MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 8842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021028	TTTAT	2	10	1024188	1024197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_021028	TAC	2	6	1024258	1024263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_021028	A	6	6	1027052	1027057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_021028	GAG	2	6	1027102	1027107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_021028	AAT	2	6	1028312	1028317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_021028	T	6	6	1028331	1028336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021028	GAG	2	6	1028354	1028359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_021028	GTTT	2	8	1028361	1028368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_021028	TTA	2	6	1030414	1030419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_021028	ATCT	2	8	1032741	1032748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_021028	AGAC	2	8	1032759	1032766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_021028	A	6	6	1032791	1032796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021028	CATT	2	8	1032799	1032806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_021028	AGAA	2	8	1032821	1032828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021028	CCT	2	6	1032885	1032890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_021028	TAT	2	6	1032926	1032931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021028	TAG	2	6	1032976	1032981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021028	CCAA	2	8	1033044	1033051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_021028	T	7	7	1033061	1033067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021028	GAT	2	6	1033079	1033084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021028	TTC	2	6	1033108	1033113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_021028	T	8	8	1033146	1033153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_021028	AAT	2	6	1033193	1033198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_021028	AT	3	6	1033247	1033252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_021028	AGG	2	6	1033266	1033271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021028	T	7	7	1034739	1034745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021028	ATA	2	6	1034754	1034759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021028	A	6	6	1034767	1034772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_021028	TAT	2	6	1034787	1034792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021028	TTA	2	6	1034876	1034881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_021028	TA	4	8	1034893	1034900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_021028	ATTTC	2	10	1034988	1034997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4533	NC_021028	TAG	2	6	1035002	1035007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021028	AAAG	2	8	1035010	1035017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021028	T	6	6	1035030	1035035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021028	A	6	6	1035037	1035042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021028	TTG	2	6	1035074	1035079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_021028	AAT	2	6	1035091	1035096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021028	AAG	2	6	1035099	1035104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021028	TCT	2	6	1035123	1035128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_021028	GTA	2	6	1035137	1035142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021028	TAA	2	6	1035143	1035148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021028	AAATG	2	10	1037107	1037116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021028	TGG	2	6	1037134	1037139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021028	ACTC	2	8	1037161	1037168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_021028	TGG	2	6	1037197	1037202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_021028	CAA	2	6	1037296	1037301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_021028	TTC	2	6	1037358	1037363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_021028	ATG	2	6	1037501	1037506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021028	ATA	2	6	1037528	1037533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021028	AAGC	2	8	1037576	1037583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_021028	TTG	2	6	1037621	1037626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_021028	GAA	2	6	1037632	1037637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021028	GCT	2	6	1037719	1037724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_021028	CAC	2	6	1037942	1037947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_021028	GC	3	6	1038044	1038049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_021028	ATT	2	6	1038133	1038138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021028	ATT	2	6	1038151	1038156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021028	AGT	2	6	1038213	1038218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_021028	ATG	2	6	1040816	1040821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021028	AG	3	6	1040847	1040852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021028	TG	3	6	1040880	1040885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021028	AGA	2	6	1040914	1040919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_021028	TGAT	2	8	1040922	1040929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021028	GA	3	6	1040938	1040943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_021028	GAG	2	6	1040991	1040996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_021028	TTG	2	6	1041035	1041040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021028	TGG	2	6	1041157	1041162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_021028	GA	3	6	1041180	1041185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021028	AAG	2	6	1041238	1041243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021028	A	6	6	1041291	1041296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_021028	GAAA	2	8	1041316	1041323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_021028	AAAG	2	8	1041336	1041343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_021028	AAT	2	6	1041369	1041374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_021028	CGG	2	6	1041391	1041396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_021028	A	6	6	1041432	1041437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_021028	CAT	2	6	1041447	1041452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4579	NC_021028	TTC	2	6	1041478	1041483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_021028	TTGA	2	8	1041486	1041493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_021028	AAT	2	6	1041597	1041602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_021028	AAG	2	6	1041729	1041734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021028	TTGG	2	8	1041785	1041792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_021028	TGG	2	6	1041907	1041912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_021028	ATG	2	6	1041924	1041929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4587	NC_021028	TTA	2	6	1042010	1042015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_021028	TCA	2	6	1042108	1042113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_021028	AGGAGC	2	12	1042231	1042242	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4590	NC_021028	TGG	2	6	1042258	1042263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_021028	TG	3	6	1042266	1042271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021028	TAA	2	6	1042330	1042335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021028	GTT	3	9	1042358	1042366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_021028	GAAG	2	8	1042370	1042377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_021028	AGA	2	6	1042546	1042551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_021028	TTA	2	6	1042607	1042612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_021028	AAAG	2	8	1043112	1043119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021028	T	6	6	1043163	1043168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_021028	AGG	2	6	1043177	1043182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021028	TAT	2	6	1043193	1043198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021028	A	6	6	1043207	1043212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_021028	AAC	2	6	1044602	1044607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_021028	A	6	6	1044660	1044665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_021028	A	6	6	1044681	1044686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_021028	ATTG	2	8	1044712	1044719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_021028	AGT	2	6	1044760	1044765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_021028	ATTTT	2	10	1044815	1044824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_021028	GTG	2	6	1044842	1044847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_021028	T	6	6	1044886	1044891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_021028	CGTT	2	8	1044896	1044903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_021028	GA	3	6	1044913	1044918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_021028	GTT	2	6	1044998	1045003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_021028	TA	3	6	1045018	1045023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_021028	ACAAGA	2	12	1045034	1045045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4615	NC_021028	GGA	2	6	1045149	1045154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021028	CA	3	6	1045183	1045188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_021028	TAG	2	6	1045237	1045242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_021028	ATTTC	2	10	1045326	1045335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4619	NC_021028	TAA	2	6	1045340	1045345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_021028	A	6	6	1045395	1045400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021028	TCA	2	6	1045409	1045414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_021028	TAG	2	6	1045527	1045532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021028	T	7	7	1045542	1045548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021028	TCTATC	2	12	1045662	1045673	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_021028	TGG	2	6	1045702	1045707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021028	TAC	2	6	1045793	1045798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_021028	AG	3	6	1045815	1045820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_021028	T	6	6	1045824	1045829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_021028	AT	3	6	1045929	1045934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_021028	CTT	2	6	1045955	1045960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_021028	ACA	2	6	1046040	1046045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_021028	T	6	6	1046107	1046112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_021028	TCTA	2	8	1046142	1046149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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