MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021151	TCA	2	6	223428	223433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021151	CAATAT	2	12	229487	229498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
503	NC_021151	CTGTC	2	10	229554	229563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
504	NC_021151	AAG	2	6	229600	229605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021151	GC	3	6	229649	229654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_021151	TGA	2	6	229707	229712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021151	AAT	2	6	229735	229740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021151	TAA	3	9	229829	229837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021151	ATA	2	6	229858	229863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021151	ATT	2	6	229868	229873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021151	T	7	7	229872	229878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021151	TAA	2	6	229886	229891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021151	A	6	6	229890	229895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021151	AAAT	2	8	229907	229914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021151	A	8	8	229933	229940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021151	T	6	6	229953	229958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021151	T	8	8	229960	229967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021151	AAAT	2	8	229985	229992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021151	TA	3	6	230008	230013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021151	T	7	7	230035	230041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021151	T	7	7	230064	230070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021151	CTTG	2	8	230082	230089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_021151	TTTG	2	8	230091	230098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021151	T	6	6	230099	230104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021151	TAT	2	6	230121	230126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021151	TAAA	2	8	230145	230152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021151	A	6	6	230150	230155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021151	TTAT	2	8	230207	230214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021151	GTT	2	6	230221	230226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021151	CTT	2	6	230229	230234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021151	ATATA	2	10	230268	230277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021151	CTA	2	6	230281	230286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021151	TG	3	6	230316	230321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021151	TAA	2	6	230349	230354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021151	ATC	2	6	230932	230937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021151	GAT	2	6	230957	230962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021151	A	7	7	230972	230978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021151	TA	3	6	230984	230989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021151	A	9	9	236857	236865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021151	GGC	2	6	236872	236877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021151	GTT	2	6	236897	236902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021151	TCT	2	6	238361	238366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021151	C	6	6	245678	245683	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
544	NC_021151	TGCTC	2	10	245756	245765	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
545	NC_021151	AGG	2	6	245768	245773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021151	CGG	2	6	246940	246945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021151	AT	3	6	246971	246976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021151	AC	3	6	247016	247021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021151	TCA	2	6	247423	247428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021151	AAT	2	6	247443	247448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021151	CCA	2	6	247470	247475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_021151	A	7	7	247484	247490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021151	AGA	2	6	247505	247510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021151	GCG	2	6	247538	247543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021151	G	6	6	248966	248971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021151	ATAA	2	8	249837	249844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021151	CT	3	6	252664	252669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_021151	GCC	2	6	252671	252676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_021151	GAT	2	6	253574	253579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021151	AAT	2	6	253586	253591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021151	TCAG	2	8	253614	253621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_021151	T	6	6	253690	253695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021151	ACTG	2	8	253706	253713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_021151	TGC	2	6	253742	253747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_021151	CAA	2	6	253792	253797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021151	GC	3	6	253831	253836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_021151	AC	3	6	253862	253867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_021151	AAC	2	6	253900	253905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021151	AC	4	8	253904	253911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_021151	GGC	2	6	254771	254776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021151	GTA	2	6	254884	254889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021151	GAG	2	6	255846	255851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021151	CTT	2	6	255866	255871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021151	CT	3	6	255879	255884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_021151	GAAA	2	8	255974	255981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021151	TTA	2	6	256757	256762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021151	TG	3	6	256807	256812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021151	GTCTG	2	10	256816	256825	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
579	NC_021151	GTG	2	6	257463	257468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021151	AGA	2	6	257484	257489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021151	GCG	2	6	257508	257513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_021151	AGA	2	6	258765	258770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021151	T	6	6	258837	258842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021151	T	6	6	258872	258877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021151	CG	3	6	258966	258971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_021151	A	6	6	259050	259055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021151	TTAG	2	8	262060	262067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021151	GAA	2	6	262068	262073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021151	ATA	2	6	262077	262082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021151	TTA	2	6	266203	266208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021151	T	8	8	273754	273761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021151	GCAG	2	8	273857	273864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
593	NC_021151	T	6	6	275712	275717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021151	GCGCT	2	10	279673	279682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
595	NC_021151	CAC	2	6	279730	279735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_021151	CAA	2	6	279743	279748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021151	CCT	2	6	280206	280211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_021151	TAA	2	6	281457	281462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021151	GGC	2	6	281496	281501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021151	GCA	2	6	281517	281522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021151	GCG	2	6	281531	281536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021151	TGC	2	6	281537	281542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021151	TGA	2	6	281603	281608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021151	GAA	2	6	281632	281637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021151	CGG	2	6	281675	281680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021151	TAT	2	6	281719	281724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021151	CG	3	6	281725	281730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_021151	GTAT	4	16	281846	281861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021151	GCG	2	6	281873	281878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021151	GGC	2	6	281950	281955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021151	TGC	2	6	281979	281984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021151	CACT	2	8	282091	282098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_021151	CAA	2	6	282160	282165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021151	A	7	7	283945	283951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021151	AATG	2	8	285123	285130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021151	AAT	2	6	285196	285201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021151	TGTGT	2	10	286068	286077	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021151	TAT	2	6	287770	287775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021151	AATGA	2	10	287779	287788	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021151	ATCA	2	8	287863	287870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_021151	CTG	2	6	287898	287903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021151	CGG	2	6	288610	288615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021151	CA	3	6	288629	288634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_021151	CGGT	2	8	288641	288648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_021151	TG	3	6	288769	288774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021151	GGC	2	6	288923	288928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021151	AGC	2	6	288963	288968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021151	TGC	2	6	288970	288975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021151	ACT	2	6	289037	289042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021151	TTG	2	6	289134	289139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021151	CGA	2	6	289162	289167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021151	GCA	2	6	289236	289241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021151	GAA	2	6	289295	289300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021151	GGA	2	6	289331	289336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021151	TAA	2	6	289349	289354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021151	GCA	2	6	289357	289362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021151	AGA	2	6	289378	289383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021151	CAG	2	6	289404	289409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_021151	G	6	6	289551	289556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021151	GGA	2	6	289595	289600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_021151	GGC	2	6	289615	289620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_021151	GAA	2	6	289858	289863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_021151	TGC	2	6	289934	289939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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646	NC_021151	GGA	2	6	290059	290064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_021151	CGT	2	6	290178	290183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_021151	GTAG	2	8	290320	290327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
652	NC_021151	CCT	2	6	290420	290425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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657	NC_021151	GGT	2	6	290546	290551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_021151	G	6	6	291346	291351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_021151	AGCGA	2	10	292252	292261	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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758	NC_021151	TTTGG	2	10	310758	310767	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
759	NC_021151	GTT	2	6	313507	313512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_021151	T	6	6	315997	316002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021151	TCG	2	6	316111	316116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_021151	GC	3	6	316148	316153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
774	NC_021151	CTGGA	2	10	316200	316209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
775	NC_021151	TTC	2	6	316227	316232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_021151	TCA	2	6	316246	316251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_021151	AAC	2	6	316365	316370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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