MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 1196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021026	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021026	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021026	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021026	GCTT	2	8	15415	15422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021026	CCTG	2	8	15463	15470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021026	GTGA	2	8	15743	15750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021026	AGCG	2	8	15914	15921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021026	AGCC	2	8	16795	16802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021026	GTAA	2	8	17217	17224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021026	GCGA	2	8	17373	17380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021026	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021026	CTAA	2	8	18593	18600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021026	GTCT	2	8	18618	18625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021026	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021026	CTTT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021026	ATGT	2	8	22200	22207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021026	AACA	2	8	33869	33876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021026	CAAA	2	8	35887	35894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021026	ATGA	2	8	38061	38068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021026	ATCT	2	8	41379	41386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021026	AATA	2	8	58431	58438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021026	AGAA	2	8	61400	61407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021026	ACGG	2	8	61473	61480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021026	TTGA	2	8	62299	62306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021026	AATA	2	8	63402	63409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021026	TTCT	2	8	63776	63783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021026	AATT	2	8	64804	64811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021026	CTAT	2	8	64908	64915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021026	TAGA	2	8	68256	68263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021026	TAGA	2	8	68301	68308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021026	TAGA	2	8	68346	68353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021026	GAAT	2	8	73263	73270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021026	TGCT	2	8	73558	73565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021026	ATTT	2	8	74088	74095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021026	GGGA	2	8	74205	74212	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021026	GAAG	2	8	74228	74235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021026	TGAC	2	8	74342	74349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021026	ATAG	2	8	82794	82801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021026	TTTC	2	8	88101	88108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021026	TAAT	2	8	98343	98350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021026	GTTT	2	8	104342	104349	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021026	TGCT	2	8	107664	107671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021026	GAAG	2	8	111306	111313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021026	TAGC	2	8	111707	111714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021026	GATG	2	8	111899	111906	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021026	AAGG	2	8	111933	111940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021026	AGTC	2	8	111970	111977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021026	TAAT	2	8	112565	112572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021026	AAAG	2	8	112662	112669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021026	AAAT	2	8	115271	115278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021026	CTTT	2	8	115332	115339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021026	GAAT	2	8	117206	117213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021026	AATT	2	8	118372	118379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021026	TTGA	2	8	119077	119084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021026	TTTG	2	8	119274	119281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021026	ATTC	2	8	122893	122900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021026	AAAT	2	8	123051	123058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021026	ATAA	2	8	123094	123101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021026	AGCT	2	8	124214	124221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021026	GTTT	2	8	124337	124344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021026	TGTA	2	8	124373	124380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021026	TTAG	2	8	126521	126528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021026	ACAT	2	8	128429	128436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021026	AAAG	2	8	128447	128454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021026	TCCA	2	8	132974	132981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021026	AGAA	2	8	135565	135572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021026	AAAT	2	8	137184	137191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021026	GTAT	2	8	137301	137308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021026	TGAA	2	8	142521	142528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021026	TTTA	2	8	142542	142549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021026	AAGC	2	8	142627	142634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021026	TTAT	2	8	144268	144275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021026	ATAA	2	8	144302	144309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021026	GTAT	2	8	145477	145484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021026	TTTA	2	8	145529	145536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021026	ATTT	2	8	148699	148706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021026	GAAG	2	8	149759	149766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021026	TTAT	2	8	152453	152460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021026	TGAA	2	8	152471	152478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021026	AAAG	2	8	156455	156462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021026	TTGC	2	8	158896	158903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021026	TCAA	2	8	162288	162295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021026	TAGG	2	8	163808	163815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021026	GTAG	2	8	163906	163913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021026	AAGC	2	8	163927	163934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021026	CTGC	2	8	164095	164102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021026	AAAT	2	8	164644	164651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021026	ATGG	2	8	165046	165053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021026	AATA	2	8	165192	165199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021026	GAAA	2	8	165419	165426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021026	GAAG	2	8	165650	165657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021026	AGTA	2	8	165849	165856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021026	TATC	2	8	165990	165997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021026	GGGA	2	8	168106	168113	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021026	ATTT	2	8	168491	168498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021026	TTTA	2	8	168690	168697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021026	ATAA	2	8	169662	169669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021026	CAAA	2	8	169930	169937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021026	GAAG	2	8	170055	170062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021026	GTTT	2	8	170262	170269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021026	AAAT	2	8	170368	170375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021026	TAAT	2	8	170530	170537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021026	ATTG	2	8	170543	170550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021026	GGCT	2	8	171037	171044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021026	CAGA	2	8	171190	171197	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021026	CCAT	2	8	171491	171498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021026	TAAA	2	8	171503	171510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021026	TCTT	2	8	171857	171864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021026	CAAA	2	8	171865	171872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021026	TTCC	2	8	172788	172795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021026	TGCT	2	8	172802	172809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021026	GAAA	2	8	172999	173006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021026	AATT	2	8	174654	174661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021026	GAAA	2	8	174970	174977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021026	GCAG	2	8	174997	175004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021026	AGAT	2	8	176004	176011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021026	GGTG	2	8	176938	176945	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021026	CAAA	2	8	177013	177020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021026	TTTC	2	8	188399	188406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021026	TTCT	2	8	189612	189619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021026	TAAT	2	8	189640	189647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021026	AGCT	2	8	198959	198966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021026	AGAA	2	8	200813	200820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021026	GGTA	2	8	204834	204841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021026	AGAA	2	8	205292	205299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021026	AAAT	2	8	205884	205891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021026	ATTG	2	8	207250	207257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021026	AGAA	2	8	210778	210785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021026	CTAA	2	8	210804	210811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021026	AGAA	2	8	212609	212616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021026	GCAT	2	8	212631	212638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021026	GTTT	2	8	224648	224655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021026	ACAA	2	8	224656	224663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021026	ACAA	2	8	229625	229632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021026	TAAA	2	8	233739	233746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021026	TTTA	2	8	233813	233820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021026	TCAT	2	8	233888	233895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021026	CTTG	2	8	234629	234636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021026	AAAG	2	8	236214	236221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021026	AAGA	2	8	236313	236320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021026	AGTG	2	8	237547	237554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021026	AATT	2	8	238710	238717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021026	GAAA	2	8	239888	239895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021026	ACGA	2	8	239903	239910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021026	GAAA	2	8	244003	244010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021026	GAAA	2	8	244024	244031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021026	AATT	2	8	248378	248385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021026	TATT	2	8	248477	248484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021026	ATTA	2	8	248493	248500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021026	ATTT	2	8	251233	251240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021026	ACCT	2	8	251603	251610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021026	TTTA	2	8	252036	252043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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