MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021026	C	6	6	1188761	1188766	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5003	NC_021026	TCC	2	6	1188997	1189002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_021026	CT	3	6	1189046	1189051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_021026	CAG	2	6	1189053	1189058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_021026	TA	3	6	1189098	1189103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021026	TA	4	8	1191234	1191241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021026	ATG	2	6	1191271	1191276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021026	ATTATC	2	12	1191334	1191345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5010	NC_021026	TAT	2	6	1191381	1191386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021026	T	6	6	1191414	1191419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021026	TAC	2	6	1191441	1191446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021026	CAC	2	6	1191453	1191458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_021026	TATC	2	8	1191474	1191481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_021026	TTC	2	6	1191490	1191495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_021026	T	6	6	1191509	1191514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021026	ATC	2	6	1191532	1191537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021026	TAG	2	6	1191579	1191584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021026	AT	3	6	1191593	1191598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021026	ATTA	2	8	1191688	1191695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021026	GTT	2	6	1191707	1191712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021026	TAA	2	6	1191736	1191741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021026	ATTT	2	8	1191780	1191787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021026	ACA	2	6	1191806	1191811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021026	TGA	2	6	1191835	1191840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021026	TTA	2	6	1191854	1191859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5029	NC_021026	ATTG	2	8	1191954	1191961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021026	AAAG	2	8	1192014	1192021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021026	TAA	2	6	1192029	1192034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021026	CATG	2	8	1192074	1192081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_021026	T	6	6	1192093	1192098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021026	T	7	7	1192201	1192207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5036	NC_021026	ATACC	2	10	1192295	1192304	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5039	NC_021026	TAT	2	6	1192408	1192413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5042	NC_021026	CAA	2	6	1192557	1192562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021026	ATT	2	6	1192579	1192584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021026	AAG	2	6	1192631	1192636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021026	CATT	2	8	1192685	1192692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5055	NC_021026	TCTT	2	8	1192892	1192899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5062	NC_021026	AT	3	6	1193059	1193064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021026	AT	3	6	1193096	1193101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_021026	TA	3	6	1203444	1203449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5113	NC_021026	TAG	2	6	1207915	1207920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_021026	T	6	6	1222998	1223003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021026	CTT	2	6	1223007	1223012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021026	A	6	6	1223015	1223020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5128	NC_021026	TGTC	2	8	1223197	1223204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_021026	GTA	2	6	1223221	1223226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_021026	GAA	2	6	1223237	1223242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021026	GAATT	2	10	1223597	1223606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021026	CAAG	2	8	1223610	1223617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_021026	ACCA	2	8	1223620	1223627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5135	NC_021026	T	6	6	1223635	1223640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_021026	TAA	2	6	1223667	1223672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_021026	AGCAAG	2	12	1223687	1223698	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5138	NC_021026	AGG	2	6	1223700	1223705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_021026	GA	4	8	1223745	1223752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_021026	TAAA	2	8	1223802	1223809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_021026	AAT	2	6	1223899	1223904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_021026	ATC	2	6	1223955	1223960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5144	NC_021026	AGGC	2	8	1224131	1224138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5145	NC_021026	AG	3	6	1224169	1224174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_021026	A	8	8	1224179	1224186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_021026	GGA	2	6	1224200	1224205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_021026	ATC	2	6	1224254	1224259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5149	NC_021026	AAGG	2	8	1224267	1224274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_021026	GGT	2	6	1224330	1224335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_021026	TC	3	6	1224379	1224384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5152	NC_021026	TGC	2	6	1224387	1224392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_021026	T	6	6	1224400	1224405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_021026	AGGA	2	8	1224448	1224455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_021026	CTT	2	6	1224457	1224462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_021026	AG	3	6	1224483	1224488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_021026	CAA	2	6	1224603	1224608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5159	NC_021026	AGA	2	6	1224633	1224638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5161	NC_021026	A	6	6	1224684	1224689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_021026	ATA	2	6	1224768	1224773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_021026	GACA	2	8	1224889	1224896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5165	NC_021026	AAG	2	6	1224993	1224998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_021026	AATG	2	8	1225068	1225075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_021026	A	6	6	1225087	1225092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_021026	A	6	6	1225113	1225118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_021026	T	7	7	1225153	1225159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_021026	GCTT	2	8	1225172	1225179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5180	NC_021026	T	7	7	1231051	1231057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5185	NC_021026	TAGAA	2	10	1231520	1231529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5215	NC_021026	A	7	7	1240358	1240364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_021026	TA	3	6	1248834	1248839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5243	NC_021026	GTCC	2	8	1252188	1252195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5244	NC_021026	GATGGT	2	12	1252199	1252210	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5254	NC_021026	TCC	2	6	1255877	1255882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5261	NC_021026	AGA	2	6	1257137	1257142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_021026	TATTT	2	10	1257230	1257239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_021026	TTC	2	6	1257254	1257259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_021026	TAT	2	6	1257334	1257339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_021026	ACT	2	6	1257360	1257365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5267	NC_021026	TGAC	2	8	1257458	1257465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5272	NC_021026	TA	3	6	1257661	1257666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5359	NC_021026	CT	3	6	1265305	1265310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5392	NC_021026	TAA	2	6	1268505	1268510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5394	NC_021026	A	6	6	1268586	1268591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_021026	TTA	2	6	1268603	1268608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_021026	TTTA	2	8	1268638	1268645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_021026	AGAA	2	8	1268673	1268680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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