MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021151	TCCT	2	8	1068084	1068091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_021151	CCA	3	9	1068092	1068100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_021151	TGG	2	6	1068134	1068139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021151	CAC	2	6	1068212	1068217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_021151	TC	3	6	1068266	1068271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_021151	TTCGA	2	10	1068304	1068313	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3007	NC_021151	GC	3	6	1068359	1068364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_021151	CAC	2	6	1068386	1068391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_021151	TCAA	2	8	1068412	1068419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_021151	CCG	2	6	1070217	1070222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_021151	GA	3	6	1070242	1070247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021151	TG	3	6	1076922	1076927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021151	CT	3	6	1076939	1076944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_021151	GC	3	6	1077036	1077041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_021151	CCT	2	6	1077045	1077050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_021151	GAG	3	9	1077065	1077073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021151	TA	4	8	1077081	1077088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021151	AAATT	2	10	1077108	1077117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021151	CAA	2	6	1077144	1077149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_021151	TC	3	6	1077213	1077218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_021151	TGT	2	6	1077235	1077240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021151	A	8	8	1077255	1077262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021151	CGC	2	6	1077274	1077279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_021151	TTGAT	2	10	1078711	1078720	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021151	GTC	2	6	1078776	1078781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_021151	TTA	2	6	1078803	1078808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021151	A	6	6	1078834	1078839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021151	TGTC	2	8	1078862	1078869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_021151	CT	3	6	1078892	1078897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_021151	T	6	6	1078987	1078992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021151	T	6	6	1078999	1079004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021151	GAA	2	6	1079020	1079025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021151	ACA	2	6	1082875	1082880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021151	T	6	6	1082968	1082973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021151	TTA	2	6	1083788	1083793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021151	GAG	2	6	1083802	1083807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021151	GAAA	2	8	1083884	1083891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021151	A	7	7	1083889	1083895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021151	A	6	6	1083919	1083924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_021151	A	7	7	1083930	1083936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021151	CTT	2	6	1083959	1083964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021151	A	6	6	1085111	1085116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021151	A	6	6	1089187	1089192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021151	GTGTG	2	10	1089193	1089202	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021151	AGT	2	6	1090474	1090479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021151	CAT	2	6	1090508	1090513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_021151	AG	4	8	1090537	1090544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021151	TGA	2	6	1090580	1090585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021151	GGC	2	6	1090619	1090624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_021151	ATT	2	6	1090743	1090748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021151	TCA	2	6	1090770	1090775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_021151	AT	3	6	1092295	1092300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021151	TGAA	2	8	1092348	1092355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021151	CCA	2	6	1092483	1092488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_021151	TTC	2	6	1092507	1092512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_021151	GCG	2	6	1093487	1093492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_021151	T	7	7	1093495	1093501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_021151	CCT	2	6	1093531	1093536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_021151	GAT	2	6	1093558	1093563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021151	ATT	2	6	1093581	1093586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021151	GTT	2	6	1095618	1095623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021151	ACA	2	6	1095662	1095667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_021151	AC	3	6	1095733	1095738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_021151	TAA	2	6	1095756	1095761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021151	ATT	2	6	1095774	1095779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_021151	CAGA	2	8	1095819	1095826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_021151	A	6	6	1095864	1095869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021151	ATA	2	6	1096491	1096496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021151	ATT	2	6	1096543	1096548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021151	TGT	2	6	1097672	1097677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021151	AAAG	2	8	1097710	1097717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021151	T	6	6	1097744	1097749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021151	ATA	2	6	1097755	1097760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_021151	TTCTT	2	10	1097810	1097819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3075	NC_021151	T	6	6	1099113	1099118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021151	TA	3	6	1099148	1099153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021151	ATC	2	6	1099157	1099162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_021151	TCC	2	6	1099196	1099201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_021151	C	6	6	1099200	1099205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3081	NC_021151	CA	3	6	1099372	1099377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_021151	T	6	6	1099412	1099417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021151	ATT	2	6	1099421	1099426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021151	CG	3	6	1099475	1099480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_021151	GTG	2	6	1099552	1099557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021151	A	6	6	1099568	1099573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021151	CT	3	6	1105121	1105126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_021151	CCG	2	6	1108016	1108021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_021151	GAC	2	6	1108026	1108031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_021151	AATT	2	8	1108129	1108136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021151	AT	3	6	1108149	1108154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021151	CTGC	2	8	1108212	1108219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_021151	A	6	6	1108245	1108250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_021151	CTA	2	6	1108280	1108285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_021151	T	6	6	1109652	1109657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021151	CG	4	8	1109679	1109686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_021151	TGTT	2	8	1109715	1109722	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021151	TTGGCT	2	12	1109791	1109802	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3099	NC_021151	TAG	2	6	1111547	1111552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021151	ATTT	2	8	1111945	1111952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021151	TTCT	2	8	1111965	1111972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_021151	AT	3	6	1113501	1113506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021151	TTA	2	6	1114508	1114513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021151	TGTTAA	2	12	1114514	1114525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021151	ATA	2	6	1114526	1114531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021151	TCT	2	6	1118770	1118775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_021151	ATT	2	6	1118805	1118810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021151	T	6	6	1118822	1118827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021151	ATG	2	6	1118916	1118921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021151	T	6	6	1118933	1118938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021151	GGA	2	6	1118951	1118956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021151	T	6	6	1118989	1118994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021151	AGG	2	6	1119017	1119022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021151	AG	3	6	1119033	1119038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021151	CAA	2	6	1119045	1119050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_021151	TGC	2	6	1120603	1120608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021151	TCA	2	6	1121400	1121405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_021151	GAA	2	6	1121442	1121447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021151	CTTG	2	8	1121499	1121506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_021151	TCG	2	6	1121510	1121515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_021151	CGCT	2	8	1121516	1121523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_021151	CT	3	6	1121525	1121530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_021151	ATT	2	6	1123188	1123193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021151	GAATT	2	10	1123216	1123225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021151	ATT	2	6	1123262	1123267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021151	AC	3	6	1123800	1123805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_021151	T	8	8	1123821	1123828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021151	GTT	2	6	1123838	1123843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021151	CAC	2	6	1123885	1123890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_021151	CAC	2	6	1124264	1124269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_021151	GCG	2	6	1124273	1124278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_021151	TCC	2	6	1124499	1124504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_021151	GTC	2	6	1124541	1124546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021151	CTA	2	6	1124556	1124561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_021151	A	6	6	1124573	1124578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_021151	AGA	2	6	1124621	1124626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_021151	A	6	6	1124630	1124635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_021151	GGTT	2	8	1124663	1124670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_021151	TTA	2	6	1124844	1124849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_021151	CTC	2	6	1124972	1124977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3142	NC_021151	GAA	2	6	1125058	1125063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_021151	GCC	2	6	1125121	1125126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_021151	CCG	2	6	1125687	1125692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3145	NC_021151	GGC	2	6	1125698	1125703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_021151	ATG	2	6	1126389	1126394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3148	NC_021151	ATA	2	6	1126756	1126761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_021151	GAT	2	6	1126810	1126815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_021151	A	6	6	1128682	1128687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_021151	AGA	2	6	1128691	1128696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_021151	T	6	6	1128704	1128709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_021151	T	7	7	1128711	1128717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_021151	ATT	2	6	1128720	1128725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_021151	ATTT	2	8	1128738	1128745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_021151	A	8	8	1129928	1129935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_021151	TC	3	6	1129953	1129958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3158	NC_021151	TCG	2	6	1131685	1131690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3162	NC_021151	TATT	2	8	1131789	1131796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_021151	TAT	2	6	1131799	1131804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_021151	G	6	6	1132498	1132503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_021151	TAG	2	6	1132507	1132512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3167	NC_021151	CGG	2	6	1135251	1135256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_021151	ATT	2	6	1135872	1135877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_021151	CGG	2	6	1135888	1135893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3172	NC_021151	CG	3	6	1137964	1137969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3173	NC_021151	TAT	2	6	1138126	1138131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_021151	CCCT	2	8	1139508	1139515	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3175	NC_021151	TCG	2	6	1139557	1139562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3179	NC_021151	CA	3	6	1143138	1143143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3183	NC_021151	AAT	2	6	1143270	1143275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3204	NC_021151	CTG	2	6	1150858	1150863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3212	NC_021151	GTA	2	6	1151231	1151236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3214	NC_021151	CAC	2	6	1151608	1151613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3216	NC_021151	TCAA	2	8	1151924	1151931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3217	NC_021151	CTAA	2	8	1151951	1151958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3218	NC_021151	AAAAG	2	10	1151959	1151968	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3221	NC_021151	AAT	2	6	1152252	1152257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_021151	TGT	2	6	1152272	1152277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3225	NC_021151	TAA	2	6	1152416	1152421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3232	NC_021151	T	6	6	1155870	1155875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_021151	GGCCT	2	10	1157943	1157952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3248	NC_021151	ATT	2	6	1166615	1166620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_021151	GAC	2	6	1166667	1166672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_021151	AT	3	6	1166703	1166708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_021151	GTATT	2	10	1166750	1166759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_021151	TAC	2	6	1166760	1166765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_021151	A	6	6	1167550	1167555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_021151	ATTTT	2	10	1167600	1167609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_021151	TTC	2	6	1167624	1167629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_021151	T	8	8	1167644	1167651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_021151	TTCAA	2	10	1167722	1167731	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3258	NC_021151	ATT	3	9	1167761	1167769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_021151	TGT	2	6	1167778	1167783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_021151	GGCT	2	8	1167806	1167813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3261	NC_021151	CGCCA	2	10	1167863	1167872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3262	NC_021151	AATT	2	8	1167908	1167915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_021151	TA	3	6	1167926	1167931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_021151	AAATG	2	10	1167964	1167973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_021151	A	7	7	1167997	1168003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3267	NC_021151	ATT	3	9	1168077	1168085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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