MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 13098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021151	A	8	8	1653018	1653025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021151	T	6	6	1653072	1653077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021151	TCA	2	6	1653140	1653145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_021151	CATTAA	2	12	1653147	1653158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4505	NC_021151	G	6	6	1653191	1653196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021151	TGT	2	6	1653203	1653208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021151	AC	4	8	1653241	1653248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_021151	CAA	2	6	1653343	1653348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_021151	T	6	6	1653358	1653363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021151	T	6	6	1653398	1653403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_021151	A	7	7	1653487	1653493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021151	T	6	6	1653507	1653512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021151	T	6	6	1653528	1653533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021151	CTTA	2	8	1654662	1654669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4515	NC_021151	ATA	2	6	1654675	1654680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_021151	AT	3	6	1654700	1654705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021151	ATG	2	6	1654751	1654756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021151	AT	3	6	1654816	1654821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021151	TAT	2	6	1654929	1654934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021151	AAT	2	6	1654939	1654944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021151	ATT	2	6	1654985	1654990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_021151	ATA	2	6	1655022	1655027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021151	ATTA	2	8	1655028	1655035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021151	CATT	2	8	1655046	1655053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_021151	C	6	6	1655079	1655084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4526	NC_021151	GCC	2	6	1655085	1655090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_021151	ATG	2	6	1655158	1655163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021151	TC	3	6	1655172	1655177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_021151	ACA	2	6	1655197	1655202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_021151	A	6	6	1655204	1655209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_021151	CATA	2	8	1655243	1655250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_021151	A	7	7	1655254	1655260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021151	CTAA	2	8	1655273	1655280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_021151	TCT	3	9	1655333	1655341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_021151	CGT	2	6	1655362	1655367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_021151	TCCC	2	8	1656695	1656702	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4537	NC_021151	GGC	2	6	1657353	1657358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_021151	TTC	2	6	1657381	1657386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_021151	A	7	7	1660533	1660539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021151	CTT	2	6	1660556	1660561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_021151	A	6	6	1661070	1661075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021151	ACA	2	6	1661086	1661091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_021151	GTC	2	6	1661188	1661193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_021151	CAT	2	6	1661262	1661267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_021151	A	7	7	1661272	1661278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021151	ATG	2	6	1661288	1661293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021151	T	7	7	1661346	1661352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021151	GGC	2	6	1664825	1664830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_021151	T	6	6	1664933	1664938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021151	CTT	2	6	1664973	1664978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_021151	CTTTG	2	10	1664993	1665002	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4552	NC_021151	CACG	2	8	1670083	1670090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_021151	A	6	6	1670783	1670788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021151	TGT	2	6	1670800	1670805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_021151	CTT	2	6	1672412	1672417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_021151	CTC	2	6	1673018	1673023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_021151	TTC	2	6	1673738	1673743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_021151	CTG	2	6	1673765	1673770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_021151	TGA	2	6	1673776	1673781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_021151	CA	4	8	1673787	1673794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_021151	AGG	2	6	1673797	1673802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021151	CAT	2	6	1674514	1674519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_021151	ATG	2	6	1674522	1674527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_021151	A	6	6	1674545	1674550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021151	TCC	2	6	1674605	1674610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_021151	GCC	2	6	1675557	1675562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_021151	CTT	2	6	1675566	1675571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_021151	CCTGT	2	10	1677754	1677763	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4569	NC_021151	TG	4	8	1677764	1677771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021151	TAA	2	6	1677778	1677783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021151	GGC	2	6	1677820	1677825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_021151	GCGCG	2	10	1678929	1678938	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4573	NC_021151	TG	3	6	1679780	1679785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_021151	TAA	2	6	1679855	1679860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021151	CGG	2	6	1679922	1679927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_021151	AAT	2	6	1679998	1680003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_021151	GCC	2	6	1682058	1682063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_021151	CGG	2	6	1682076	1682081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_021151	CTT	2	6	1684653	1684658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_021151	ATC	2	6	1684659	1684664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_021151	GAC	2	6	1684666	1684671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_021151	T	6	6	1686176	1686181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021151	AAT	2	6	1686187	1686192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021151	TCA	2	6	1686245	1686250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_021151	ACG	2	6	1686253	1686258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_021151	ACA	2	6	1686281	1686286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_021151	GTC	2	6	1689845	1689850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_021151	AGAAAA	2	12	1689872	1689883	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021151	TTCC	2	8	1689899	1689906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_021151	TAAA	2	8	1689913	1689920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_021151	A	6	6	1689931	1689936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021151	AGA	2	6	1689978	1689983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021151	GGC	2	6	1690037	1690042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_021151	GC	3	6	1690109	1690114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_021151	GCT	2	6	1692071	1692076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_021151	GCCCT	2	10	1692112	1692121	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4597	NC_021151	TAT	2	6	1693079	1693084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021151	A	6	6	1693165	1693170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021151	ATT	2	6	1695767	1695772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021151	AAG	2	6	1695787	1695792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021151	GCC	2	6	1696988	1696993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_021151	AT	3	6	1696998	1697003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021151	TAAT	2	8	1697027	1697034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021151	C	6	6	1699254	1699259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4605	NC_021151	TTTC	2	8	1699770	1699777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_021151	TGA	2	6	1699786	1699791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021151	TCT	2	6	1699804	1699809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_021151	CTTT	2	8	1699826	1699833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_021151	CTTT	2	8	1699867	1699874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_021151	TCT	2	6	1699921	1699926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_021151	CAA	2	6	1700227	1700232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_021151	TAA	2	6	1700234	1700239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021151	TTA	2	6	1700250	1700255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_021151	TTA	2	6	1700338	1700343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021151	TA	3	6	1701967	1701972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021151	TGT	2	6	1701987	1701992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021151	TGAA	2	8	1701997	1702004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_021151	A	6	6	1702003	1702008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_021151	TTG	2	6	1702034	1702039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_021151	TAC	2	6	1702041	1702046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_021151	CA	3	6	1703390	1703395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_021151	GTCA	2	8	1705441	1705448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_021151	GGC	2	6	1705458	1705463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_021151	GTT	2	6	1709083	1709088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021151	TCC	2	6	1710040	1710045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_021151	CGG	2	6	1710067	1710072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_021151	CGG	2	6	1710112	1710117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_021151	TCC	2	6	1710153	1710158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_021151	GGC	2	6	1710769	1710774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_021151	CAGC	2	8	1710800	1710807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_021151	AAGCG	2	10	1710825	1710834	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4632	NC_021151	GCA	2	6	1710842	1710847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_021151	TGAA	2	8	1711440	1711447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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