MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021151	CCT	2	6	396109	396114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_021151	TC	3	6	396133	396138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021151	CT	3	6	396172	396177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_021151	ATA	2	6	396186	396191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021151	ATT	2	6	396192	396197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021151	CAA	2	6	399995	400000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021151	AT	3	6	400049	400054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021151	CGC	2	6	400580	400585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_021151	GCG	2	6	400588	400593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021151	TAC	2	6	400629	400634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021151	GC	3	6	400653	400658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_021151	TGG	2	6	400693	400698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021151	CGC	2	6	400723	400728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_021151	CGG	2	6	400751	400756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021151	GGT	2	6	400797	400802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021151	ATGA	2	8	400819	400826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021151	CCT	2	6	401352	401357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_021151	TAA	2	6	402961	402966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021151	TGT	2	6	402980	402985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021151	CGG	2	6	403034	403039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021151	GAA	3	9	403060	403068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021151	CGG	2	6	403120	403125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021151	ATT	2	6	403605	403610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021151	AAT	2	6	403619	403624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021151	TTTA	2	8	403688	403695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021151	ATGT	2	8	403706	403713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021151	TAA	3	9	403717	403725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021151	ATCAC	2	10	403745	403754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_021151	TACTT	2	10	403758	403767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_021151	AT	3	6	403810	403815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021151	GAG	2	6	403846	403851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021151	GCGCT	2	10	407874	407883	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1033	NC_021151	A	7	7	407896	407902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021151	CAG	2	6	407965	407970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021151	A	6	6	408803	408808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021151	AGCGC	2	10	409616	409625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1037	NC_021151	GTA	2	6	409638	409643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021151	ATG	2	6	412941	412946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021151	ATT	2	6	413002	413007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021151	T	6	6	413006	413011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021151	ACT	2	6	413018	413023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021151	GAT	2	6	413052	413057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021151	CTC	2	6	413167	413172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_021151	A	6	6	413205	413210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021151	AGT	2	6	413287	413292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021151	T	6	6	413785	413790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021151	T	6	6	413814	413819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021151	TTAT	2	8	413826	413833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021151	GTG	2	6	413883	413888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021151	ATT	2	6	413924	413929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021151	TGT	2	6	413944	413949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021151	TTAT	2	8	413955	413962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021151	AG	3	6	414033	414038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021151	AT	3	6	414056	414061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021151	A	6	6	414111	414116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021151	CAT	2	6	415560	415565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021151	ATAC	2	8	415578	415585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_021151	GTT	2	6	415681	415686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021151	GC	3	6	415708	415713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_021151	A	6	6	416196	416201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021151	AAC	2	6	419318	419323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021151	TCC	2	6	420846	420851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_021151	TAC	2	6	421461	421466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021151	GT	3	6	421483	421488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021151	AAT	2	6	421568	421573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021151	TTG	2	6	421588	421593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021151	TTAT	2	8	421644	421651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021151	TTA	2	6	421661	421666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021151	CTA	2	6	421714	421719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021151	TGA	2	6	421758	421763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021151	GAG	2	6	421783	421788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021151	CTC	2	6	421792	421797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021151	ATG	2	6	421812	421817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021151	GGT	2	6	421914	421919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021151	A	6	6	421974	421979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021151	TAGC	2	8	422003	422010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_021151	CCG	3	9	422066	422074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_021151	CGG	2	6	422081	422086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021151	T	7	7	422087	422093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021151	TTAA	2	8	423219	423226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021151	CCA	2	6	427253	427258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021151	ATGA	2	8	427312	427319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021151	A	7	7	427326	427332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021151	ATTT	2	8	427366	427373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021151	A	6	6	427412	427417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021151	GA	3	6	427421	427426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021151	GT	3	6	427479	427484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021151	ACC	2	6	427502	427507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_021151	AATA	2	8	427595	427602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021151	ATT	2	6	429145	429150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021151	GGC	2	6	429172	429177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021151	CGCC	2	8	429184	429191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1093	NC_021151	ACTA	2	8	429313	429320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_021151	AT	3	6	429324	429329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021151	ATAA	2	8	429434	429441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021151	GA	3	6	429459	429464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021151	ATT	2	6	429475	429480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021151	TA	3	6	429493	429498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021151	T	6	6	429563	429568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021151	AAT	2	6	429585	429590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021151	AAT	2	6	429626	429631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021151	AT	3	6	429652	429657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021151	ATT	2	6	429664	429669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021151	TGT	2	6	429679	429684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021151	TAG	2	6	429688	429693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021151	TCAC	2	8	429723	429730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_021151	CAG	2	6	430864	430869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021151	A	6	6	430880	430885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021151	CAGAG	2	10	431847	431856	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_021151	A	7	7	431877	431883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021151	GTAA	2	8	431891	431898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021151	AGG	2	6	431899	431904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021151	GC	3	6	431982	431987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_021151	CG	3	6	432029	432034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_021151	CAT	2	6	433640	433645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021151	ACGAT	2	10	433650	433659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_021151	CCA	2	6	433735	433740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021151	ATT	2	6	433844	433849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021151	ATT	2	6	433858	433863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021151	TTTTC	2	10	433899	433908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_021151	TA	3	6	434606	434611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021151	TATGT	2	10	434632	434641	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021151	TGTT	2	8	434701	434708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021151	ATTC	2	8	434767	434774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_021151	GCA	2	6	434780	434785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_021151	TTA	2	6	434795	434800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021151	TTG	2	6	434883	434888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021151	TATT	2	8	434889	434896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021151	ATT	2	6	434998	435003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021151	TGTCAT	2	12	435024	435035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1131	NC_021151	ATG	2	6	435065	435070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021151	TTC	2	6	435091	435096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_021151	T	6	6	436260	436265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021151	TGA	2	6	436287	436292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021151	GAT	2	6	437128	437133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021151	AATT	2	8	437230	437237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021151	TGG	2	6	439692	439697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_021151	GCGCT	2	10	439713	439722	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1274	NC_021151	GAG	2	6	491105	491110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_021151	CAT	2	6	546500	546505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_021151	GTC	2	6	546513	546518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_021151	GCTT	2	8	546546	546553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1417	NC_021151	GGT	2	6	546570	546575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_021151	TAC	2	6	546586	546591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_021151	ATG	2	6	546616	546621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_021151	TGT	2	6	546624	546629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_021151	A	6	6	546670	546675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_021151	ATG	2	6	546701	546706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_021151	CCT	2	6	546717	546722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1424	NC_021151	TA	4	8	546725	546732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_021151	T	6	6	546778	546783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_021151	TAA	3	9	546808	546816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_021151	T	6	6	546839	546844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_021151	GTTA	2	8	546865	546872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_021151	T	7	7	546876	546882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_021151	TC	3	6	546894	546899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1431	NC_021151	ATTCT	2	10	546938	546947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1432	NC_021151	TATAA	2	10	546948	546957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_021151	TGT	2	6	546965	546970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_021151	GATA	2	8	546975	546982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_021151	CAT	2	6	547024	547029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_021151	TGT	2	6	547232	547237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_021151	AT	4	8	547273	547280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_021151	GTA	2	6	547365	547370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_021151	ATT	2	6	547416	547421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_021151	ATA	2	6	547498	547503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_021151	AGT	2	6	547504	547509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_021151	GTT	2	6	547518	547523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_021151	CTT	2	6	548138	548143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1445	NC_021151	CCTG	2	8	548159	548166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1446	NC_021151	TC	3	6	548172	548177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1447	NC_021151	CT	3	6	548187	548192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1448	NC_021151	AGGT	2	8	548272	548279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_021151	AGGA	2	8	548287	548294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_021151	TCA	2	6	548366	548371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_021151	GTAT	2	8	548434	548441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_021151	T	6	6	548460	548465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_021151	GCC	2	6	548486	548491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1455	NC_021151	CCT	2	6	548518	548523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1456	NC_021151	TTA	2	6	548583	548588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_021151	TGA	2	6	548603	548608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_021151	AAT	2	6	548674	548679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_021151	TTA	2	6	548685	548690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_021151	TTA	2	6	548740	548745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_021151	GCG	2	6	548788	548793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1465	NC_021151	CAA	2	6	549144	549149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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