MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 8575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021026	CTTT	2	8	1073983	1073990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_021026	ATT	2	6	1076190	1076195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_021026	AGC	2	6	1076204	1076209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_021026	CTA	2	6	1076226	1076231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_021026	CATAA	2	10	1076235	1076244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4506	NC_021026	AAT	2	6	1076317	1076322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_021026	ATC	2	6	1077340	1077345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_021026	CAA	2	6	1077379	1077384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_021026	AAAC	2	8	1077403	1077410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_021026	TTTTTG	2	12	1077418	1077429	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_021026	TGT	2	6	1077438	1077443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_021026	ATG	2	6	1077456	1077461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_021026	GTTT	2	8	1077463	1077470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021026	TAG	3	9	1077480	1077488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021026	AAC	2	6	1078287	1078292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_021026	AGA	2	6	1078301	1078306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_021026	A	7	7	1078306	1078312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_021026	T	6	6	1078371	1078376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_021026	T	6	6	1078529	1078534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_021026	TTG	2	6	1078551	1078556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_021026	TTC	2	6	1078596	1078601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_021026	TTC	2	6	1078635	1078640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_021026	ATC	3	9	1078644	1078652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_021026	TTC	2	6	1078710	1078715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_021026	TATAA	2	10	1078755	1078764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_021026	TAAA	2	8	1080274	1080281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_021026	GAGAG	2	10	1080290	1080299	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_021026	CTT	2	6	1080329	1080334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_021026	GAG	2	6	1080360	1080365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_021026	CGA	2	6	1080387	1080392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_021026	TAA	2	6	1080395	1080400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_021026	TA	3	6	1082489	1082494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_021026	TAAA	2	8	1082499	1082506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021026	CCT	2	6	1083352	1083357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_021026	A	6	6	1083384	1083389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021026	AAGT	2	8	1083499	1083506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021026	TACA	2	8	1083522	1083529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_021026	T	7	7	1083532	1083538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021026	T	7	7	1083542	1083548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021026	AGG	2	6	1083568	1083573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021026	T	6	6	1086492	1086497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4543	NC_021026	A	6	6	1086533	1086538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_021026	ATA	2	6	1086561	1086566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021026	TAC	2	6	1086567	1086572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4547	NC_021026	GTTTGT	2	12	1086594	1086605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021026	TTAT	2	8	1086611	1086618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021026	T	6	6	1086618	1086623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_021026	T	6	6	1086626	1086631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021026	TTC	2	6	1086657	1086662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_021026	TTC	2	6	1086691	1086696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_021026	TCT	2	6	1086700	1086705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_021026	CTT	2	6	1086716	1086721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4556	NC_021026	TCT	2	6	1087012	1087017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_021026	ATA	2	6	1087032	1087037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021026	TCA	3	9	1087051	1087059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_021026	AGA	2	6	1087063	1087068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4561	NC_021026	TTA	2	6	1087123	1087128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_021026	TGAT	2	8	1087159	1087166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_021026	ATTC	2	8	1087182	1087189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_021026	GAT	2	6	1087208	1087213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021026	GTT	2	6	1087222	1087227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4567	NC_021026	AT	3	6	1087368	1087373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021026	AAC	2	6	1087447	1087452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4570	NC_021026	GATT	2	8	1087584	1087591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_021026	ATCA	2	8	1087606	1087613	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_021026	GAG	2	6	1087635	1087640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_021026	A	6	6	1089104	1089109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_021026	TA	3	6	1089144	1089149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021026	TATT	2	8	1091033	1091040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4602	NC_021026	TCC	2	6	1097897	1097902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_021026	CGT	2	6	1097914	1097919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4605	NC_021026	TCA	2	6	1097954	1097959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_021026	A	6	6	1097962	1097967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4608	NC_021026	TA	3	6	1098413	1098418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_021026	ATT	2	6	1098420	1098425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4611	NC_021026	CTA	2	6	1098477	1098482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_021026	TATC	2	8	1098511	1098518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_021026	CATG	2	8	1100742	1100749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_021026	TCT	2	6	1100789	1100794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_021026	T	6	6	1100806	1100811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_021026	TCAA	2	8	1100832	1100839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_021026	TTTGG	2	10	1100875	1100884	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4621	NC_021026	TAA	2	6	1101301	1101306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4624	NC_021026	ATT	2	6	1101420	1101425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021026	GA	3	6	1101493	1101498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021026	TCAA	2	8	1101621	1101628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4627	NC_021026	GCT	2	6	1101654	1101659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4629	NC_021026	GTT	2	6	1101693	1101698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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