MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 12149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	TA	3	6	13	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021059	TA	4	8	21	28	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021059	ATAAAT	2	12	1189	1200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021059	ATTA	2	8	1214	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021059	T	6	6	1237	1242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021059	AAT	2	6	1249	1254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021059	GCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021059	TAA	2	6	1344	1349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021059	TTTAAA	2	12	1366	1377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021059	A	6	6	1434	1439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021059	A	6	6	1460	1465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021059	AATT	2	8	1470	1477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021059	A	7	7	1526	1532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021059	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021059	ATT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021059	TGAAC	2	10	4872	4881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021059	AGG	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021059	A	6	6	7567	7572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021059	AT	3	6	8518	8523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021059	TAT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021059	ATT	3	9	8563	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021059	ATT	2	6	8629	8634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021059	ACA	2	6	8645	8650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021059	ATA	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021059	AAG	2	6	8748	8753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021059	TAA	2	6	10374	10379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021059	AT	3	6	10402	10407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021059	AG	3	6	10421	10426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021059	AT	4	8	10455	10462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021059	CTAC	2	8	10467	10474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021059	T	7	7	10606	10612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021059	A	6	6	10620	10625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021059	ACGT	2	8	10631	10638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021059	ATA	2	6	10645	10650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021059	ATT	2	6	10658	10663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021059	TA	3	6	11996	12001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021059	ATA	2	6	12038	12043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021059	GTG	2	6	12053	12058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021059	T	7	7	12075	12081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021059	AAC	2	6	12117	12122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021059	CAA	2	6	12170	12175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021059	ATG	2	6	12188	12193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021059	AGGAA	2	10	12239	12248	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021059	GTA	2	6	12276	12281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021059	GTAGG	2	10	12299	12308	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021059	GAT	2	6	12316	12321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021059	TCA	3	9	12357	12365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021059	AAC	2	6	12397	12402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021059	TAAA	2	8	12434	12441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021059	A	6	6	12439	12444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021059	TAT	2	6	12567	12572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021059	T	6	6	12572	12577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021059	TA	3	6	12584	12589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021059	AGG	2	6	12605	12610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021059	AAC	2	6	13779	13784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021059	TCA	2	6	13806	13811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021059	CTT	2	6	13950	13955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021059	T	7	7	13977	13983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021059	AGG	2	6	13989	13994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021059	AT	4	8	14974	14981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021059	TAAATC	2	12	15059	15070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021059	AAT	2	6	15098	15103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021059	CA	3	6	15121	15126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021059	TTA	2	6	15172	15177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021059	ATA	2	6	15241	15246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021059	AAT	2	6	20074	20079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021059	GAT	2	6	20086	20091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021059	AT	3	6	20129	20134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021059	TA	3	6	21624	21629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021059	AGG	2	6	21678	21683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021059	TGCT	2	8	21693	21700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021059	TCGAT	2	10	21707	21716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021059	A	6	6	21726	21731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021059	AGA	2	6	21768	21773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021059	GAT	2	6	21777	21782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021059	AAG	2	6	21817	21822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021059	ATT	2	6	21909	21914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021059	TTC	2	6	21960	21965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021059	A	6	6	21966	21971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021059	A	6	6	21989	21994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021059	ATCT	2	8	22027	22034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021059	CGG	2	6	22085	22090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021059	T	6	6	22123	22128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021059	GCCT	2	8	22155	22162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021059	T	7	7	22231	22237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021059	ATATT	2	10	22245	22254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021059	AT	3	6	22263	22268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021059	TTA	2	6	22380	22385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021059	TTC	2	6	22417	22422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021059	CCA	2	6	22434	22439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021059	TCC	2	6	22441	22446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_021059	AAT	2	6	22478	22483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021059	ATTT	2	8	22487	22494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021059	TAT	2	6	22539	22544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021059	TCA	2	6	22558	22563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021059	CCG	2	6	22589	22594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021059	TAA	2	6	22603	22608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021059	A	6	6	22607	22612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021059	AT	3	6	22618	22623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021059	TA	3	6	22669	22674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021059	T	6	6	22743	22748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021059	A	6	6	22773	22778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021059	ATA	2	6	22786	22791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021059	TAA	2	6	27488	27493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021059	TCA	2	6	27509	27514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021059	T	6	6	27536	27541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021059	TAT	2	6	27554	27559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021059	TAA	2	6	27676	27681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021059	ATA	2	6	27750	27755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021059	AG	3	6	27840	27845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021059	GAC	2	6	28705	28710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021059	T	6	6	28723	28728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021059	TGT	2	6	28730	28735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021059	TGG	2	6	28736	28741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021059	TGT	2	6	28750	28755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021059	TTGA	2	8	28770	28777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021059	AAT	2	6	28787	28792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021059	AAT	2	6	28815	28820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021059	ATCA	2	8	28830	28837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021059	ATA	2	6	28857	28862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021059	AT	3	6	31216	31221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021059	ATA	2	6	31227	31232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021059	T	7	7	31267	31273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021059	A	7	7	31277	31283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021059	TAA	2	6	31327	31332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021059	ATTA	2	8	32072	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021059	A	6	6	32086	32091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021059	ATTA	2	8	32105	32112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021059	TTA	3	9	32110	32118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021059	AT	3	6	32126	32131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021059	AAAG	2	8	32134	32141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021059	TAT	2	6	33515	33520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021059	AATA	2	8	33578	33585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021059	A	6	6	33585	33590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021059	T	6	6	33624	33629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021059	T	6	6	33635	33640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021059	ATT	2	6	33642	33647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021059	TAA	2	6	33677	33682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021059	ATTTTA	2	12	33754	33765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021059	TAAA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021059	T	7	7	33813	33819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021059	AT	3	6	34344	34349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021059	TATAAA	2	12	34356	34367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021059	TCA	2	6	34379	34384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021059	CAC	2	6	34414	34419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_021059	TTA	2	6	34452	34457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021059	TTTG	2	8	34489	34496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021059	AATA	2	8	34504	34511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021059	A	7	7	34528	34534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021059	ATA	2	6	34538	34543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021059	ATA	2	6	34798	34803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021059	TA	3	6	34847	34852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021059	ATC	2	6	34931	34936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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187	NC_021059	TGA	2	6	37271	37276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_021059	GATA	2	8	73269	73276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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