MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 1242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021006	AATG	2	8	3605	3612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021006	AGAT	2	8	10432	10439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021006	ATGG	2	8	11466	11473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021006	TGAT	2	8	13309	13316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021006	TGAA	2	8	13829	13836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021006	TAAA	2	8	13857	13864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021006	ATCA	2	8	14188	14195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021006	TGGT	2	8	14259	14266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021006	CTAA	2	8	18396	18403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021006	ATGA	2	8	18469	18476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021006	AAAG	2	8	18535	18542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021006	AAGC	2	8	18880	18887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021006	AAAG	2	8	19849	19856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021006	TAAG	2	8	19864	19871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021006	AGGG	2	8	19883	19890	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021006	TTAA	2	8	20019	20026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021006	TTCT	2	8	20604	20611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021006	GGAA	2	8	20781	20788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021006	TTTG	2	8	20982	20989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021006	AAGA	2	8	21003	21010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021006	AGTA	2	8	21456	21463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021006	GTAT	2	8	21668	21675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021006	ATGA	2	8	21805	21812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021006	AGTA	2	8	22168	22175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021006	TGAA	2	8	26207	26214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021006	AGGA	2	8	31721	31728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021006	GATT	2	8	33782	33789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021006	AACA	2	8	34626	34633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021006	CTTT	2	8	35108	35115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021006	TTAT	2	8	35171	35178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021006	TATT	2	8	35179	35186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021006	TAAT	2	8	48479	48486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021006	AAAG	2	8	48866	48873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021006	GATG	2	8	54419	54426	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021006	AAGA	2	8	54504	54511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021006	AGAC	2	8	54598	54605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021006	ATGA	2	8	56198	56205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021006	AACA	2	8	56270	56277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021006	ATTT	2	8	56327	56334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021006	ATGG	2	8	56792	56799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021006	TTGG	2	8	56903	56910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021006	AAAG	2	8	57469	57476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021006	GAAA	2	8	57477	57484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021006	ACTT	2	8	57585	57592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021006	ACAA	2	8	57650	57657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021006	AGTC	2	8	58153	58160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021006	AAAG	2	8	61178	61185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021006	GAAA	2	8	64233	64240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021006	TAAA	2	8	65366	65373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021006	CTTT	2	8	70371	70378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021006	TCAA	2	8	74939	74946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021006	TCTG	2	8	75424	75431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021006	GTAT	2	8	75440	75447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021006	ATGA	2	8	80238	80245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021006	TGAT	2	8	80572	80579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021006	AATC	2	8	80594	80601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021006	GAAT	2	8	80996	81003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021006	TATT	2	8	89070	89077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021006	CTTT	2	8	92872	92879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021006	TTCT	2	8	93862	93869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021006	TTAT	2	8	94534	94541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021006	AAAT	2	8	94558	94565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021006	TTTG	2	8	94639	94646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021006	CTAT	2	8	94661	94668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021006	AGAA	2	8	94741	94748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021006	GGGA	2	8	94781	94788	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021006	CTTT	2	8	94933	94940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021006	TCTA	2	8	95136	95143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021006	GAAA	2	8	97108	97115	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021006	AGTT	2	8	97358	97365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021006	CATA	2	8	97378	97385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021006	TAAA	2	8	98530	98537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021006	AGAT	2	8	98566	98573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021006	TTGA	2	8	99511	99518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021006	TAAA	2	8	100448	100455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021006	AATT	2	8	100993	101000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021006	TACG	2	8	101045	101052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021006	GTTT	2	8	105344	105351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021006	ATCT	2	8	109724	109731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021006	AGAC	2	8	109742	109749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021006	CATT	2	8	109782	109789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021006	AGAA	2	8	109804	109811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021006	CCAA	2	8	110027	110034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021006	AAAG	2	8	111993	112000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021006	TGAT	2	8	117906	117913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021006	GAAA	2	8	118300	118307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021006	AAAG	2	8	118320	118327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021006	TTGA	2	8	118470	118477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021006	AAAG	2	8	120096	120103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021006	ATTG	2	8	121696	121703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021006	CGTT	2	8	121880	121887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021006	TCTA	2	8	123126	123133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021006	AAGT	2	8	137686	137693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021006	TTAT	2	8	137701	137708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021006	ATTT	2	8	141280	141287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021006	ATAA	2	8	141346	141353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021006	TACT	2	8	141798	141805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021006	TAAA	2	8	142912	142919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021006	ATCT	2	8	143995	144002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021006	CTTC	2	8	145714	145721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021006	TTTA	2	8	146990	146997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021006	CTAA	2	8	150636	150643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021006	ACTA	2	8	154854	154861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021006	ATTG	2	8	154946	154953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021006	TGAT	2	8	155013	155020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021006	ATTA	2	8	155722	155729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021006	TTTA	2	8	155748	155755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021006	AAGA	2	8	158640	158647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021006	TTCT	2	8	160736	160743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021006	CTTT	2	8	161336	161343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021006	AAAC	2	8	164756	164763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021006	GTTT	2	8	164816	164823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021006	TAAA	2	8	167627	167634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021006	TAAA	2	8	169852	169859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021006	AAGT	2	8	170852	170859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021006	TACA	2	8	170875	170882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021006	TTAT	2	8	173964	173971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021006	TGAT	2	8	174512	174519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021006	ATTC	2	8	174535	174542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021006	GATT	2	8	174937	174944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021006	ATCA	2	8	174959	174966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021006	AGTT	2	8	175271	175278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021006	GCAG	2	8	175587	175594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021006	CATA	2	8	176396	176403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021006	TATT	2	8	178386	178393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021006	TATC	2	8	185864	185871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021006	CATG	2	8	188095	188102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021006	TCAA	2	8	188185	188192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021006	TCAA	2	8	188974	188981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021006	AGTA	2	8	193841	193848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021006	ACTT	2	8	195219	195226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021006	ATAG	2	8	200823	200830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021006	TCTA	2	8	200842	200849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021006	TTAC	2	8	202958	202965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021006	AAAG	2	8	210770	210777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021006	ACCT	2	8	223926	223933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021006	AAAG	2	8	224058	224065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021006	AAGG	2	8	228080	228087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021006	CCAT	2	8	230481	230488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021006	ACCA	2	8	230759	230766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021006	GCTC	2	8	231012	231019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021006	TTCT	2	8	236888	236895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021006	ATCA	2	8	236991	236998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021006	AATT	2	8	237084	237091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021006	ATCT	2	8	238334	238341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021006	AATT	2	8	246230	246237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021006	CCGT	2	8	249572	249579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021006	GATT	2	8	249679	249686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021006	AAGG	2	8	249698	249705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021006	TCCG	2	8	249744	249751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021006	TGCC	2	8	252498	252505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021006	TTTA	2	8	254369	254376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021006	TGAT	2	8	266459	266466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021006	ATTT	2	8	271040	271047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021006	TACT	2	8	271229	271236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_021006	TCTT	2	8	271694	271701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_021006	TGAT	2	8	272328	272335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021006	ATTC	2	8	272351	272358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_021006	GATT	2	8	272756	272763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021006	ATCA	2	8	272778	272785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_021006	GATA	2	8	273316	273323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_021006	AAAT	2	8	275666	275673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_021006	CAGA	2	8	294132	294139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_021006	AGTT	2	8	824608	824615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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