MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021026	GTTT	2	8	124337	124344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021026	TGTA	2	8	124373	124380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021026	T	6	6	125290	125295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021026	A	6	6	125303	125308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021026	CCT	2	6	126513	126518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_021026	TTAG	2	8	126521	126528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021026	TAG	2	6	126544	126549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021026	CCT	2	6	128385	128390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_021026	TA	4	8	128411	128418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021026	ACAT	2	8	128429	128436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_021026	AAAG	2	8	128447	128454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021026	TA	4	8	128483	128490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021026	A	6	6	128490	128495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021026	ATA	2	6	129684	129689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021026	TAA	2	6	129707	129712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021026	AGG	2	6	130923	130928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021026	AAC	2	6	132818	132823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021026	TAT	2	6	132841	132846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021026	TCCA	2	8	132974	132981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_021026	AGC	2	6	133048	133053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021026	TCT	2	6	133108	133113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021026	TAT	2	6	135376	135381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021026	GGCTT	2	10	135396	135405	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
524	NC_021026	A	6	6	135467	135472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021026	A	6	6	135491	135496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021026	AGAA	2	8	135565	135572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021026	ATA	2	6	136190	136195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021026	A	6	6	137109	137114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021026	ATA	2	6	137123	137128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021026	A	6	6	137170	137175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021026	AAAT	2	8	137184	137191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021026	A	6	6	137197	137202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021026	TAA	2	6	137227	137232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021026	ATG	2	6	137238	137243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021026	A	7	7	137280	137286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021026	GTAT	2	8	137301	137308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021026	GTT	2	6	137376	137381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021026	AGG	2	6	137384	137389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021026	CTG	2	6	137410	137415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021026	TAC	2	6	137416	137421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021026	ACT	2	6	137482	137487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021026	CGA	2	6	141672	141677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_021026	TAA	2	6	141709	141714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021026	A	6	6	142392	142397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021026	TA	3	6	142435	142440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021026	ATA	2	6	142471	142476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021026	T	6	6	142499	142504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021026	TTC	2	6	142509	142514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021026	TGAA	2	8	142521	142528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021026	GA	3	6	142532	142537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021026	TTTA	2	8	142542	142549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021026	AAGC	2	8	142627	142634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_021026	AT	3	6	142675	142680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021026	TGG	2	6	142681	142686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021026	AAT	2	6	142932	142937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021026	GAA	2	6	142966	142971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021026	GCTTT	2	10	142999	143008	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
558	NC_021026	TATTG	2	10	143036	143045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021026	ATA	2	6	143061	143066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021026	TGA	2	6	144259	144264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021026	TTAT	2	8	144268	144275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021026	ATAA	2	8	144302	144309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021026	AAT	2	6	144333	144338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021026	TAG	2	6	144341	144346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021026	AGT	2	6	144419	144424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021026	ATT	2	6	144425	144430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021026	TAT	2	6	145448	145453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021026	GTAT	2	8	145477	145484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021026	ATA	2	6	145507	145512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021026	TTTA	2	8	145529	145536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021026	A	8	8	145576	145583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021026	AAT	2	6	145656	145661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021026	TAA	2	6	145785	145790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021026	A	6	6	145789	145794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021026	A	6	6	146203	146208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021026	TTA	2	6	146215	146220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021026	T	8	8	146221	146228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021026	ATC	2	6	146243	146248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_021026	GAA	2	6	146280	146285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021026	A	6	6	146288	146293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021026	ATT	2	6	146298	146303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021026	T	7	7	146317	146323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021026	AGG	2	6	147331	147336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021026	ATC	2	6	148546	148551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021026	TAA	2	6	148554	148559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021026	ATTT	2	8	148699	148706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021026	AT	4	8	148735	148742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021026	GCT	2	6	148751	148756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_021026	TTCTA	2	10	149446	149455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_021026	GTT	2	6	149465	149470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021026	T	6	6	149697	149702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021026	GTT	2	6	149703	149708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021026	A	6	6	149719	149724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_021026	ATG	2	6	149767	149772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021026	AGT	2	6	149805	149810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_021026	A	6	6	149937	149942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021026	ATTAA	2	10	152274	152283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021026	A	7	7	152397	152403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021026	GTT	2	6	152447	152452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021026	TTAT	2	8	152453	152460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021026	TGAA	2	8	152471	152478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021026	AAG	3	9	152482	152490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021026	CAT	2	6	152500	152505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021026	A	6	6	152537	152542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021026	TCT	2	6	152564	152569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021026	CA	3	6	152622	152627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_021026	AAT	2	6	153818	153823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021026	ATG	2	6	153837	153842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021026	T	6	6	153868	153873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021026	CTT	2	6	153882	153887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021026	GA	3	6	154388	154393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021026	CGT	2	6	156313	156318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021026	CTT	2	6	156322	156327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021026	AAAG	2	8	156455	156462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021026	TTG	2	6	156497	156502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021026	AT	3	6	156604	156609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021026	ATT	2	6	158660	158665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021026	TAT	2	6	158762	158767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021026	AGG	2	6	158825	158830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021026	TTTGCT	2	12	158850	158861	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
627	NC_021026	TTGC	2	8	158896	158903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
628	NC_021026	GGA	2	6	158910	158915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021026	TCT	2	6	158918	158923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021026	CT	3	6	158980	158985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_021026	TCC	2	6	158998	159003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021026	GTTTG	2	10	159018	159027	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021026	T	6	6	159062	159067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021026	TAG	2	6	159085	159090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021026	GGT	2	6	159130	159135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021026	ACATG	2	10	159151	159160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
637	NC_021026	TTA	2	6	159180	159185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021026	ATAAAA	2	12	159229	159240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021026	TAG	2	6	159274	159279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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