MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 1233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021028	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021028	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021028	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021028	GCTT	2	8	15415	15422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021028	CCTG	2	8	15463	15470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021028	GTGA	2	8	15743	15750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021028	AGCG	2	8	15914	15921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021028	AGCC	2	8	16795	16802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021028	GTAA	2	8	17217	17224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021028	GCGA	2	8	17373	17380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021028	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021028	CTAA	2	8	18593	18600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021028	GTCT	2	8	18618	18625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021028	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021028	CTTT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021028	ATGT	2	8	22200	22207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021028	AAGA	2	8	32949	32956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021028	AACA	2	8	33869	33876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021028	CAAA	2	8	35887	35894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021028	ATGA	2	8	38061	38068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021028	ATCT	2	8	41379	41386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021028	GAAA	2	8	47930	47937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021028	AATA	2	8	58431	58438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021028	AGAA	2	8	61400	61407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021028	ACGG	2	8	61473	61480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021028	TTGA	2	8	62299	62306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021028	AATA	2	8	63402	63409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021028	TTCT	2	8	63776	63783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021028	AATT	2	8	64804	64811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021028	CTAT	2	8	64908	64915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021028	TAGA	2	8	68256	68263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021028	TAGA	2	8	68301	68308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021028	GAAT	2	8	73217	73224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021028	TGCT	2	8	73512	73519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021028	ATTT	2	8	74042	74049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021028	GGGA	2	8	74159	74166	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021028	GAAG	2	8	74182	74189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021028	TGAC	2	8	74296	74303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021028	ATAG	2	8	82748	82755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021028	TTTC	2	8	88055	88062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021028	TAAT	2	8	98297	98304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021028	GTTT	2	8	104296	104303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021028	TGCT	2	8	107618	107625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021028	GAAG	2	8	111260	111267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021028	TAGC	2	8	111661	111668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021028	GATG	2	8	111853	111860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021028	AAGG	2	8	111887	111894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021028	AGTC	2	8	111924	111931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021028	TAAT	2	8	112519	112526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021028	AAAG	2	8	112616	112623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021028	AAAT	2	8	115225	115232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021028	CTTT	2	8	115286	115293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021028	GAAT	2	8	117160	117167	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021028	AATT	2	8	118326	118333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021028	TTGA	2	8	119031	119038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021028	TTTG	2	8	119228	119235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021028	ATTC	2	8	122847	122854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021028	AAAT	2	8	123005	123012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021028	ATAA	2	8	123048	123055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021028	AGCT	2	8	124168	124175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021028	GTTT	2	8	124291	124298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021028	TGTA	2	8	124327	124334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021028	TTAG	2	8	126475	126482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021028	ACAT	2	8	128383	128390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021028	AAAG	2	8	128401	128408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021028	TCCA	2	8	132928	132935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021028	AGAA	2	8	135519	135526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021028	AAAT	2	8	137316	137323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021028	GAAG	2	8	138245	138252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021028	AAAT	2	8	138329	138336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021028	GTTC	2	8	141424	141431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021028	TGAC	2	8	141441	141448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021028	AAAG	2	8	142521	142528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021028	CTTT	2	8	143189	143196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021028	AGCC	2	8	144799	144806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021028	TAGA	2	8	144886	144893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021028	GTAG	2	8	145247	145254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021028	GTAT	2	8	145305	145312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021028	AGGA	2	8	145638	145645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021028	AGCC	2	8	146660	146667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021028	TAGA	2	8	146747	146754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021028	AAAT	2	8	147469	147476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021028	GTAT	2	8	147586	147593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021028	TGAA	2	8	152806	152813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021028	TTTA	2	8	152827	152834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021028	AAGC	2	8	152912	152919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021028	TTAT	2	8	154553	154560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021028	ATAA	2	8	154587	154594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021028	GTAT	2	8	155762	155769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021028	TTTA	2	8	155814	155821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021028	ATTT	2	8	158984	158991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021028	GAAG	2	8	160044	160051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021028	TTAT	2	8	162876	162883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021028	TGAA	2	8	162894	162901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021028	AAAG	2	8	166878	166885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021028	TTGC	2	8	169319	169326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021028	TCAA	2	8	172711	172718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021028	TAGG	2	8	174231	174238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021028	GTAG	2	8	174329	174336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021028	AAGC	2	8	174350	174357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021028	CTGC	2	8	174518	174525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021028	AAAT	2	8	175067	175074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021028	ATGG	2	8	175469	175476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021028	AATA	2	8	175615	175622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021028	GAAA	2	8	175842	175849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021028	GAAG	2	8	176073	176080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021028	AGTA	2	8	176272	176279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021028	TATC	2	8	176413	176420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021028	GGGA	2	8	178529	178536	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021028	ATTT	2	8	178914	178921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021028	TTTA	2	8	179113	179120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021028	ATAA	2	8	180085	180092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021028	CAAA	2	8	180353	180360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021028	GAAG	2	8	180478	180485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021028	GTTT	2	8	180685	180692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021028	AAAT	2	8	180791	180798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021028	TAAT	2	8	180953	180960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021028	ATTG	2	8	180966	180973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021028	GGCT	2	8	181460	181467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021028	CAGA	2	8	181613	181620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021028	CCAT	2	8	181914	181921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021028	TAAA	2	8	181926	181933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021028	TCTT	2	8	182280	182287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021028	CAAA	2	8	182288	182295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021028	TTCC	2	8	183211	183218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021028	TGCT	2	8	183225	183232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021028	GAAA	2	8	183422	183429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021028	AATT	2	8	185077	185084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021028	GAAA	2	8	185393	185400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021028	GCAG	2	8	185420	185427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021028	AGAT	2	8	186427	186434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021028	GGTG	2	8	187361	187368	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021028	CAAA	2	8	187436	187443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021028	TTTC	2	8	198822	198829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021028	TTCT	2	8	200035	200042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021028	TAAT	2	8	200063	200070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021028	AGCT	2	8	209382	209389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021028	AGAA	2	8	211236	211243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021028	GGTA	2	8	215257	215264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021028	AGAA	2	8	215715	215722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021028	AAAT	2	8	216307	216314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021028	ATTG	2	8	217673	217680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021028	AGAA	2	8	221201	221208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021028	CTAA	2	8	221227	221234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021028	AGAA	2	8	223032	223039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021028	GCAT	2	8	223054	223061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021028	GTTT	2	8	235071	235078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021028	ACAA	2	8	235079	235086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021028	ACAA	2	8	240048	240055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021028	TAAA	2	8	244161	244168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021028	TTTA	2	8	244235	244242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021028	TCAT	2	8	244310	244317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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