MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021151	GAT	2	6	2265474	2265479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_021151	CAT	2	6	2266100	2266105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_021151	A	6	6	2266126	2266131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_021151	A	6	6	2266161	2266166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021151	AATC	2	8	2266245	2266252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_021151	GTC	2	6	2266273	2266278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_021151	ATG	2	6	2266279	2266284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_021151	ATCA	2	8	2266324	2266331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_021151	TAA	2	6	2266340	2266345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021151	ATA	2	6	2266487	2266492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_021151	TAT	2	6	2266493	2266498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021151	TA	3	6	2266508	2266513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021151	AGAAC	2	10	2266546	2266555	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6014	NC_021151	AGC	2	6	2266568	2266573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_021151	TAATA	2	10	2266576	2266585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_021151	TCG	2	6	2266593	2266598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_021151	TCG	2	6	2269746	2269751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_021151	TTTG	2	8	2269759	2269766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021151	A	6	6	2269865	2269870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021151	TAA	2	6	2269924	2269929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021151	AAAG	2	8	2269936	2269943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021151	A	7	7	2273002	2273008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021151	GGC	2	6	2273019	2273024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_021151	C	6	6	2273263	2273268	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6025	NC_021151	TAC	2	6	2273373	2273378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_021151	CAG	2	6	2273408	2273413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_021151	AAT	2	6	2273474	2273479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021151	T	7	7	2273500	2273506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021151	CCGC	2	8	2273512	2273519	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6030	NC_021151	A	6	6	2273545	2273550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021151	ATT	2	6	2281389	2281394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021151	ATTT	2	8	2281421	2281428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021151	AAT	2	6	2281440	2281445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021151	ATATT	2	10	2281459	2281468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_021151	A	6	6	2281482	2281487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_021151	TAAC	2	8	2281492	2281499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_021151	ATT	2	6	2281552	2281557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_021151	T	6	6	2281571	2281576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_021151	CAGC	2	8	2281876	2281883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_021151	AGA	2	6	2281901	2281906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021151	GTA	2	6	2281956	2281961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_021151	TTA	2	6	2282009	2282014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021151	T	7	7	2282041	2282047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021151	T	6	6	2282067	2282072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_021151	GAA	2	6	2282076	2282081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021151	GC	3	6	2285657	2285662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_021151	ATA	2	6	2285710	2285715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_021151	AGCGC	2	10	2286258	2286267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6049	NC_021151	A	6	6	2286277	2286282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021151	TTC	2	6	2286302	2286307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_021151	A	7	7	2288616	2288622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021151	ATA	2	6	2288670	2288675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021151	A	7	7	2288694	2288700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021151	CG	4	8	2289514	2289521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_021151	ATG	2	6	2289550	2289555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021151	GC	3	6	2289556	2289561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_021151	ATCC	2	8	2289563	2289570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_021151	CCA	3	9	2290019	2290027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_021151	GCG	2	6	2290596	2290601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_021151	AAT	2	6	2290644	2290649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021151	TTA	2	6	2290739	2290744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_021151	GA	3	6	2290753	2290758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021151	T	6	6	2291360	2291365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021151	TCC	2	6	2291369	2291374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_021151	A	6	6	2291406	2291411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021151	TTAT	2	8	2292398	2292405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_021151	GTGG	2	8	2296375	2296382	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_021151	TGC	2	6	2298210	2298215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_021151	A	6	6	2298234	2298239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021151	TAC	2	6	2298267	2298272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_021151	TAA	2	6	2298330	2298335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_021151	CTG	2	6	2298379	2298384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_021151	AGAA	2	8	2298404	2298411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021151	AAT	2	6	2298439	2298444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_021151	TAA	2	6	2298481	2298486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_021151	AAT	2	6	2298501	2298506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_021151	AAT	2	6	2298515	2298520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021151	A	6	6	2298534	2298539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_021151	A	6	6	2298564	2298569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021151	CGC	2	6	2298570	2298575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_021151	AAC	2	6	2300317	2300322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_021151	A	8	8	2300417	2300424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021151	GCG	2	6	2300425	2300430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_021151	CTT	2	6	2302489	2302494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_021151	T	6	6	2302503	2302508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_021151	TGC	2	6	2302513	2302518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_021151	ATC	2	6	2302558	2302563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_021151	GT	3	6	2302573	2302578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_021151	AATT	2	8	2302583	2302590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_021151	T	6	6	2302613	2302618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_021151	A	6	6	2302693	2302698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_021151	ATT	2	6	2302770	2302775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_021151	TGT	2	6	2303587	2303592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_021151	CCGCC	2	10	2303595	2303604	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6095	NC_021151	ATT	2	6	2306045	2306050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_021151	TGA	2	6	2306839	2306844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021151	AAC	2	6	2306871	2306876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_021151	CAA	2	6	2306990	2306995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_021151	T	6	6	2307059	2307064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_021151	ACG	2	6	2307086	2307091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_021151	T	7	7	2308811	2308817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_021151	ACT	2	6	2308825	2308830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_021151	TAA	2	6	2308845	2308850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021151	AAT	2	6	2308853	2308858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_021151	A	7	7	2308991	2308997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021151	ATG	2	6	2309039	2309044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021151	CGT	2	6	2309064	2309069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_021151	CCA	2	6	2309072	2309077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_021151	T	6	6	2309080	2309085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021151	TTC	2	6	2309272	2309277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_021151	GAA	2	6	2309381	2309386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021151	ATC	2	6	2309387	2309392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_021151	ATG	2	6	2309432	2309437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_021151	CGT	2	6	2309457	2309462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021151	CCA	2	6	2309465	2309470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_021151	AAT	2	6	2309507	2309512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_021151	TTG	2	6	2309513	2309518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021151	CCAG	2	8	2309585	2309592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_021151	AAG	2	6	2309620	2309625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021151	TCAT	2	8	2311665	2311672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_021151	T	6	6	2311702	2311707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_021151	GTCA	2	8	2311724	2311731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6123	NC_021151	CTG	2	6	2313233	2313238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_021151	AAT	2	6	2313246	2313251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_021151	TC	3	6	2313318	2313323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_021151	AAT	2	6	2313372	2313377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_021151	GGC	2	6	2314965	2314970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_021151	TAAC	2	8	2315081	2315088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_021151	ACG	2	6	2315101	2315106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_021151	TC	3	6	2317546	2317551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_021151	TCC	2	6	2317590	2317595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_021151	GCT	2	6	2317652	2317657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_021151	ATC	2	6	2317684	2317689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_021151	GCG	2	6	2317736	2317741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_021151	GCA	2	6	2317766	2317771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6136	NC_021151	ACA	2	6	2317780	2317785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_021151	AACA	2	8	2317802	2317809	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6138	NC_021151	CA	3	6	2317808	2317813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6139	NC_021151	AAC	2	6	2317843	2317848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_021151	GAT	2	6	2317881	2317886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_021151	GGGAC	2	10	2318821	2318830	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6142	NC_021151	CAA	2	6	2318918	2318923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_021151	GCT	2	6	2318938	2318943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6144	NC_021151	T	8	8	2318948	2318955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_021151	GC	3	6	2321116	2321121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6146	NC_021151	GC	3	6	2321132	2321137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6147	NC_021151	CTT	2	6	2321152	2321157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_021151	CAC	2	6	2323443	2323448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6149	NC_021151	GTG	2	6	2323457	2323462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6151	NC_021151	AT	3	6	2329534	2329539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_021151	CAC	2	6	2329543	2329548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6154	NC_021151	AT	3	6	2329601	2329606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6155	NC_021151	A	6	6	2329616	2329621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_021151	TAA	2	6	2331182	2331187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6162	NC_021151	CCT	2	6	2335873	2335878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6163	NC_021151	CGTG	2	8	2335921	2335928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6164	NC_021151	GCTAT	2	10	2335934	2335943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6168	NC_021151	A	6	6	2341954	2341959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6169	NC_021151	A	7	7	2341973	2341979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6170	NC_021151	TGGGA	2	10	2342788	2342797	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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6174	NC_021151	T	6	6	2342930	2342935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6175	NC_021151	ATT	2	6	2342952	2342957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6178	NC_021151	TAG	2	6	2348057	2348062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6184	NC_021151	CT	3	6	2349755	2349760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6185	NC_021151	T	6	6	2349760	2349765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6186	NC_021151	AT	3	6	2350473	2350478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6213	NC_021151	ACAT	2	8	2355555	2355562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6221	NC_021151	AATAA	2	10	2355746	2355755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6222	NC_021151	A	6	6	2355824	2355829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6223	NC_021151	TAA	2	6	2359734	2359739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6231	NC_021151	ATAA	2	8	2359954	2359961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_021151	A	7	7	2359970	2359976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_021151	CTGA	2	8	2359985	2359992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6242	NC_021151	GA	3	6	2369752	2369757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_021151	GGC	2	6	2369772	2369777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6250	NC_021151	A	6	6	2374606	2374611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6251	NC_021151	TCTT	2	8	2374640	2374647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6252	NC_021151	A	7	7	2374652	2374658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_021151	T	6	6	2374690	2374695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_021151	A	6	6	2374733	2374738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_021151	TTA	2	6	2374746	2374751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6257	NC_021151	CTT	2	6	2374891	2374896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_021151	CT	3	6	2376473	2376478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6259	NC_021151	CAT	3	9	2376484	2376492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6260	NC_021151	TGAAA	2	10	2376541	2376550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_021151	GGC	2	6	2376608	2376613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_021151	AAGT	2	8	2376642	2376649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_021151	GAC	2	6	2376693	2376698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6264	NC_021151	TCC	2	6	2377276	2377281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6266	NC_021151	ATCAA	2	10	2377342	2377351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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