MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 8842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021028	TCA	2	6	1154297	1154302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021028	GAT	2	6	1154320	1154325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021028	CAC	2	6	1154370	1154375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_021028	TTC	2	6	1154414	1154419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021028	ATT	2	6	1154456	1154461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021028	TAT	2	6	1155832	1155837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021028	ACT	2	6	1155882	1155887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_021028	AGT	2	6	1156322	1156327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021028	TCT	3	9	1156391	1156399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_021028	ATG	2	6	1156413	1156418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021028	CTC	2	6	1156469	1156474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_021028	TAA	2	6	1158583	1158588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021028	T	6	6	1158609	1158614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021028	CTA	2	6	1158634	1158639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_021028	AGA	2	6	1158644	1158649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021028	AGA	2	6	1158692	1158697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021028	TAG	2	6	1159828	1159833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021028	ATA	2	6	1159874	1159879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021028	TC	3	6	1159904	1159909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_021028	AGCTG	2	10	1159984	1159993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5021	NC_021028	ATC	3	9	1160017	1160025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021028	TAA	2	6	1160045	1160050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021028	ATTTT	2	10	1160053	1160062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021028	TTCT	2	8	1160083	1160090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_021028	GAA	2	6	1160118	1160123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021028	ATCA	2	8	1160186	1160193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_021028	GCT	2	6	1160259	1160264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021028	AATT	2	8	1160279	1160286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021028	GTT	2	6	1160303	1160308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021028	TAT	2	6	1160498	1160503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021028	A	6	6	1160507	1160512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021028	CTCTA	2	10	1160515	1160524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5033	NC_021028	A	6	6	1160538	1160543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021028	TAT	2	6	1160584	1160589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021028	T	6	6	1160623	1160628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021028	ATCT	2	8	1161529	1161536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_021028	A	6	6	1161543	1161548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021028	A	6	6	1161551	1161556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021028	A	7	7	1165800	1165806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021028	TC	3	6	1165812	1165817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_021028	TAT	2	6	1165818	1165823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021028	TCC	2	6	1165859	1165864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_021028	TAT	2	6	1165894	1165899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021028	TAA	2	6	1165952	1165957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021028	AAT	2	6	1165986	1165991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021028	TTA	2	6	1166069	1166074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021028	ACT	2	6	1169243	1169248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_021028	TAG	2	6	1169278	1169283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021028	CAT	2	6	1169315	1169320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_021028	ATG	2	6	1169346	1169351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021028	T	6	6	1169372	1169377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021028	TAG	2	6	1169381	1169386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021028	AATT	2	8	1169425	1169432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021028	GAA	2	6	1172728	1172733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021028	CCGT	2	8	1172767	1172774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_021028	TTCAG	2	10	1172783	1172792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5057	NC_021028	GATT	2	8	1172874	1172881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021028	AAGG	2	8	1172893	1172900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021028	TCCG	2	8	1172939	1172946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_021028	CGA	2	6	1172968	1172973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_021028	AAAAG	2	10	1175593	1175602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021028	CA	3	6	1175652	1175657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_021028	TGCC	2	8	1175693	1175700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_021028	TCC	2	6	1176966	1176971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_021028	CT	3	6	1176983	1176988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_021028	GTTTT	2	10	1177071	1177080	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021028	T	6	6	1177077	1177082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021028	CTATA	2	10	1177087	1177096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5069	NC_021028	AGG	2	6	1177118	1177123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021028	TATAA	2	10	1177494	1177503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021028	AAC	2	6	1177536	1177541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021028	TTTA	2	8	1177564	1177571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021028	TG	3	6	1177596	1177601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021028	T	7	7	1177637	1177643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021028	CTA	2	6	1177661	1177666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021028	AAG	2	6	1179297	1179302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021028	ATA	2	6	1179326	1179331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021028	T	6	6	1179378	1179383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021028	GAT	2	6	1180925	1180930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021028	AAG	2	6	1180935	1180940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021028	T	6	6	1181665	1181670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021028	A	6	6	1181723	1181728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021028	T	7	7	1181744	1181750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021028	AAT	2	6	1181877	1181882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021028	ATA	2	6	1183254	1183259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021028	ATT	2	6	1183276	1183281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021028	A	6	6	1183288	1183293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021028	TCA	2	6	1183363	1183368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_021028	TTC	2	6	1184969	1184974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_021028	TAT	2	6	1185317	1185322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021028	A	6	6	1185326	1185331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021028	CTA	2	6	1185805	1185810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021028	ACT	2	6	1188053	1188058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_021028	AGG	2	6	1188063	1188068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021028	GTT	2	6	1188071	1188076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021028	CTG	2	6	1188111	1188116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021028	T	6	6	1188127	1188132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021028	CA	4	8	1188558	1188565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_021028	A	6	6	1188590	1188595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021028	TCC	2	6	1189573	1189578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_021028	ATT	2	6	1189588	1189593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021028	TGAT	2	8	1189653	1189660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021028	TCC	2	6	1190130	1190135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_021028	TAAAAA	2	12	1190176	1190187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021028	AATGA	2	10	1190200	1190209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021028	T	6	6	1191529	1191534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021028	CTG	2	6	1191550	1191555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021028	CTA	2	6	1191596	1191601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_021028	AGGA	2	8	1191605	1191612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021028	CCT	2	6	1191830	1191835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_021028	GT	3	6	1191958	1191963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021028	GGA	2	6	1191966	1191971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021028	AT	3	6	1192197	1192202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021028	ACC	2	6	1192214	1192219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_021028	GA	3	6	1192235	1192240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021028	CTC	2	6	1192253	1192258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_021028	T	7	7	1192262	1192268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021028	GTT	2	6	1192284	1192289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021028	TAG	2	6	1192348	1192353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021028	TCT	2	6	1192524	1192529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_021028	TAT	2	6	1192549	1192554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021028	TCC	2	6	1192594	1192599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_021028	TTTTC	2	10	1192676	1192685	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5124	NC_021028	CATAC	2	10	1192692	1192701	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5125	NC_021028	CGTT	2	8	1192742	1192749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_021028	T	7	7	1192748	1192754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021028	A	8	8	1192765	1192772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021028	T	6	6	1192811	1192816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021028	A	8	8	1192827	1192834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021028	TAA	2	6	1192855	1192860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021028	ATTT	2	8	1194234	1194241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_021028	AATT	2	8	1194371	1194378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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