MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021026	AGT	2	6	236198	236203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021026	AAAG	2	8	236214	236221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021026	AAGA	2	8	236313	236320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021026	GAA	2	6	236322	236327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021026	AGG	2	6	236330	236335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021026	TGA	2	6	237525	237530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021026	CATAAT	2	12	237531	237542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1008	NC_021026	AGTG	2	8	237547	237554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021026	TAG	2	6	237618	237623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021026	CTT	2	6	237648	237653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021026	GA	3	6	237654	237659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021026	TAA	2	6	237660	237665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021026	T	6	6	237703	237708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021026	AGC	2	6	237715	237720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021026	CTT	2	6	237744	237749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021026	CTG	2	6	237795	237800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021026	AG	3	6	237811	237816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021026	ATC	2	6	238030	238035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021026	ACC	2	6	238042	238047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_021026	AGA	2	6	238087	238092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021026	CAG	2	6	238104	238109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021026	ACC	2	6	238327	238332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_021026	CTT	2	6	238356	238361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021026	T	6	6	238375	238380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021026	TTC	2	6	238432	238437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021026	ACC	2	6	238498	238503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_021026	AGA	2	6	238543	238548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021026	AGC	2	6	238552	238557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021026	ATA	2	6	238558	238563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021026	ATG	2	6	238580	238585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021026	ATTCT	2	10	238648	238657	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_021026	AATT	2	8	238710	238717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021026	AGA	2	6	238787	238792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021026	TCT	2	6	239003	239008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021026	TA	3	6	239019	239024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021026	TCC	2	6	239853	239858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_021026	CTATC	2	10	239870	239879	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_021026	GAAA	2	8	239888	239895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021026	ACGA	2	8	239903	239910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_021026	TGT	2	6	239921	239926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021026	T	6	6	239926	239931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021026	T	6	6	241733	241738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021026	TA	3	6	241766	241771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021026	TGT	2	6	241789	241794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021026	TAT	2	6	241812	241817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021026	A	6	6	241865	241870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021026	GAG	2	6	241890	241895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021026	TAT	2	6	242231	242236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021026	TTA	2	6	242242	242247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021026	AGG	2	6	242254	242259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021026	TG	3	6	243899	243904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021026	CA	3	6	243918	243923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_021026	AG	3	6	243939	243944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021026	TAT	2	6	243991	243996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021026	GAAA	2	8	244003	244010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021026	GAAA	2	8	244024	244031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021026	ACT	2	6	248283	248288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021026	AGA	2	6	248335	248340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021026	AATT	2	8	248378	248385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021026	CTA	2	6	248431	248436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021026	TTC	2	6	248441	248446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021026	TATT	2	8	248477	248484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021026	ATTA	2	8	248493	248500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021026	CTT	2	6	248556	248561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021026	TCA	2	6	248625	248630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_021026	GA	4	8	248718	248725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021026	ATTT	2	8	251233	251240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021026	GGA	2	6	251340	251345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021026	T	6	6	251346	251351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021026	TCT	2	6	251355	251360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_021026	A	6	6	251407	251412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021026	GGA	2	6	251554	251559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021026	ACCT	2	8	251603	251610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_021026	GGA	2	6	251635	251640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021026	TAC	2	6	251792	251797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021026	TC	3	6	251834	251839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_021026	TCG	2	6	251969	251974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021026	TGC	2	6	252017	252022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021026	TTTA	2	8	252036	252043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021026	GA	3	6	252086	252091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021026	TGAT	2	8	252109	252116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021026	CAG	2	6	252186	252191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021026	GA	3	6	252203	252208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021026	T	6	6	252653	252658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021026	TAT	2	6	252686	252691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021026	TAAA	2	8	252700	252707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021026	CCT	2	6	252710	252715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_021026	TTTA	2	8	252719	252726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021026	CTTTT	2	10	252740	252749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_021026	ATA	2	6	252752	252757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021026	T	6	6	252789	252794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021026	AAT	2	6	252829	252834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021026	T	6	6	252888	252893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021026	GAA	2	6	252972	252977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021026	ACT	2	6	252983	252988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021026	TAA	2	6	252990	252995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021026	TAG	2	6	253010	253015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021026	TCTTAA	2	12	253105	253116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1099	NC_021026	GAA	2	6	253138	253143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021026	ATA	2	6	253179	253184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021026	T	6	6	253260	253265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021026	GAA	2	6	253305	253310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021026	GAT	2	6	253333	253338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021026	CAT	2	6	253357	253362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021026	CCT	2	6	253374	253379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_021026	T	6	6	253457	253462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021026	T	6	6	253476	253481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021026	ATA	2	6	253485	253490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021026	ATG	2	6	254532	254537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021026	ATC	2	6	254550	254555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021026	GCA	2	6	254586	254591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021026	TTA	2	6	254703	254708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021026	AGTA	2	8	254826	254833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021026	TGAA	2	8	254866	254873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021026	GGA	2	6	254909	254914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021026	CTC	2	6	254941	254946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_021026	AAG	2	6	255089	255094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021026	CTTAA	2	10	255097	255106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1119	NC_021026	ATA	2	6	255124	255129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021026	GGC	2	6	255161	255166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021026	T	7	7	255170	255176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021026	AATA	2	8	255200	255207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021026	AGA	2	6	255218	255223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021026	GGA	2	6	256858	256863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021026	AGA	2	6	260007	260012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021026	A	6	6	260022	260027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021026	T	6	6	260048	260053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021026	CTGA	2	8	261483	261490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_021026	GAAA	2	8	261566	261573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021026	TA	3	6	261578	261583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021026	TA	3	6	261659	261664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021026	A	6	6	263479	263484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021026	AAT	2	6	263548	263553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021026	A	6	6	264645	264650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021026	ACA	2	6	264671	264676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021026	AGG	2	6	264731	264736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021026	CAAT	2	8	268617	268624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1179	NC_021026	A	6	6	284647	284652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_021026	TTG	2	6	306169	306174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_021026	CAAA	2	8	306243	306250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1264	NC_021026	AAG	2	6	306255	306260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_021026	TTA	2	6	306300	306305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_021026	GAA	2	6	306330	306335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_021026	GAAG	2	8	306365	306372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_021026	ACG	2	6	306723	306728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1274	NC_021026	GATT	2	8	306914	306921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_021026	CTTC	2	8	336123	336130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1414	NC_021026	GAT	2	6	336171	336176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021026	AGT	2	6	336177	336182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_021026	AGC	2	6	336197	336202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_021026	TGA	2	6	336214	336219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_021026	TCG	2	6	336357	336362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_021026	A	6	6	336389	336394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_021026	TTA	2	6	336407	336412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_021026	AAG	2	6	336431	336436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_021026	GAT	2	6	336442	336447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1426	NC_021026	TTGA	2	8	336546	336553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_021026	GCAT	2	8	336559	336566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1431	NC_021026	AG	3	6	336775	336780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_021026	T	6	6	336788	336793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_021026	AT	3	6	336854	336859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_021026	A	6	6	336900	336905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_021026	AATT	2	8	336952	336959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_021026	GA	3	6	337664	337669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_021026	A	6	6	337695	337700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_021026	TGG	2	6	338121	338126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_021026	GTT	2	6	338403	338408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_021026	A	6	6	338444	338449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_021026	ATT	2	6	339155	339160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1459	NC_021026	TAA	2	6	339201	339206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1462	NC_021026	TAG	2	6	341692	341697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1475	NC_021026	TTC	2	6	344495	344500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1486	NC_021026	T	6	6	345888	345893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_021026	AGGA	2	8	345924	345931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_021026	TTCT	2	8	358269	358276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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