MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 12149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021059	A	6	6	1039528	1039533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021059	TGA	2	6	1039629	1039634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021059	TAT	2	6	1040013	1040018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021059	CAT	2	6	1040024	1040029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_021059	AAT	2	6	1040083	1040088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021059	ATT	3	9	1040098	1040106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021059	TAA	2	6	1040133	1040138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021059	GTA	3	9	1040259	1040267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021059	ATT	2	6	1040317	1040322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021059	CTT	2	6	1040343	1040348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_021059	TTCA	2	8	1040393	1040400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_021059	ACT	2	6	1040405	1040410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_021059	TA	3	6	1040414	1040419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021059	TTG	2	6	1040423	1040428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021059	ATTGCA	2	12	1040534	1040545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4516	NC_021059	ATA	2	6	1040548	1040553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021059	TTA	2	6	1040589	1040594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021059	ATTT	2	8	1040626	1040633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021059	CGT	2	6	1040634	1040639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_021059	A	6	6	1040668	1040673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021059	ACT	2	6	1040704	1040709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_021059	TCC	2	6	1041630	1041635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_021059	CAAA	2	8	1041699	1041706	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_021059	A	6	6	1041704	1041709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_021059	TTGA	2	8	1041729	1041736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021059	GTAT	2	8	1050297	1050304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021059	T	6	6	1053105	1053110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021059	T	6	6	1053117	1053122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021059	TTTTCT	2	12	1053262	1053273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4530	NC_021059	CTC	2	6	1055528	1055533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_021059	TCC	2	6	1056117	1056122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_021059	TAA	2	6	1056123	1056128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021059	A	7	7	1056127	1056133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021059	CCAT	2	8	1056141	1056148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_021059	AT	4	8	1056169	1056176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021059	GT	3	6	1056278	1056283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021059	ATTT	2	8	1056287	1056294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021059	AATT	2	8	1056295	1056302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021059	GTA	2	6	1056408	1056413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021059	TAA	2	6	1056453	1056458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021059	ATCA	2	8	1056489	1056496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_021059	AAC	2	6	1056506	1056511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_021059	GAA	2	6	1056515	1056520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021059	GAA	2	6	1056557	1056562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021059	AAC	2	6	1056601	1056606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_021059	TCC	2	6	1056772	1056777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_021059	ATT	2	6	1056789	1056794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021059	TA	4	8	1056795	1056802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021059	TATT	2	8	1056851	1056858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021059	ACA	3	9	1056872	1056880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_021059	AT	3	6	1056889	1056894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_021059	CTAT	2	8	1058232	1058239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_021059	AT	3	6	1058271	1058276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021059	ACTT	2	8	1058282	1058289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_021059	T	7	7	1058322	1058328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021059	TGAT	2	8	1058340	1058347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_021059	AAATA	2	10	1058397	1058406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021059	AT	3	6	1058481	1058486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021059	AT	3	6	1058512	1058517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_021059	GAT	2	6	1058564	1058569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021059	TA	3	6	1058596	1058601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021059	AAG	2	6	1059844	1059849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021059	ATA	2	6	1059854	1059859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_021059	GAATT	2	10	1060456	1060465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021059	TAA	2	6	1060514	1060519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021059	TAAA	2	8	1062571	1062578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_021059	GTAA	2	8	1062594	1062601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021059	T	6	6	1062621	1062626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_021059	TGT	2	6	1062652	1062657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021059	CTAA	2	8	1062660	1062667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4571	NC_021059	AAC	2	6	1062671	1062676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_021059	TAAT	2	8	1062705	1062712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_021059	GTTA	2	8	1062713	1062720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_021059	ATTTA	2	10	1062735	1062744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021059	ATG	2	6	1062757	1062762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_021059	TGT	2	6	1063176	1063181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_021059	A	7	7	1063186	1063192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_021059	TAA	2	6	1065663	1065668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_021059	TGA	2	6	1065694	1065699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_021059	ATTT	2	8	1066419	1066426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_021059	CGT	2	6	1066427	1066432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_021059	TTG	2	6	1066481	1066486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021059	A	6	6	1066564	1066569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021059	ACT	2	6	1066600	1066605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_021059	TCA	2	6	1066653	1066658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_021059	TA	3	6	1066659	1066664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_021059	CTA	2	6	1066674	1066679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_021059	GTG	2	6	1066687	1066692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021059	ACTTC	2	10	1066705	1066714	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4590	NC_021059	TAG	2	6	1066720	1066725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_021059	TCC	2	6	1068659	1068664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_021059	TGTT	2	8	1068671	1068678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021059	TA	3	6	1068715	1068720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_021059	ATTC	2	8	1068728	1068735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_021059	ATC	2	6	1068738	1068743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_021059	TAA	2	6	1068758	1068763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_021059	TAA	2	6	1068773	1068778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021059	TCA	2	6	1068785	1068790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_021059	A	6	6	1068804	1068809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021059	ATG	2	6	1068852	1068857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021059	ATA	2	6	1068862	1068867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_021059	TATT	2	8	1068923	1068930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021059	AAAT	2	8	1068932	1068939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021059	AAGA	2	8	1068962	1068969	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021059	AT	3	6	1069036	1069041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_021059	TGT	2	6	1069047	1069052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021059	CAT	2	6	1069088	1069093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_021059	CCTT	2	8	1069690	1069697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_021059	GTT	2	6	1069733	1069738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_021059	ACT	2	6	1069785	1069790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_021059	A	6	6	1069844	1069849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021059	ATTT	2	8	1069888	1069895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021059	ATC	2	6	1069896	1069901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_021059	ATTAT	2	10	1069914	1069923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021059	TGTAA	2	10	1069966	1069975	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021059	ATTTA	2	10	1070013	1070022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021059	ATA	2	6	1070678	1070683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_021059	AAC	2	6	1070696	1070701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_021059	TAT	2	6	1070714	1070719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_021059	T	7	7	1070727	1070733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021059	ATTT	2	8	1070771	1070778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021059	AAATG	2	10	1072985	1072994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021059	AGG	2	6	1073013	1073018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021059	T	6	6	1075784	1075789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021059	CATG	2	8	1075843	1075850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_021059	TTCG	2	8	1076173	1076180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4627	NC_021059	TAA	2	6	1076224	1076229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_021059	T	6	6	1076296	1076301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_021059	TAG	2	6	1080650	1080655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_021059	TAA	2	6	1080678	1080683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_021059	TGA	2	6	1081738	1081743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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