MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021151	GAGT	2	8	906210	906217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021151	AGT	2	6	906289	906294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_021151	GTT	2	6	906298	906303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_021151	TA	3	6	906352	906357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021151	CTG	2	6	906473	906478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_021151	ATT	2	6	906488	906493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021151	GCG	2	6	906514	906519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_021151	CCT	2	6	906927	906932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_021151	ACA	2	6	906989	906994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_021151	TTG	2	6	907084	907089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_021151	TAA	2	6	907096	907101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_021151	CTT	2	6	907116	907121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_021151	ATA	2	6	907169	907174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_021151	TAAT	2	8	907182	907189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_021151	ATG	3	9	907205	907213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_021151	AGG	2	6	907271	907276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_021151	AAT	2	6	907320	907325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021151	ATA	2	6	907393	907398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_021151	ACC	2	6	907407	907412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_021151	AT	3	6	908477	908482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_021151	AAT	2	6	908493	908498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_021151	AGTATA	2	12	908549	908560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021151	AAT	2	6	908620	908625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021151	ATT	2	6	908637	908642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021151	CAT	2	6	908645	908650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_021151	ACG	2	6	908657	908662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_021151	GGC	2	6	910907	910912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_021151	C	6	6	911495	911500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2529	NC_021151	TGAC	2	8	911550	911557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_021151	TGG	2	6	912761	912766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_021151	ATG	2	6	913507	913512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021151	ATA	2	6	913521	913526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021151	A	7	7	913595	913601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_021151	GTT	2	6	915284	915289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021151	CTT	2	6	916867	916872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_021151	GTT	2	6	916874	916879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021151	ATT	2	6	916956	916961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_021151	T	6	6	916960	916965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_021151	CAC	2	6	917058	917063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_021151	AG	3	6	920646	920651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_021151	AGGA	2	8	924973	924980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_021151	CAG	2	6	925023	925028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_021151	T	6	6	926804	926809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021151	CAG	2	6	926810	926815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_021151	TAA	2	6	926861	926866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_021151	TTG	2	6	926872	926877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_021151	ACCG	2	8	926925	926932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2548	NC_021151	GCA	2	6	926952	926957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_021151	TTC	2	6	926958	926963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_021151	CCTT	2	8	928491	928498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_021151	GAA	2	6	929938	929943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_021151	ATC	2	6	930047	930052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_021151	TAAAA	2	10	930055	930064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_021151	TAA	2	6	930092	930097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_021151	ACAA	2	8	930122	930129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2556	NC_021151	CT	3	6	932790	932795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2557	NC_021151	CATT	2	8	932894	932901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_021151	G	6	6	934394	934399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_021151	TTTATG	2	12	934414	934425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_021151	CTTT	2	8	934559	934566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_021151	TTTA	2	8	934658	934665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021151	GGT	2	6	934673	934678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021151	CCG	2	6	934745	934750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2564	NC_021151	A	6	6	934806	934811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_021151	TCA	2	6	934854	934859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_021151	AATC	2	8	934875	934882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2567	NC_021151	TAA	2	6	934888	934893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_021151	TGT	2	6	934932	934937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_021151	AGTC	2	8	934969	934976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_021151	ATC	2	6	934977	934982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_021151	AATC	2	8	934991	934998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2572	NC_021151	ATAA	2	8	935128	935135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_021151	AAT	2	6	936220	936225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_021151	GAT	2	6	936231	936236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_021151	CTT	2	6	936306	936311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_021151	T	6	6	936310	936315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_021151	AAT	2	6	936345	936350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_021151	ATA	2	6	936363	936368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_021151	GTT	2	6	936390	936395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_021151	GAT	2	6	936396	936401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_021151	AT	3	6	936400	936405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_021151	TGTA	2	8	936432	936439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_021151	CGA	2	6	936449	936454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_021151	AAG	2	6	936465	936470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_021151	TAAT	2	8	936522	936529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_021151	TAA	2	6	936548	936553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_021151	AGG	2	6	936558	936563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_021151	ATG	2	6	937865	937870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_021151	TGC	2	6	937878	937883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_021151	AAT	2	6	938277	938282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_021151	T	7	7	938335	938341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_021151	ACC	2	6	938449	938454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2593	NC_021151	GAA	2	6	938480	938485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_021151	TGTT	2	8	938499	938506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_021151	TTA	2	6	938534	938539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_021151	TATTTA	2	12	938544	938555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_021151	CAA	2	6	938595	938600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_021151	TA	3	6	938604	938609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_021151	ATC	2	6	938634	938639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_021151	AAC	2	6	938671	938676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_021151	TGT	2	6	938696	938701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_021151	AAT	2	6	938719	938724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_021151	ATAG	2	8	938741	938748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021151	A	6	6	938769	938774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021151	GAT	2	6	938828	938833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_021151	TGA	2	6	939022	939027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_021151	CCT	2	6	939039	939044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_021151	TAC	2	6	939147	939152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_021151	ATAG	2	8	939158	939165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_021151	CAC	2	6	942042	942047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_021151	TTATTT	2	12	942062	942073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021151	ATT	2	6	942099	942104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_021151	AGGT	2	8	943808	943815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_021151	TAAA	2	8	943821	943828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_021151	AAT	2	6	943872	943877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_021151	AATA	2	8	943893	943900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_021151	TTC	2	6	943904	943909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_021151	TTA	2	6	943928	943933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_021151	ATT	2	6	943963	943968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_021151	TAA	2	6	943982	943987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_021151	TAT	3	9	944014	944022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_021151	ATA	2	6	944055	944060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_021151	TCG	2	6	944071	944076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_021151	ACTC	2	8	944086	944093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_021151	GTT	2	6	944125	944130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_021151	ATT	2	6	944147	944152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_021151	GA	3	6	944157	944162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_021151	TTATT	2	10	944913	944922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_021151	TCC	2	6	944966	944971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_021151	TGAA	2	8	945639	945646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_021151	ACA	2	6	945659	945664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_021151	TCA	2	6	945686	945691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_021151	TGG	2	6	945703	945708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2635	NC_021151	CGT	2	6	946593	946598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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