MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021151	TAGA	2	8	2708741	2708748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_021151	CGG	2	6	2708799	2708804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_021151	AC	3	6	2709067	2709072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_021151	ATA	2	6	2709078	2709083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_021151	TGA	2	6	2709860	2709865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021151	TGA	2	6	2709876	2709881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_021151	TG	3	6	2709913	2709918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_021151	A	7	7	2709949	2709955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_021151	AT	3	6	2709975	2709980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_021151	GCTT	2	8	2709981	2709988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7011	NC_021151	TA	3	6	2709996	2710001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_021151	CAA	2	6	2710027	2710032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_021151	CTCG	2	8	2711341	2711348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_021151	T	6	6	2711349	2711354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_021151	AAAT	2	8	2711387	2711394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_021151	CAA	2	6	2711407	2711412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_021151	ATA	2	6	2711414	2711419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_021151	TAAT	2	8	2711431	2711438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_021151	ATA	2	6	2711459	2711464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_021151	CAG	2	6	2711487	2711492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_021151	GAT	2	6	2711534	2711539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_021151	TGGGTT	2	12	2711574	2711585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_021151	CGG	2	6	2711607	2711612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_021151	CT	3	6	2712615	2712620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_021151	ACC	2	6	2712671	2712676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_021151	TAC	2	6	2712711	2712716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_021151	TGAGA	2	10	2712731	2712740	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_021151	GAA	3	9	2712745	2712753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_021151	CTT	2	6	2713012	2713017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_021151	T	6	6	2713058	2713063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_021151	AAC	2	6	2713084	2713089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_021151	CAG	2	6	2713097	2713102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_021151	GAA	2	6	2713120	2713125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021151	GAC	3	9	2714226	2714234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_021151	ATC	2	6	2714255	2714260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_021151	GGC	2	6	2714288	2714293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_021151	CATT	2	8	2714359	2714366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7038	NC_021151	ATT	2	6	2716179	2716184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_021151	CTA	2	6	2717196	2717201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_021151	GGC	2	6	2717217	2717222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_021151	GCG	2	6	2717223	2717228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_021151	GTTTT	2	10	2718662	2718671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_021151	ATA	2	6	2720237	2720242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_021151	GCT	2	6	2720277	2720282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_021151	GT	3	6	2720315	2720320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021151	CAA	2	6	2722854	2722859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_021151	TTG	2	6	2722882	2722887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_021151	GCG	2	6	2722907	2722912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_021151	TTA	2	6	2722926	2722931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_021151	CAA	2	6	2722935	2722940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_021151	T	7	7	2722950	2722956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_021151	A	7	7	2722957	2722963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_021151	T	6	6	2723014	2723019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021151	GCA	2	6	2724162	2724167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_021151	CCT	2	6	2725883	2725888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_021151	GCT	2	6	2725955	2725960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_021151	TAC	2	6	2726554	2726559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_021151	ACC	2	6	2726648	2726653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_021151	AT	3	6	2730037	2730042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_021151	A	6	6	2730048	2730053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_021151	ATG	2	6	2730139	2730144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_021151	CCT	2	6	2730147	2730152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_021151	TGAGAA	2	12	2730163	2730174	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021151	GC	3	6	2731345	2731350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7065	NC_021151	GAC	2	6	2731393	2731398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_021151	GCG	2	6	2731403	2731408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_021151	AC	3	6	2731425	2731430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7068	NC_021151	GTG	2	6	2731452	2731457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_021151	GT	3	6	2731518	2731523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021151	AAT	2	6	2733122	2733127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021151	GGA	2	6	2733151	2733156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_021151	CAAC	2	8	2733202	2733209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_021151	CAA	2	6	2733941	2733946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_021151	TGT	2	6	2733956	2733961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_021151	ATT	2	6	2733963	2733968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_021151	A	6	6	2733985	2733990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_021151	ATC	2	6	2734012	2734017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_021151	CCT	2	6	2734031	2734036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7079	NC_021151	CAAG	2	8	2734038	2734045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7080	NC_021151	T	6	6	2736554	2736559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_021151	ATT	2	6	2736560	2736565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_021151	GAG	2	6	2736598	2736603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_021151	CGG	2	6	2737398	2737403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_021151	GGCA	2	8	2737455	2737462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7085	NC_021151	CCA	2	6	2737487	2737492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7086	NC_021151	GC	3	6	2737527	2737532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_021151	GTA	2	6	2737551	2737556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_021151	GCC	2	6	2737590	2737595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_021151	GCG	2	6	2737600	2737605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_021151	TAA	2	6	2737710	2737715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_021151	TTCATC	2	12	2738211	2738222	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_021151	GAG	2	6	2738301	2738306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_021151	CGA	2	6	2738321	2738326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_021151	T	6	6	2738359	2738364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021151	T	6	6	2738401	2738406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021151	GGA	2	6	2739255	2739260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021151	TAT	2	6	2739399	2739404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_021151	CAT	2	6	2739421	2739426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_021151	GAC	2	6	2739451	2739456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_021151	TCA	2	6	2739494	2739499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_021151	TG	3	6	2740556	2740561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_021151	ATC	2	6	2740578	2740583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_021151	TAA	2	6	2740585	2740590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_021151	A	6	6	2740589	2740594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_021151	CATC	2	8	2740637	2740644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7106	NC_021151	ATT	2	6	2740865	2740870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_021151	ATT	2	6	2740899	2740904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_021151	GGA	2	6	2740914	2740919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_021151	AACAG	2	10	2740920	2740929	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7110	NC_021151	GAT	2	6	2741256	2741261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_021151	GGA	2	6	2741265	2741270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_021151	GCA	2	6	2741279	2741284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_021151	A	6	6	2742146	2742151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_021151	ATT	2	6	2742155	2742160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_021151	AAAC	2	8	2742235	2742242	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7116	NC_021151	CAAA	2	8	2742287	2742294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7117	NC_021151	ATA	2	6	2742309	2742314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_021151	ATT	2	6	2742335	2742340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_021151	ATA	2	6	2742350	2742355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_021151	A	6	6	2742369	2742374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_021151	ATCA	2	8	2742395	2742402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7122	NC_021151	GAT	2	6	2746320	2746325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_021151	GTT	2	6	2746368	2746373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_021151	ACC	2	6	2746887	2746892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_021151	T	6	6	2746893	2746898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_021151	AAT	2	6	2746911	2746916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_021151	A	6	6	2746964	2746969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_021151	TAA	2	6	2746981	2746986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_021151	TA	3	6	2747043	2747048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_021151	A	7	7	2747069	2747075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_021151	CTA	2	6	2747199	2747204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7132	NC_021151	AG	3	6	2747232	2747237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_021151	ACAT	2	8	2747278	2747285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7249	NC_021151	TTG	2	6	2794736	2794741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7251	NC_021151	AC	3	6	2794831	2794836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7252	NC_021151	CGT	3	9	2794849	2794857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7254	NC_021151	C	6	6	2795035	2795040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7255	NC_021151	ACG	2	6	2795084	2795089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7258	NC_021151	ACC	2	6	2795279	2795284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7259	NC_021151	CCT	2	6	2795361	2795366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7260	NC_021151	CTC	2	6	2795398	2795403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7261	NC_021151	AGG	2	6	2795415	2795420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7263	NC_021151	GGT	2	6	2795502	2795507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7395	NC_021151	CAA	2	6	2822874	2822879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7396	NC_021151	TGA	2	6	2822916	2822921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7397	NC_021151	TAT	2	6	2822928	2822933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7398	NC_021151	TGA	2	6	2823346	2823351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_021151	TCA	2	6	2823360	2823365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7400	NC_021151	ATA	2	6	2824243	2824248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7401	NC_021151	A	8	8	2824265	2824272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7402	NC_021151	AGAT	2	8	2824327	2824334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7403	NC_021151	TCA	2	6	2824344	2824349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7404	NC_021151	T	6	6	2824891	2824896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7405	NC_021151	CATG	2	8	2824939	2824946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7407	NC_021151	AATA	2	8	2824988	2824995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7410	NC_021151	TAA	2	6	2825038	2825043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7418	NC_021151	A	6	6	2825375	2825380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7431	NC_021151	CG	3	6	2842065	2842070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7432	NC_021151	CCTG	2	8	2842076	2842083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7434	NC_021151	GACT	2	8	2842158	2842165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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