943	1243948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021151	TAA	2	6	1244048	1244053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021151	ATA	2	6	1244081	1244086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021151	CCT	2	6	1244936	1244941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_021151	CGG	2	6	1245002	1245007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_021151	GTA	2	6	1245146	1245151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021151	ATC	2	6	1246415	1246420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021151	TGA	2	6	1247125	1247130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021151	T	7	7	1247173	1247179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021151	GCAG	2	8	1247180	1247187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_021151	GAG	2	6	1247226	1247231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021151	AGG	2	6	1247255	1247260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021151	CA	3	6	1247298	1247303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_021151	GA	3	6	1247309	1247314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021151	TAT	2	6	1247329	1247334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021151	CCAG	2	8	1247681	1247688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_021151	CAA	2	6	1247696	1247701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_021151	TG	3	6	1247717	1247722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021151	T	6	6	1247794	1247799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021151	CT	3	6	1247821	1247826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_021151	ATA	2	6	1249346	1249351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021151	TTA	2	6	1249409	1249414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021151	ATG	2	6	1249443	1249448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021151	ATG	2	6	1249465	1249470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021151	TTAA	2	8	1249493	1249500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021151	TA	3	6	1249527	1249532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021151	TGT	2	6	1249962	1249967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021151	T	6	6	1249993	1249998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021151	A	7	7	1250055	1250061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021151	GGT	2	6	1250071	1250076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021151	ATT	2	6	1250101	1250106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021151	CCA	2	6	1250194	1250199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_021151	T	7	7	1250295	1250301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021151	CAGC	2	8	1250309	1250316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_021151	TGC	2	6	1250472	1250477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_021151	TCAC	2	8	1250533	1250540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_021151	GCG	2	6	1250559	1250564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_021151	TGT	2	6	1251137	1251142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021151	A	7	7	1253744	1253750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021151	TGT	2	6	1253789	1253794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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