MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021151	GGTTTA	2	12	554061	554072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021151	AGG	2	6	554078	554083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021151	CTT	2	6	554099	554104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021151	TAA	2	6	554121	554126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021151	TTAA	2	8	554201	554208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021151	ATG	2	6	554297	554302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021151	TTCTG	2	10	554324	554333	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_021151	T	6	6	554340	554345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021151	AGG	2	6	554377	554382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021151	CTC	2	6	560562	560567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_021151	TAA	2	6	560569	560574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021151	TTC	2	6	560920	560925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_021151	A	6	6	561011	561016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021151	AAAT	2	8	561051	561058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021151	TATAA	2	10	561066	561075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021151	ATC	2	6	561078	561083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021151	AAGA	2	8	561089	561096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021151	T	7	7	561801	561807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021151	CAAT	2	8	561831	561838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_021151	A	6	6	561841	561846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021151	ACT	3	9	562702	562710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021151	GAT	2	6	562739	562744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021151	TTG	2	6	562788	562793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021151	CAT	3	9	563441	563449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_021151	ATT	2	6	564322	564327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021151	GAG	2	6	564339	564344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021151	CCCT	2	8	564350	564357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1528	NC_021151	CCAT	2	8	564413	564420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_021151	ACTC	2	8	564518	564525	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_021151	GCC	2	6	564530	564535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_021151	ATT	2	6	564550	564555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021151	TA	3	6	564561	564566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021151	GA	3	6	564863	564868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021151	TAA	2	6	565057	565062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021151	TAA	2	6	565079	565084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021151	AGG	2	6	565113	565118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021151	GAG	2	6	565680	565685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021151	GA	3	6	565778	565783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021151	CGT	2	6	566518	566523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_021151	CGG	2	6	566527	566532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_021151	GTA	2	6	567234	567239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021151	T	6	6	567259	567264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021151	CG	3	6	567281	567286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_021151	TTTA	2	8	567327	567334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021151	AGA	2	6	567439	567444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021151	A	6	6	568106	568111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021151	GATA	2	8	568131	568138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021151	A	7	7	568148	568154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021151	ATA	2	6	568179	568184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021151	ACG	2	6	568306	568311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021151	ATA	2	6	568678	568683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021151	TAT	2	6	568705	568710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021151	ACC	2	6	568724	568729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_021151	GTT	2	6	568783	568788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021151	CGGCG	2	10	568808	568817	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1556	NC_021151	A	6	6	568829	568834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021151	ATA	2	6	568846	568851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021151	GAC	2	6	568868	568873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_021151	GGTT	2	8	568956	568963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021151	GCG	2	6	569398	569403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021151	CCT	2	6	570063	570068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_021151	TCA	2	6	570144	570149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021151	AGGCG	2	10	571378	571387	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_021151	ACT	2	6	572711	572716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_021151	CGC	2	6	572832	572837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_021151	TTG	2	6	572862	572867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021151	TAA	2	6	575171	575176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021151	AAT	2	6	575181	575186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021151	AT	3	6	575185	575190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021151	TTAA	2	8	575237	575244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021151	AAAAT	2	10	575267	575276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021151	TAT	2	6	575283	575288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021151	ATA	2	6	575317	575322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021151	CAA	2	6	575368	575373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_021151	GCTG	2	8	575390	575397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_021151	CGT	2	6	575407	575412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_021151	GATTTT	2	12	575448	575459	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021151	T	6	6	575473	575478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021151	CCT	2	6	575517	575522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_021151	TAA	2	6	575541	575546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021151	TAT	2	6	575618	575623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021151	GTA	2	6	575628	575633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021151	C	6	6	576983	576988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1584	NC_021151	AAGCGC	2	12	577075	577086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_021151	T	6	6	579054	579059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021151	TAG	2	6	579088	579093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021151	A	8	8	579136	579143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021151	AGA	2	6	579170	579175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021151	CTT	2	6	579197	579202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_021151	TCA	2	6	579275	579280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_021151	TGG	2	6	579293	579298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021151	ATC	2	6	579331	579336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_021151	ATC	2	6	579342	579347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021151	AAT	2	6	579352	579357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021151	A	6	6	580358	580363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021151	TAA	2	6	580417	580422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021151	TTG	2	6	580423	580428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021151	GCTG	2	8	580433	580440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_021151	TTC	2	6	580477	580482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_021151	ATG	2	6	581721	581726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021151	GCC	2	6	582671	582676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_021151	GGC	2	6	582698	582703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021151	AC	3	6	583875	583880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_021151	A	8	8	583916	583923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021151	CCA	2	6	584968	584973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_021151	AATC	2	8	585060	585067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_021151	GCC	2	6	585134	585139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_021151	ATA	2	6	585163	585168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021151	GCC	2	6	585194	585199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_021151	ATT	2	6	585734	585739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021151	GCC	2	6	586058	586063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_021151	CGG	2	6	586067	586072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021151	ATT	2	6	586192	586197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021151	GCCA	2	8	586228	586235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_021151	TGACG	2	10	586307	586316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1616	NC_021151	GATAC	2	10	586371	586380	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1617	NC_021151	CAGC	2	8	586978	586985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_021151	GC	3	6	586984	586989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_021151	TAA	2	6	587024	587029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021151	TCT	2	6	587047	587052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_021151	GTC	2	6	587057	587062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021151	GGC	2	6	588135	588140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_021151	CGC	2	6	588151	588156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_021151	TGA	2	6	588173	588178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021151	AAC	2	6	590059	590064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021151	CAG	2	6	590130	590135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_021151	CTGC	2	8	590142	590149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_021151	AATA	2	8	590185	590192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021151	GAC	2	6	593899	593904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_021151	TA	3	6	595269	595274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021151	A	7	7	595357	595363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021151	GCT	2	6	595368	595373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_021151	CGG	2	6	595440	595445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021151	AAT	2	6	597237	597242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021151	GCTG	2	8	597372	597379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_021151	TGC	2	6	597387	597392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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