MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021151	TGC	2	6	2879631	2879636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_021151	GCT	2	6	2879668	2879673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_021151	GTA	2	6	2879823	2879828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_021151	A	6	6	2879852	2879857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_021151	AT	3	6	2879863	2879868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_021151	CAA	2	6	2880733	2880738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_021151	TTC	2	6	2880805	2880810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_021151	AC	3	6	2880830	2880835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7509	NC_021151	CAT	2	6	2880853	2880858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_021151	ATTT	2	8	2881002	2881009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_021151	CCTCC	2	10	2881109	2881118	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7512	NC_021151	A	7	7	2883509	2883515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_021151	GGT	2	6	2883516	2883521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_021151	A	8	8	2883591	2883598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_021151	GGT	2	6	2883660	2883665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_021151	ACC	2	6	2883714	2883719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_021151	GAAT	2	8	2883729	2883736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_021151	AAAGGC	2	12	2883759	2883770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7519	NC_021151	GAA	2	6	2883784	2883789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_021151	ACA	2	6	2883826	2883831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_021151	AAC	3	9	2883849	2883857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_021151	AT	3	6	2883908	2883913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_021151	CTTAT	2	10	2883934	2883943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7524	NC_021151	ATA	2	6	2883948	2883953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_021151	TAA	2	6	2883970	2883975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_021151	AGA	2	6	2884001	2884006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_021151	AAT	2	6	2884016	2884021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_021151	ATT	3	9	2884070	2884078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_021151	A	8	8	2886151	2886158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_021151	A	8	8	2886203	2886210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_021151	ATTAAA	2	12	2886219	2886230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_021151	TAAA	2	8	2886249	2886256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_021151	CAAT	2	8	2886273	2886280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7534	NC_021151	CT	3	6	2886619	2886624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7535	NC_021151	GCA	2	6	2886627	2886632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_021151	GTT	2	6	2887080	2887085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_021151	CAC	2	6	2887118	2887123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7538	NC_021151	AGG	2	6	2887128	2887133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_021151	TACT	2	8	2890086	2890093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_021151	AT	3	6	2890126	2890131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_021151	CAA	2	6	2890152	2890157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_021151	CA	3	6	2890163	2890168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7543	NC_021151	T	6	6	2890179	2890184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_021151	AAT	2	6	2890282	2890287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_021151	CAA	2	6	2890291	2890296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_021151	A	6	6	2890304	2890309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_021151	AAG	2	6	2890365	2890370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_021151	TGC	2	6	2893701	2893706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_021151	GC	3	6	2893717	2893722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7550	NC_021151	GCC	2	6	2893772	2893777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_021151	CAG	2	6	2895381	2895386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_021151	A	7	7	2895429	2895435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_021151	CGG	2	6	2895544	2895549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_021151	CAT	2	6	2895555	2895560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_021151	GCGG	2	8	2897563	2897570	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7556	NC_021151	TCCT	2	8	2897619	2897626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7557	NC_021151	TCT	2	6	2897659	2897664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_021151	CAT	2	6	2897688	2897693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_021151	ATA	2	6	2897695	2897700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_021151	TTAT	2	8	2897704	2897711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_021151	CAA	2	6	2897754	2897759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_021151	GCT	2	6	2897834	2897839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_021151	CGG	2	6	2897883	2897888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7564	NC_021151	GTT	2	6	2897913	2897918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_021151	GCT	2	6	2897919	2897924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_021151	CGG	2	6	2898008	2898013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_021151	GCC	2	6	2898071	2898076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7568	NC_021151	CAT	2	6	2898115	2898120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_021151	AGG	2	6	2898142	2898147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_021151	ACG	2	6	2898172	2898177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_021151	CTG	2	6	2898192	2898197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_021151	AGGC	2	8	2898198	2898205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7573	NC_021151	GTACC	2	10	2898223	2898232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7574	NC_021151	CCA	2	6	2898233	2898238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7575	NC_021151	GGA	2	6	2898345	2898350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_021151	TGTA	2	8	2899265	2899272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_021151	ACT	2	6	2899283	2899288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_021151	TAGA	2	8	2899317	2899324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_021151	AT	3	6	2901326	2901331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_021151	ATTT	2	8	2901363	2901370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_021151	T	7	7	2901399	2901405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_021151	T	6	6	2901432	2901437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_021151	AAT	2	6	2901446	2901451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_021151	CATC	2	8	2901464	2901471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7585	NC_021151	A	6	6	2901504	2901509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_021151	TCA	2	6	2901512	2901517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7588	NC_021151	CTT	2	6	2902977	2902982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_021151	T	6	6	2902981	2902986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_021151	TGT	2	6	2902995	2903000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_021151	ATCA	2	8	2903051	2903058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7592	NC_021151	ATA	3	9	2903085	2903093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_021151	CAA	2	6	2903099	2903104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_021151	CAT	2	6	2903130	2903135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_021151	CAC	2	6	2903136	2903141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7596	NC_021151	CCTTC	2	10	2903152	2903161	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7597	NC_021151	A	6	6	2903167	2903172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_021151	CAA	2	6	2903183	2903188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_021151	CCA	2	6	2903204	2903209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7600	NC_021151	GCCA	2	8	2903221	2903228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7601	NC_021151	GTT	2	6	2903236	2903241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_021151	CTA	2	6	2903258	2903263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_021151	GCACA	2	10	2903269	2903278	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7604	NC_021151	T	6	6	2903291	2903296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_021151	GTC	2	6	2903306	2903311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7606	NC_021151	AAG	2	6	2903364	2903369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_021151	C	6	6	2904039	2904044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7608	NC_021151	GCA	2	6	2904066	2904071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_021151	ACT	2	6	2904104	2904109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_021151	T	6	6	2904152	2904157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_021151	TCC	2	6	2904191	2904196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7612	NC_021151	TTCA	2	8	2904274	2904281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7613	NC_021151	GCC	2	6	2904771	2904776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7614	NC_021151	GCC	2	6	2904827	2904832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7615	NC_021151	TAA	2	6	2904843	2904848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_021151	GT	3	6	2904861	2904866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_021151	TTG	2	6	2905262	2905267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_021151	GATT	2	8	2905271	2905278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_021151	GGA	2	6	2905284	2905289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_021151	TTG	2	6	2905358	2905363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_021151	TGT	2	6	2905366	2905371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_021151	TTC	2	6	2905435	2905440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_021151	CAG	2	6	2905496	2905501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_021151	TG	3	6	2905514	2905519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_021151	CTGG	2	8	2905591	2905598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7626	NC_021151	TAAA	2	8	2905643	2905650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_021151	TG	3	6	2908367	2908372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_021151	A	8	8	2908422	2908429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_021151	TCGTA	2	10	2908490	2908499	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7630	NC_021151	ACCT	2	8	2908526	2908533	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7632	NC_021151	G	6	6	2909913	2909918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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