MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus LAL14/1

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021058	GTCAC	2	10	358	367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021058	TTAAA	2	10	5884	5893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021058	ATGTT	2	10	6113	6122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021058	TGTGA	2	10	6147	6156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021058	AAAAT	2	10	27153	27162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021058	TGGTG	2	10	39035	39044	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021058	TTTTA	2	10	39220	39229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021058	TAATT	2	10	61020	61029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021058	TTAAT	2	10	65348	65357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021058	GTTTT	2	10	72057	72066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021058	ATATG	2	10	82187	82196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021058	AATTA	2	10	92934	92943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021058	CAACT	2	10	100813	100822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021058	AAATA	2	10	103731	103740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021058	CATGC	2	10	106107	106116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021058	CACTA	2	10	106911	106920	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021058	AAATT	2	10	111258	111267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021058	GATTA	2	10	111716	111725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021058	AAATA	2	10	125304	125313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021058	GAGTC	2	10	133344	133353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021058	TTAAA	2	10	154000	154009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021058	TGAAA	2	10	164475	164484	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021058	GGAGA	2	10	164594	164603	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021058	GCTAA	2	10	175090	175099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021058	TAAGT	2	10	175113	175122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021058	GTGAT	2	10	181954	181963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021058	ATAAA	2	10	191067	191076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021058	ATAAA	2	10	243841	243850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021058	TCAAT	2	10	257942	257951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021058	ATGAT	2	10	274422	274431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021058	TATAT	2	10	276734	276743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021058	ATCAT	2	10	281097	281106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021058	CTAAT	2	10	281395	281404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021058	TGACT	2	10	287369	287378	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021058	AAATT	2	10	288895	288904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021058	TTTCA	2	10	291201	291210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021058	CATCC	2	10	291516	291525	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_021058	AAGTA	2	10	292124	292133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021058	CAACT	2	10	292939	292948	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021058	ATTGC	2	10	294515	294524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021058	TTAAA	2	10	296790	296799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021058	ATTAG	2	10	298134	298143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021058	TAAGA	2	10	303140	303149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021058	TTGAA	2	10	304887	304896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021058	ATCTA	2	10	305338	305347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021058	CCTTC	2	10	315869	315878	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_021058	GAGTA	2	10	317697	317706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021058	TAAGT	2	10	318851	318860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021058	TTTTA	2	10	332254	332263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021058	ATCTC	2	10	333084	333093	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021058	AATTT	2	10	333311	333320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021058	ACTAT	2	10	349731	349740	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021058	TAATA	2	10	353734	353743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021058	TAAAA	2	10	354643	354652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021058	TATCA	2	10	355586	355595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021058	TGAAC	2	10	356052	356061	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021058	TTATG	2	10	358775	358784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021058	AAGGG	2	10	358908	358917	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021058	TACCA	2	10	359025	359034	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021058	AACAC	2	10	359158	359167	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021058	ACGAA	2	10	359302	359311	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021058	AGTAC	2	10	360784	360793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021058	TATAA	2	10	365408	365417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021058	TCTTA	2	10	368770	368779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021058	ATGAC	2	10	368822	368831	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021058	GAGTA	2	10	370330	370339	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021058	TATAG	2	10	374784	374793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021058	ATGGC	2	10	377857	377866	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021058	ATCAA	2	10	381388	381397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021058	CTTAT	2	10	386557	386566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021058	TTTTC	2	10	392690	392699	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021058	AGAGG	2	10	393395	393404	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021058	GAGTA	2	10	395551	395560	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021058	AGAGA	2	10	398547	398556	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021058	TCATT	2	10	403095	403104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021058	TTGAA	2	10	403109	403118	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021058	CTAAA	2	10	404655	404664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021058	TGAGA	2	10	433409	433418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021058	TGTAT	2	10	442009	442018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021058	AATTA	2	10	446674	446683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021058	TTACA	2	10	448762	448771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021058	ATAAA	2	10	449840	449849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021058	ATTGC	2	10	450062	450071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021058	ACTAG	2	10	450400	450409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021058	TTAAT	2	10	451274	451283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021058	TTAAA	2	10	451410	451419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021058	CAAGG	2	10	451499	451508	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021058	ATTTT	2	10	454821	454830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021058	ATTAA	2	10	456916	456925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021058	CTTAT	2	10	457934	457943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021058	ATTTT	2	10	460838	460847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021058	TGTAT	2	10	462946	462955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021058	TTAAA	2	10	463042	463051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021058	CCCTC	2	10	463116	463125	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
95	NC_021058	TTATT	2	10	464624	464633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021058	GAGAA	2	10	478168	478177	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021058	TAGTT	2	10	487105	487114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021058	TTACA	2	10	487949	487958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021058	ATACG	2	10	491751	491760	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021058	TTTCA	2	10	492179	492188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021058	TCGTT	2	10	494267	494276	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021058	GGTAG	2	10	494345	494354	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021058	TCTCT	2	10	512839	512848	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021058	AAACT	2	10	514108	514117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021058	ATTTA	2	10	519949	519958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021058	GAGAT	2	10	529880	529889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021058	GGAGT	2	10	530227	530236	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021058	TTATG	2	10	531727	531736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021058	AAAAG	2	10	531877	531886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021058	GTGAA	2	10	535047	535056	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021058	GTTTA	2	10	541467	541476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021058	TGAAA	2	10	557006	557015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021058	TAATA	2	10	562052	562061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021058	AAGTA	2	10	562755	562764	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021058	TAATA	2	10	564759	564768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021058	TAAAA	2	10	571585	571594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021058	TTTGT	2	10	585425	585434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021058	ACCCC	3	15	585932	585946	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_021058	CTAAC	2	10	594875	594884	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021058	AATAT	2	10	599521	599530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021058	TTTCT	2	10	605960	605969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021058	TTAGA	2	10	608879	608888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021058	CAACT	2	10	613128	613137	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_021058	TGAAC	2	10	617100	617109	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021058	ACTAC	2	10	618616	618625	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021058	TAAAA	2	10	635043	635052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021058	TTTCA	2	10	635071	635080	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021058	TTATA	2	10	644107	644116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021058	AAATT	2	10	646098	646107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021058	ATTTT	2	10	661759	661768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021058	TAATC	2	10	694785	694794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021058	AGATA	2	10	698581	698590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021058	TTCAA	2	10	701851	701860	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021058	AACGC	2	10	702107	702116	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_021058	ATTTA	2	10	702158	702167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021058	AAAGA	2	10	705011	705020	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021058	TTTCA	2	10	706684	706693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021058	AATTA	2	10	721911	721920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021058	TCTAA	2	10	727965	727974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021058	AAAGT	2	10	733244	733253	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021058	TAAAA	2	10	742613	742622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021058	TCTAA	2	10	745565	745574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021058	GTATG	2	10	745588	745597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021058	GTGAC	2	10	745915	745924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021058	ACTAC	2	10	746304	746313	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021058	AAAGT	2	10	748006	748015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021058	TAAAA	2	10	762213	762222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_021058	TTTTA	2	10	1719144	1719153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021058	GGAGA	2	10	1736209	1736218	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_021058	ACTTT	2	10	2178005	2178014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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325	NC_021058	TCATT	2	10	2206831	2206840	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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327	NC_021058	ATAAA	2	10	2242673	2242682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_021058	TAATT	2	10	2264280	2264289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_021058	AATAA	3	15	2265881	2265895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_021058	CTTTT	2	10	2269177	2269186	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
335	NC_021058	AAGTA	2	10	2283387	2283396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
336	NC_021058	CTTTA	2	10	2283969	2283978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
337	NC_021058	AGTTG	2	10	2304217	2304226	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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339	NC_021058	TTATA	2	10	2306347	2306356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
340	NC_021058	ATTTA	2	10	2308119	2308128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_021058	ATATT	2	10	2308289	2308298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_021058	ATATA	2	10	2308437	2308446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_021058	CAACT	2	10	2311510	2311519	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
344	NC_021058	CCTTA	2	10	2312296	2312305	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
345	NC_021058	TTTTA	2	10	2330499	2330508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_021058	TTAAC	2	10	2330798	2330807	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
347	NC_021058	ATATT	2	10	2348621	2348630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_021058	TTTAG	2	10	2391166	2391175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
349	NC_021058	TTTAT	2	10	2414461	2414470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.