MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus LAL14/1

Total Repeats: 8460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021058	TGA	2	6	2310127	2310132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021058	GAAA	2	8	2310167	2310174	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_021058	CT	4	8	2310201	2310208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_021058	ATG	2	6	2310265	2310270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_021058	TAA	2	6	2310321	2310326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021058	CTT	2	6	2310340	2310345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_021058	TAAC	2	8	2310356	2310363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_021058	ATA	2	6	2310369	2310374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021058	ATT	2	6	2310417	2310422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021058	T	6	6	2310421	2310426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021058	TTAA	2	8	2310470	2310477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_021058	ATT	2	6	2310503	2310508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_021058	CAT	2	6	2311122	2311127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_021058	CT	3	6	2311160	2311165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_021058	ATC	2	6	2311266	2311271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_021058	TA	3	6	2311396	2311401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_021058	AAGT	2	8	2311439	2311446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021058	TCA	2	6	2311454	2311459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_021058	CAA	2	6	2311470	2311475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_021058	CAC	2	6	2311476	2311481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_021058	CAACT	2	10	2311510	2311519	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8022	NC_021058	CCA	2	6	2311525	2311530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_021058	CTCATA	2	12	2311591	2311602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_021058	CCT	2	6	2311621	2311626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_021058	CTT	2	6	2311634	2311639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_021058	AAG	2	6	2311662	2311667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_021058	AC	3	6	2311685	2311690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_021058	AAC	2	6	2311710	2311715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_021058	ATG	2	6	2311716	2311721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021058	ACG	2	6	2311810	2311815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_021058	ACA	2	6	2311831	2311836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_021058	TCAT	2	8	2311840	2311847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8033	NC_021058	TAT	2	6	2311864	2311869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_021058	CCT	2	6	2311872	2311877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_021058	TA	3	6	2311911	2311916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021058	ACC	2	6	2311935	2311940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_021058	TC	4	8	2312033	2312040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_021058	GAG	2	6	2312078	2312083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021058	GCT	3	9	2312093	2312101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_021058	CAT	2	6	2312103	2312108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_021058	TCC	2	6	2312145	2312150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_021058	GAA	2	6	2312227	2312232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_021058	TAA	2	6	2312273	2312278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_021058	TTAG	2	8	2312288	2312295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_021058	CCTTA	2	10	2312296	2312305	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8046	NC_021058	CCT	2	6	2312362	2312367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_021058	ATA	2	6	2312561	2312566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021058	TAT	2	6	2312591	2312596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_021058	TAA	2	6	2312611	2312616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_021058	AAT	2	6	2312632	2312637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021058	TTG	2	6	2312657	2312662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021058	AAT	3	9	2317457	2317465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021058	ATG	2	6	2317477	2317482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_021058	AAT	2	6	2317502	2317507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021058	TA	3	6	2320528	2320533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_021058	TCT	2	6	2320560	2320565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_021058	TAT	2	6	2320597	2320602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_021058	A	6	6	2321486	2321491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_021058	T	6	6	2321501	2321506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_021058	ATT	2	6	2323521	2323526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_021058	TTA	2	6	2323590	2323595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021058	TAA	3	9	2323600	2323608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021058	AT	3	6	2325738	2325743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021058	T	6	6	2325773	2325778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021058	AAT	2	6	2327744	2327749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_021058	AATA	2	8	2327760	2327767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_021058	TA	3	6	2327793	2327798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_021058	ATT	2	6	2327806	2327811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_021058	AT	3	6	2327822	2327827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_021058	AT	3	6	2327830	2327835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021058	TA	3	6	2327846	2327851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_021058	ATC	2	6	2327928	2327933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_021058	TAA	2	6	2327954	2327959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_021058	CAAA	2	8	2327970	2327977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_021058	ATT	2	6	2327985	2327990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_021058	TTAC	2	8	2330459	2330466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8077	NC_021058	A	6	6	2330493	2330498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_021058	TTTTA	2	10	2330499	2330508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_021058	TTTA	2	8	2330533	2330540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_021058	GA	3	6	2330584	2330589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_021058	TAT	2	6	2330593	2330598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_021058	TAAA	2	8	2330613	2330620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_021058	ATATTT	2	12	2330679	2330690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_021058	TAT	2	6	2330704	2330709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_021058	ATA	2	6	2330731	2330736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_021058	TTAAC	2	10	2330798	2330807	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8087	NC_021058	TTA	2	6	2330824	2330829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_021058	GTGA	2	8	2334602	2334609	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_021058	GAAT	2	8	2334610	2334617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_021058	TGG	2	6	2334724	2334729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_021058	ATT	2	6	2334952	2334957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_021058	T	6	6	2334956	2334961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_021058	AT	3	6	2334986	2334991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_021058	TAG	2	6	2335012	2335017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_021058	TA	3	6	2335042	2335047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021058	TA	4	8	2335109	2335116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_021058	AGA	2	6	2336359	2336364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_021058	TAA	2	6	2336377	2336382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_021058	AAT	2	6	2336387	2336392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_021058	AAG	2	6	2338818	2338823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_021058	TA	3	6	2338863	2338868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_021058	AT	3	6	2339330	2339335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_021058	TAG	2	6	2339341	2339346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_021058	TAT	2	6	2339361	2339366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_021058	CAA	2	6	2339400	2339405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_021058	AGAA	2	8	2339436	2339443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_021058	ATT	2	6	2339477	2339482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_021058	ACC	2	6	2341240	2341245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_021058	TTAA	2	8	2341725	2341732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_021058	TATATG	2	12	2341762	2341773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021058	ATT	2	6	2341813	2341818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_021058	TAC	2	6	2344052	2344057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_021058	TTA	2	6	2344059	2344064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_021058	A	6	6	2344113	2344118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_021058	ATAA	2	8	2344938	2344945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021058	ATT	2	6	2344959	2344964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_021058	TTA	2	6	2344968	2344973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021058	TTAT	2	8	2344989	2344996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021058	A	6	6	2345010	2345015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021058	AG	3	6	2345022	2345027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_021058	ATATT	2	10	2348621	2348630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021058	TATT	2	8	2348642	2348649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_021058	A	6	6	2348659	2348664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_021058	TAGG	2	8	2348669	2348676	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_021058	TAA	2	6	2348686	2348691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_021058	AT	4	8	2348789	2348796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021058	T	6	6	2350277	2350282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_021058	TAAA	2	8	2350296	2350303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_021058	AGT	2	6	2350304	2350309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_021058	A	7	7	2351475	2351481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.